Protein–RNA interactions for Protein: P47758

Srprb, Signal recognition particle receptor subunit beta, mousemouse

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Length 269 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrprbP47758 AC153505.1-201ENSMUST00000218819 1071 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
SrprbP47758 5830428M24Rik-204ENSMUST00000223143 1034 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SrprbP47758 Ifnab-201ENSMUST00000071378 1058 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
SrprbP47758 Uqcc1-203ENSMUST00000109632 2313 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
SrprbP47758 Gm38292-201ENSMUST00000192646 3045 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
SrprbP47758 Pcdh15-238ENSMUST00000193739 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
SrprbP47758 Ppp1r18-201ENSMUST00000113814 3131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SrprbP47758 AC125409.1-201ENSMUST00000223213 3370 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
SrprbP47758 Wwp2-204ENSMUST00000212205 2758 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SrprbP47758 Pyurf-201ENSMUST00000053386 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SrprbP47758 Cramp1l-201ENSMUST00000073337 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SrprbP47758 Magi1-203ENSMUST00000093769 4598 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SrprbP47758 Olfr5-202ENSMUST00000209866 2980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SrprbP47758 Cep76-201ENSMUST00000097542 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SrprbP47758 Lcorl-205ENSMUST00000121573 2378 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SrprbP47758 Gm31108-201ENSMUST00000204101 1633 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SrprbP47758 Alms1-ps2-202ENSMUST00000161983 2290 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
SrprbP47758 Med12l-201ENSMUST00000029393 2295 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SrprbP47758 Vars2-201ENSMUST00000043674 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SrprbP47758 Kdm5b-201ENSMUST00000047714 8714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SrprbP47758 Zc3h18-205ENSMUST00000176629 3672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SrprbP47758 4933406M09Rik-201ENSMUST00000162187 1768 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SrprbP47758 Dcc-202ENSMUST00000114943 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SrprbP47758 Xlr4c-204ENSMUST00000114531 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SrprbP47758 Akr1b10-202ENSMUST00000115051 1022 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SrprbP47758 Rpl35a-205ENSMUST00000115079 510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SrprbP47758 Gm13587-201ENSMUST00000152645 366 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
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SrprbP47758 Gm3015-202ENSMUST00000179803 624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SrprbP47758 Dusp13-211ENSMUST00000183943 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
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SrprbP47758 Gng8-202ENSMUST00000205459 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SrprbP47758 C330004P14Rik-201ENSMUST00000218833 628 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SrprbP47758 AC124433.1-201ENSMUST00000224483 1063 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
SrprbP47758 Pbp2-201ENSMUST00000050471 1279 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SrprbP47758 Top3a-204ENSMUST00000120417 2318 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SrprbP47758 Ffar2-201ENSMUST00000053156 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SrprbP47758 Slc45a2-201ENSMUST00000117100 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
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SrprbP47758 Rps6ka1-209ENSMUST00000174481 2228 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
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SrprbP47758 Gm45187-201ENSMUST00000207697 2760 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SrprbP47758 Saxo2-201ENSMUST00000056728 2783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SrprbP47758 Fubp1-209ENSMUST00000198227 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
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SrprbP47758 Slc35e2-202ENSMUST00000105608 6291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SrprbP47758 Zfp710-202ENSMUST00000164056 5871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SrprbP47758 Lnx1-203ENSMUST00000113531 3098 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SrprbP47758 Zfp652-201ENSMUST00000091565 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SrprbP47758 Etv1-211ENSMUST00000162563 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SrprbP47758 Nlrp6-203ENSMUST00000183845 4436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SrprbP47758 Gm42815-201ENSMUST00000198787 1470 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
SrprbP47758 Kif1a-203ENSMUST00000171556 5391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SrprbP47758 Gm13264-201ENSMUST00000138416 2011 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SrprbP47758 4933413J09Rik-202ENSMUST00000059648 3387 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
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SrprbP47758 Kif26b-201ENSMUST00000160789 6216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SrprbP47758 Gm38271-201ENSMUST00000192296 1603 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
SrprbP47758 Sh2d5-201ENSMUST00000105823 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SrprbP47758 Mapkap1-209ENSMUST00000147337 3111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SrprbP47758 Inpp4a-206ENSMUST00000132615 3038 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
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SrprbP47758 Aamdc-213ENSMUST00000154853 883 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
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SrprbP47758 Mok-203ENSMUST00000084974 1132 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SrprbP47758 Gm10702-201ENSMUST00000098929 1268 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
SrprbP47758 Gm5608-201ENSMUST00000210253 2290 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SrprbP47758 Gm5422-201ENSMUST00000050717 2721 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
SrprbP47758 Npl-201ENSMUST00000041874 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SrprbP47758 Gm35040-201ENSMUST00000206829 5094 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
SrprbP47758 Nhlh2-201ENSMUST00000066187 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SrprbP47758 Igfbp5-201ENSMUST00000027377 6006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SrprbP47758 Fopnl-201ENSMUST00000023357 1465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SrprbP47758 Polr3c-201ENSMUST00000029741 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SrprbP47758 Prss57-203ENSMUST00000169684 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SrprbP47758 Nr5a2-202ENSMUST00000168126 3446 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
SrprbP47758 Scn8a-208ENSMUST00000200963 5814 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
SrprbP47758 Ccdc62-201ENSMUST00000094320 3924 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.35
SrprbP47758 Pip5k1a-206ENSMUST00000107236 3618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
SrprbP47758 Ces4a-201ENSMUST00000161289 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
SrprbP47758 Katnal2-208ENSMUST00000137498 1824 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.35
SrprbP47758 Add1-202ENSMUST00000052836 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
SrprbP47758 Adarb1-204ENSMUST00000105406 6662 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
SrprbP47758 Cacna1c-227ENSMUST00000220022 7765 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
SrprbP47758 Ikzf2-202ENSMUST00000187184 2013 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
SrprbP47758 Dpt-201ENSMUST00000027861 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
SrprbP47758 Ormdl2-201ENSMUST00000026409 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
SrprbP47758 St6galnac5-201ENSMUST00000044278 5667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
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