Protein–RNA interactions for Protein: P31313

Hoxc11, Homeobox protein Hox-C11, mousemouse

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Length 304 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc11P31313 Gng8-202ENSMUST00000205459 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Hoxc11P31313 Gm8436-201ENSMUST00000210152 1080 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Hoxc11P31313 Gm5749-201ENSMUST00000210673 1090 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Hoxc11P31313 Gm4065-202ENSMUST00000218911 986 ntTSL 3 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Hoxc11P31313 CT010506.1-201ENSMUST00000223673 349 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Hoxc11P31313 AC122346.3-201ENSMUST00000223983 306 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Hoxc11P31313 Cysrt1-201ENSMUST00000043379 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Hoxc11P31313 Lhfpl5-201ENSMUST00000080780 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Hoxc11P31313 Uba52-201ENSMUST00000081940 541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Hoxc11P31313 Gm10263-201ENSMUST00000085163 300 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Hoxc11P31313 Taar8b-201ENSMUST00000092654 1035 ntAPPRIS P1 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Hoxc11P31313 Atp1a3-205ENSMUST00000196684 3642 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Hoxc11P31313 Cars-201ENSMUST00000010899 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Hoxc11P31313 Gpatch2l-204ENSMUST00000221368 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Hoxc11P31313 Dgkz-203ENSMUST00000111303 4169 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Hoxc11P31313 Pcdh10-203ENSMUST00000171554 7273 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Hoxc11P31313 Gm13561-201ENSMUST00000136879 1826 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Hoxc11P31313 Prrxl1-204ENSMUST00000189022 2985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Hoxc11P31313 Ticrr-201ENSMUST00000035977 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Hoxc11P31313 Zfp109-202ENSMUST00000206362 2932 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Hoxc11P31313 Btbd9-201ENSMUST00000079924 6657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Hoxc11P31313 Bckdk-202ENSMUST00000124533 1792 ntTSL 3 BASIC10.9□□□□□ -0.67
Hoxc11P31313 Fkbp15-204ENSMUST00000107461 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Hoxc11P31313 Kat6b-204ENSMUST00000182405 6977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Hoxc11P31313 Car12-202ENSMUST00000085420 3639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Hoxc11P31313 Pdik1l-203ENSMUST00000105877 4674 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.67
Hoxc11P31313 Gm43760-201ENSMUST00000202120 3015 ntBASIC10.9□□□□□ -0.67
Hoxc11P31313 Olfr1113-202ENSMUST00000215611 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.67
Hoxc11P31313 Gdap2-201ENSMUST00000029459 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Hoxc11P31313 Clic4-201ENSMUST00000037099 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Hoxc11P31313 Dync1i2-201ENSMUST00000081710 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Hoxc11P31313 D930020B18Rik-201ENSMUST00000120642 3335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Hoxc11P31313 Pip4k2c-201ENSMUST00000013970 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Hoxc11P31313 4732490B19Rik-201ENSMUST00000130373 2446 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Hoxc11P31313 Galnt9-202ENSMUST00000165856 1541 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Hoxc11P31313 Gtf2i-202ENSMUST00000082057 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Hoxc11P31313 Gm42463-201ENSMUST00000198041 4886 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Hoxc11P31313 Itgal-202ENSMUST00000117762 5222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Hoxc11P31313 Gm16237-201ENSMUST00000156666 1319 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Hoxc11P31313 Foxh1-201ENSMUST00000037824 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Hoxc11P31313 Clec4a3-201ENSMUST00000088468 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Hoxc11P31313 Cep76-201ENSMUST00000097542 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Hoxc11P31313 Nfx1-201ENSMUST00000030133 4349 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Hoxc11P31313 D930048N14Rik-202ENSMUST00000117859 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Hoxc11P31313 Synpr-201ENSMUST00000070323 2541 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Hoxc11P31313 Fndc8-201ENSMUST00000018988 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Hoxc11P31313 Wars-204ENSMUST00000161154 1824 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Hoxc11P31313 Map4-214ENSMUST00000199498 4055 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Hoxc11P31313 Ets2-201ENSMUST00000023612 3890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Hoxc11P31313 