Protein–RNA interactions for Protein: P28828

Ptprm, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, mousemouse

Predictions only

Length 1,452 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprmP28828 2010315B03Rik-202ENSMUST00000177714 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PtprmP28828 Mirt1-202ENSMUST00000180667 1633 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PtprmP28828 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PtprmP28828 Hectd2-208ENSMUST00000169036 3842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PtprmP28828 Birc3-201ENSMUST00000013949 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PtprmP28828 Serpina1b-201ENSMUST00000095450 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PtprmP28828 Dpep2-201ENSMUST00000034373 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PtprmP28828 Gm38034-201ENSMUST00000193915 2069 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
PtprmP28828 Wdr89-201ENSMUST00000062370 2979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PtprmP28828 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PtprmP28828 4930447F24Rik-201ENSMUST00000194140 1341 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PtprmP28828 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PtprmP28828 Gm13990-201ENSMUST00000151391 2701 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PtprmP28828 Gm43972-201ENSMUST00000181398 1467 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
PtprmP28828 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PtprmP28828 Tmem254c-201ENSMUST00000100818 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PtprmP28828 Eif4a-ps4-201ENSMUST00000122226 1218 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
PtprmP28828 Ppp1r11-203ENSMUST00000174711 520 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PtprmP28828 Gm24180-201ENSMUST00000179961 110 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
PtprmP28828 Gm30652-201ENSMUST00000199103 430 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
PtprmP28828 AC153379.1-201ENSMUST00000218174 485 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PtprmP28828 Gm8557-201ENSMUST00000220777 475 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
PtprmP28828 Mip-201ENSMUST00000026455 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PtprmP28828 Olfr1349-201ENSMUST00000051982 1054 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PtprmP28828 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PtprmP28828 1700001L05Rik-201ENSMUST00000100370 2270 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PtprmP28828 A1cf-204ENSMUST00000224564 1432 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
PtprmP28828 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PtprmP28828 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PtprmP28828 Kcnk2-209ENSMUST00000194402 1373 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PtprmP28828 Hsh2d-201ENSMUST00000072097 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PtprmP28828 Zfp772-201ENSMUST00000074455 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PtprmP28828 Cnga4-202ENSMUST00000210344 1977 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PtprmP28828 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PtprmP28828 Gm7001-201ENSMUST00000219384 1465 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
PtprmP28828 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PtprmP28828 Eef1b2-204ENSMUST00000129339 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PtprmP28828 Tmem206-201ENSMUST00000027940 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PtprmP28828 Ptpn2-203ENSMUST00000122412 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PtprmP28828 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PtprmP28828 Rps6-201ENSMUST00000102814 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PtprmP28828 Cfap100-202ENSMUST00000127508 417 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PtprmP28828 Gm16755-201ENSMUST00000180595 933 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PtprmP28828 Gm28065-201ENSMUST00000185290 833 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PtprmP28828 Gm28381-201ENSMUST00000188403 193 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
PtprmP28828 Platr10-202ENSMUST00000191479 818 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
PtprmP28828 Plin2-201ENSMUST00000000466 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PtprmP28828 Taf1c-201ENSMUST00000093099 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PtprmP28828 Cbl-206ENSMUST00000206147 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PtprmP28828 Ildr1-201ENSMUST00000023617 3042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PtprmP28828 Pigh-203ENSMUST00000217998 2868 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PtprmP28828 Ppp1r18-202ENSMUST00000122899 2743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PtprmP28828 Tut1-201ENSMUST00000096239 2747 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PtprmP28828 Pgm3-201ENSMUST00000070064 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PtprmP28828 Trpm4-209ENSMUST00000211743 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PtprmP28828 Cyb5rl-201ENSMUST00000030364 2360 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PtprmP28828 Fcer2a-201ENSMUST00000005678 2242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PtprmP28828 Rab31-201ENSMUST00000070673 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PtprmP28828 5330411J11Rik-201ENSMUST00000137162 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PtprmP28828 1700047I17Rik2-201ENSMUST00000177978 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PtprmP28828 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PtprmP28828 Slc4a2-202ENSMUST00000115047 4264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PtprmP28828 1700030J22Rik-201ENSMUST00000070577 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PtprmP28828 B4galnt2-201ENSMUST00000038343 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PtprmP28828 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PtprmP28828 Paupar-201ENSMUST00000194826 3482 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
PtprmP28828 Gm12481-201ENSMUST00000102482 297 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
PtprmP28828 Slc25a21-202ENSMUST00000110680 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PtprmP28828 Gm14676-201ENSMUST00000117722 858 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
PtprmP28828 Gm5400-201ENSMUST00000118494 943 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
PtprmP28828 Gm15888-201ENSMUST00000154016 538 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PtprmP28828 Arpp19-207ENSMUST00000169188 216 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PtprmP28828 D330041H03Rik-202ENSMUST00000180390 411 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PtprmP28828 Gm28893-201ENSMUST00000190951 1108 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PtprmP28828 Ighv1-33-201ENSMUST00000193220 350 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
PtprmP28828 BX649293.1-201ENSMUST00000227437 631 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
PtprmP28828 AC158519.1-201ENSMUST00000228615 179 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
PtprmP28828 3110009E18Rik-201ENSMUST00000027637 1007 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PtprmP28828 Cenph-201ENSMUST00000075550 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PtprmP28828 B930036N10Rik-202ENSMUST00000181170 3544 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
PtprmP28828 Olfr56-202ENSMUST00000102785 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PtprmP28828 Olfr56-203ENSMUST00000179282 1935 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PtprmP28828 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PtprmP28828 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PtprmP28828 Fastkd3-201ENSMUST00000051784 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PtprmP28828 Gm12904-201ENSMUST00000117451 1399 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
PtprmP28828 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PtprmP28828 Armc5-201ENSMUST00000044660 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PtprmP28828 Gm42913-201ENSMUST00000197936 1853 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
PtprmP28828 Dnali1-201ENSMUST00000036383 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PtprmP28828 Fam222b-201ENSMUST00000073705 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PtprmP28828 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PtprmP28828 Lef1-204ENSMUST00000106341 3357 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PtprmP28828 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PtprmP28828 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PtprmP28828 Plscr1-201ENSMUST00000093801 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PtprmP28828 Tle1-201ENSMUST00000030095 2569 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PtprmP28828 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PtprmP28828 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PtprmP28828 4932438H23Rik-201ENSMUST00000035689 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.1 ms