Protein–RNA interactions for Protein: P27659

Rpl3, 60S ribosomal protein L3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 403 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl3P27659 Gm23251-201ENSMUST00000103773 110 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Rpl3P27659 Ncmap-202ENSMUST00000105857 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rpl3P27659 Tmem50a-202ENSMUST00000105863 719 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rpl3P27659 Sectm1a-204ENSMUST00000106120 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rpl3P27659 Gm15615-201ENSMUST00000118876 198 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Rpl3P27659 Cryge-202ENSMUST00000161960 690 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rpl3P27659 Gstt3-203ENSMUST00000173537 687 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rpl3P27659 Gm23694-201ENSMUST00000179335 110 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Rpl3P27659 Gm27184-201ENSMUST00000185095 607 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rpl3P27659 1700088E04Rik-211ENSMUST00000190730 691 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rpl3P27659 Gm8615-202ENSMUST00000201946 737 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rpl3P27659 Saa-ps-201ENSMUST00000211148 320 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Rpl3P27659 Gm40639-201ENSMUST00000214642 625 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rpl3P27659 AC164105.2-201ENSMUST00000215484 524 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rpl3P27659 Rpl34-202ENSMUST00000079085 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rpl3P27659 Gm25125-201ENSMUST00000083340 136 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Rpl3P27659 Ccl21a-201ENSMUST00000095114 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rpl3P27659 Olfr584-201ENSMUST00000098210 964 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Rpl3P27659 Pak6-201ENSMUST00000099557 4411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rpl3P27659 Dcaf8-202ENSMUST00000191689 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rpl3P27659 Srrt-201ENSMUST00000040873 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rpl3P27659 Psd3-213ENSMUST00000212505 3253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rpl3P27659 AC154314.2-201ENSMUST00000223677 3502 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Rpl3P27659 Zmynd11-206ENSMUST00000110637 3770 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rpl3P27659 Nxpe5-204ENSMUST00000161047 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rpl3P27659 Gm31108-201ENSMUST00000204101 1633 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rpl3P27659 Fam180a-201ENSMUST00000051176 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rpl3P27659 Slc10a3-204ENSMUST00000114147 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rpl3P27659 Fam114a2-201ENSMUST00000020831 2557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rpl3P27659 Add1-202ENSMUST00000052836 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rpl3P27659 C2cd5-201ENSMUST00000087485 4265 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rpl3P27659 Coq8a-201ENSMUST00000027766 4026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rpl3P27659 Zfp384-205ENSMUST00000112424 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rpl3P27659 Gm15674-201ENSMUST00000143266 2438 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rpl3P27659 Neu2-206ENSMUST00000166259 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rpl3P27659 Fastkd5-201ENSMUST00000110262 3015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rpl3P27659 U2af1l4-237ENSMUST00000167042 3007 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rpl3P27659 Dmrtc1b-203ENSMUST00000118842 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rpl3P27659 Reps1-210ENSMUST00000164556 2537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rpl3P27659 L1td1-204ENSMUST00000173659 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rpl3P27659 Acsl6-208ENSMUST00000108899 1662 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rpl3P27659 Arih1-202ENSMUST00000165322 1431 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rpl3P27659 Pcdh12-203ENSMUST00000194012 2702 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rpl3P27659 Pcdhga10-201ENSMUST00000193404 4732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rpl3P27659 Chek1-202ENSMUST00000172702 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rpl3P27659 Rad17-201ENSMUST00000022136 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rpl3P27659 Rps6ka1-209ENSMUST00000174481 2228 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rpl3P27659 Dpep1-201ENSMUST00000019422 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rpl3P27659 Knop1-202ENSMUST00000063607 4884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rpl3P27659 Gm23200-201ENSMUST00000104379 132 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Rpl3P27659 Ppil6-201ENSMUST00000105507 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rpl3P27659 Mrpl55-205ENSMUST00000108787 718 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rpl3P27659 Gm12218-201ENSMUST00000117666 399 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Rpl3P27659 Mrpl40-202ENSMUST00000119273 778 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rpl3P27659 Gm14397-201ENSMUST00000124728 576 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rpl3P27659 Gm4577-201ENSMUST00000135203 716 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rpl3P27659 E130006D01Rik-203ENSMUST00000137398 906 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rpl3P27659 Gm1667-201ENSMUST00000151651 558 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rpl3P27659 Gm9639-201ENSMUST00000172205 678 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rpl3P27659 Tmem267-202ENSMUST00000176171 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rpl3P27659 Hcfc1r1-203ENSMUST00000180140 693 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rpl3P27659 Gm17087-201ENSMUST00000184183 471 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rpl3P27659 Gm37597-201ENSMUST00000191853 382 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Rpl3P27659 Gm43401-201ENSMUST00000198829 394 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rpl3P27659 1700013F07Rik-201ENSMUST00000029485 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rpl3P27659 Prorsd1-201ENSMUST00000039900 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rpl3P27659 Rpl10a-ps2-201ENSMUST00000071184 642 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Rpl3P27659 Olfr1163-201ENSMUST00000099835 1043 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rpl3P27659 Gm38115-201ENSMUST00000194317 2413 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rpl3P27659 Src-204ENSMUST00000109531 3586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rpl3P27659 AC169511.2-201ENSMUST00000226674 2063 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Rpl3P27659 Duxf3-201ENSMUST00000174056 1486 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rpl3P27659 Akap3-201ENSMUST00000095440 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rpl3P27659 AC207128.2-201ENSMUST00000223708 1924 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Rpl3P27659 Rad1-202ENSMUST00000100775 4085 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rpl3P27659 Eno3-202ENSMUST00000108548 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rpl3P27659 Cep97-203ENSMUST00000118500 3389 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rpl3P27659 Slc20a1-201ENSMUST00000028880 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rpl3P27659 AC079680.2-201ENSMUST00000219181 1306 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rpl3P27659 Prdm16-205ENSMUST00000105637 8595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rpl3P27659 Prdm16-201ENSMUST00000030902 8598 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rpl3P27659 Gm46430-201ENSMUST00000220478 1989 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rpl3P27659 Clvs2-204ENSMUST00000161692 4283 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rpl3P27659 Gm18210-201ENSMUST00000209001 1524 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Rpl3P27659 Dclk2-209ENSMUST00000195561 3486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rpl3P27659 Igsf9-201ENSMUST00000052629 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rpl3P27659 Gm38271-201ENSMUST00000192296 1603 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Rpl3P27659 C530044C16Rik-201ENSMUST00000204275 1624 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rpl3P27659 Snx13-202ENSMUST00000163677 3681 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rpl3P27659 Ccdc190-201ENSMUST00000094348 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rpl3P27659 Ybey-201ENSMUST00000049185 4522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rpl3P27659 Gm20755-201ENSMUST00000196893 1827 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rpl3P27659 Katnal2-205ENSMUST00000126153 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rpl3P27659 Zfp941-201ENSMUST00000080651 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rpl3P27659 E130308A19Rik-202ENSMUST00000070150 10856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rpl3P27659 Eif3i-201ENSMUST00000102593 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rpl3P27659 Fam71e1-201ENSMUST00000107927 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rpl3P27659 Gm3415-201ENSMUST00000110595 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rpl3P27659 Gm3409-201ENSMUST00000110597 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rpl3P27659 Gltp-202ENSMUST00000112212 799 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 238.1 ms