Slc1a2-203ENSMUST00000111212 1957 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Hoxc11P31313 Cacna1g-205ENSMUST00000107786 7984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Hoxc11P31313 Tnip1-206ENSMUST00000108889 2834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Hoxc11P31313 Art2b-202ENSMUST00000209526 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Hoxc11P31313 Gm43375-201ENSMUST00000196705 2480 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Hoxc11P31313 Golga4-201ENSMUST00000084820 7583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Hoxc11P31313 Ighv5-9-201ENSMUST00000103448 418 ntAPPRIS P1 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Hoxc11P31313 Clps-202ENSMUST00000114785 369 ntTSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Hoxc11P31313 Gm11457-203ENSMUST00000146846 676 ntTSL 3 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Hoxc11P31313 Gm17135-201ENSMUST00000167009 564 ntTSL 3 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Hoxc11P31313 Gm20495-201ENSMUST00000173902 235 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Hoxc11P31313 Gm29410-201ENSMUST00000188383 694 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Hoxc11P31313 Gm3619-201ENSMUST00000219947 775 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Hoxc11P31313 CT009527.1-201ENSMUST00000224205 339 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Hoxc11P31313 Gm5468-202ENSMUST00000227851 682 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Hoxc11P31313 Prg2-201ENSMUST00000028467 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Hoxc11P31313 Chmp3-202ENSMUST00000065364 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Hoxc11P31313 Gm2174-201ENSMUST00000079663 402 ntAPPRIS P1 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Hoxc11P31313 Ccl21a-201ENSMUST00000095114 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Hoxc11P31313 Olfr1047-201ENSMUST00000099901 960 ntAPPRIS P1 BASIC10.89□□□□□ -0.67
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Hoxc11P31313 4732491K20Rik-201ENSMUST00000181774 3142 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Hoxc11P31313 Kcnv2-201ENSMUST00000056708 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Hoxc11P31313 Gm44190-201ENSMUST00000205083 1401 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Hoxc11P31313 Gm37969-201ENSMUST00000195777 3409 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Hoxc11P31313 Gja8-201ENSMUST00000062944 6940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Hoxc11P31313 Ndufs1-203ENSMUST00000168099 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Hoxc11P31313 H2-M2-201ENSMUST00000016427 1550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Hoxc11P31313 Snw1-201ENSMUST00000021428 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Hoxc11P31313 Ablim2-206ENSMUST00000114206 3528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Hoxc11P31313 Myo6-204ENSMUST00000113268 7927 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Hoxc11P31313 Atp1a2-201ENSMUST00000085913 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Hoxc11P31313 Ccdc60-202ENSMUST00000086483 2168 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Hoxc11P31313 Hmbox1-205ENSMUST00000176128 2958 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Hoxc11P31313 Tcf4-251ENSMUST00000202474 1810 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Hoxc11P31313 5530401A14Rik-201ENSMUST00000021044 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Hoxc11P31313 Zfp36-201ENSMUST00000051241 2790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Hoxc11P31313 Epha5-205ENSMUST00000113403 4675 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Hoxc11P31313 Jpt2-201ENSMUST00000024981 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Hoxc11P31313 Esr1-201ENSMUST00000067086 4344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Hoxc11P31313 Atl3-202ENSMUST00000170373 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Hoxc11P31313 Gm7841-201ENSMUST00000122108 1629 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Hoxc11P31313 Cc2d1a-201ENSMUST00000040383 3471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Hoxc11P31313 Fcrl1-203ENSMUST00000167200 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Hoxc11P31313 Hcrtr2-203ENSMUST00000184757 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Hoxc11P31313 Gnl2-201ENSMUST00000030684 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Hoxc11P31313 Pik3r1-202ENSMUST00000055518 7113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Hoxc11P31313 CT868720.1-201ENSMUST00000223069 2544 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Hoxc11P31313 Pdxk-201ENSMUST00000041616 5124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Hoxc11P31313 Ahnak2-201ENSMUST00000101010 2821 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Hoxc11P31313 Gabre-201ENSMUST00000064780 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
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