Protein–RNA interactions for Protein: P20664

Prim1, DNA primase small subunit, mousemouse

Predictions only

Length 417 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prim1P20664 AC164624.1-201ENSMUST00000219148 1025 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Prim1P20664 AC159002.1-201ENSMUST00000226714 924 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Prim1P20664 Gm10135-201ENSMUST00000043711 252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Prim1P20664 Olfr843-201ENSMUST00000061365 1107 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Prim1P20664 4833422M21Rik-203ENSMUST00000181747 1365 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Prim1P20664 Slc37a4-202ENSMUST00000213268 1353 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Prim1P20664 5033403F01Rik-201ENSMUST00000181376 1678 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Prim1P20664 Treml4-201ENSMUST00000059873 1744 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Prim1P20664 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Prim1P20664 Gm5936-201ENSMUST00000114116 2857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Prim1P20664 Gm5640-201ENSMUST00000114119 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Prim1P20664 DXBay18-201ENSMUST00000080324 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Prim1P20664 Gm14685-201ENSMUST00000088459 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Prim1P20664 Zfp467-204ENSMUST00000114559 3163 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Prim1P20664 Upk3b-201ENSMUST00000062606 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Prim1P20664 Abcd1-201ENSMUST00000002084 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Prim1P20664 Rph3a-201ENSMUST00000079204 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Prim1P20664 Nfatc2-204ENSMUST00000109184 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Prim1P20664 Aars2-201ENSMUST00000024733 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Prim1P20664 Pde4c-201ENSMUST00000034307 3203 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Prim1P20664 Irak2-201ENSMUST00000059286 3196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Prim1P20664 Hgs-201ENSMUST00000026900 2908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Prim1P20664 Amigo3-201ENSMUST00000085060 2543 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Prim1P20664 Ino80c-204ENSMUST00000153360 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Prim1P20664 Stim1-209ENSMUST00000211457 2183 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Prim1P20664 Cnga4-202ENSMUST00000210344 1977 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Prim1P20664 AC167022.1-201ENSMUST00000218647 1458 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Prim1P20664 Sgpp2-201ENSMUST00000036172 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Prim1P20664 Chac2-202ENSMUST00000101394 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Prim1P20664 Rps9-202ENSMUST00000108623 1347 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Prim1P20664 Gm43216-201ENSMUST00000196295 1333 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Prim1P20664 Srd5a3-202ENSMUST00000113506 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Prim1P20664 Yipf6-202ENSMUST00000113811 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Prim1P20664 B4galt4-203ENSMUST00000114710 837 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Prim1P20664 Gm15161-201ENSMUST00000117340 387 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Prim1P20664 Vmn1r-ps92-201ENSMUST00000120775 517 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Prim1P20664 Bloc1s1-205ENSMUST00000153731 613 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Prim1P20664 Gm8582-201ENSMUST00000164061 789 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Prim1P20664 Gstt3-203ENSMUST00000173537 687 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Prim1P20664 Gm37678-201ENSMUST00000192908 1146 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Prim1P20664 Gm43001-201ENSMUST00000198925 603 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Prim1P20664 Gm42964-201ENSMUST00000202965 382 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Prim1P20664 Olfr684-201ENSMUST00000060893 939 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Prim1P20664 Spink12-201ENSMUST00000081271 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Prim1P20664 Aff4-201ENSMUST00000060945 10099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Prim1P20664 Mdga1-201ENSMUST00000073556 7566 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Prim1P20664 Asxl1-201ENSMUST00000109790 6968 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Prim1P20664 Wdr66-202ENSMUST00000121964 4873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Prim1P20664 Cd2bp2-207ENSMUST00000206026 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Prim1P20664 Olfr648-202ENSMUST00000216612 2929 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Prim1P20664 Gm43984-201ENSMUST00000204572 2864 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Prim1P20664 Tmem129-201ENSMUST00000019439 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Prim1P20664 Papss1-205ENSMUST00000199878 2648 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Prim1P20664 BC017643-201ENSMUST00000038709 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Prim1P20664 Itgb4-202ENSMUST00000068981 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Prim1P20664 Eme2-201ENSMUST00000119848 5226 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Prim1P20664 Serpinf2-202ENSMUST00000108437 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Prim1P20664 Cinp-201ENSMUST00000043716 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Prim1P20664 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Prim1P20664 Bcl11a-202ENSMUST00000109514 5989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Prim1P20664 Traf3ip2-201ENSMUST00000019987 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Prim1P20664 Me3-202ENSMUST00000032856 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Prim1P20664 Trim23-201ENSMUST00000022225 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Prim1P20664 Anks1b-224ENSMUST00000182960 3397 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Prim1P20664 Rasgef1b-203ENSMUST00000146396 3339 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Prim1P20664 Psmd10-201ENSMUST00000033805 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Prim1P20664 5830437K03Rik-201ENSMUST00000199219 1379 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
Prim1P20664 Zfp853-203ENSMUST00000212715 3133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Prim1P20664 Gm45416-201ENSMUST00000209713 2201 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
Prim1P20664 Onecut1-201ENSMUST00000056006 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Prim1P20664 Phka2-203ENSMUST00000112377 3947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Prim1P20664 Gm28043-201ENSMUST00000130871 6521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Prim1P20664 Trav13d-1-201ENSMUST00000103588 396 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Prim1P20664 Gm11628-201ENSMUST00000117568 171 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Prim1P20664 Gm9133-201ENSMUST00000118289 540 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Prim1P20664 Gm14270-201ENSMUST00000118388 846 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Prim1P20664 Gm11269-201ENSMUST00000157011 595 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Prim1P20664 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Prim1P20664 AU020206-201ENSMUST00000181224 656 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Prim1P20664 Gm4895-201ENSMUST00000181646 1137 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Prim1P20664 Asb4-202ENSMUST00000183358 1143 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Prim1P20664 Gm28585-201ENSMUST00000187587 442 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Prim1P20664 Gm9116-201ENSMUST00000192400 1018 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Prim1P20664 Gm43596-201ENSMUST00000202818 884 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Prim1P20664 Gm45120-201ENSMUST00000208880 408 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Prim1P20664 Gm19572-201ENSMUST00000214326 338 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Prim1P20664 Gm36074-201ENSMUST00000221383 591 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Prim1P20664 Aoah-202ENSMUST00000221982 919 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Prim1P20664 AC154305.2-201ENSMUST00000225813 901 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Prim1P20664 Ndufb4-201ENSMUST00000023514 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Prim1P20664 Pgap2-201ENSMUST00000033292 1201 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Prim1P20664 Olfr76-201ENSMUST00000087822 1048 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Prim1P20664 Syncrip-210ENSMUST00000174391 6257 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Prim1P20664 Prkcsh-202ENSMUST00000115331 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Prim1P20664 Hipk3-201ENSMUST00000028600 7454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Prim1P20664 Srl-201ENSMUST00000023161 5000 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Prim1P20664 Mybph-201ENSMUST00000038445 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Prim1P20664 Sgk1-204ENSMUST00000120509 3096 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Prim1P20664 Ttc17-203ENSMUST00000111237 4409 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Prim1P20664 Csgalnact1-203ENSMUST00000130214 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.1 ms