Protein–RNA interactions for Protein: P17533

Defa-rs1, Alpha-defensin-related sequence 1, mousemouse

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Length 116 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa-rs1P17533 1600002K03Rik-201ENSMUST00000041882 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Defa-rs1P17533 Olfr1153-201ENSMUST00000052300 957 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Defa-rs1P17533 Prl7b1-201ENSMUST00000080595 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Defa-rs1P17533 Gm10233-201ENSMUST00000089275 628 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Defa-rs1P17533 Sult1a1-201ENSMUST00000106371 1370 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Defa-rs1P17533 Sult1a1-202ENSMUST00000106372 1369 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Defa-rs1P17533 Cntnap4-201ENSMUST00000034225 4848 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Defa-rs1P17533 Tspan1-201ENSMUST00000030465 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Defa-rs1P17533 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Defa-rs1P17533 Maml2-202ENSMUST00000159294 6404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Defa-rs1P17533 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Defa-rs1P17533 Anp32e-204ENSMUST00000168106 2890 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Defa-rs1P17533 Klhl26-201ENSMUST00000066597 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Defa-rs1P17533 Cldn12-201ENSMUST00000060947 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Defa-rs1P17533 Hdac5-204ENSMUST00000107152 3788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Defa-rs1P17533 App-206ENSMUST00000227723 8167 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Defa-rs1P17533 Neu4-201ENSMUST00000050890 4511 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Defa-rs1P17533 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Defa-rs1P17533 S1pr1-201ENSMUST00000055676 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Defa-rs1P17533 Tfr2-204ENSMUST00000196471 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Defa-rs1P17533 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Defa-rs1P17533 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Defa-rs1P17533 4930488N24Rik-201ENSMUST00000188802 1527 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Defa-rs1P17533 Gm20052-201ENSMUST00000200831 1525 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Defa-rs1P17533 Ubap1-201ENSMUST00000072866 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Defa-rs1P17533 Mfsd4b5-202ENSMUST00000073618 2978 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Defa-rs1P17533 Cep128-210ENSMUST00000141429 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Defa-rs1P17533 Gfra1-201ENSMUST00000026076 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Defa-rs1P17533 Ptgfr-201ENSMUST00000029670 6624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Defa-rs1P17533 Slc20a1-202ENSMUST00000110315 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Defa-rs1P17533 Camk1d-201ENSMUST00000044009 6962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Defa-rs1P17533 2700068H02Rik-201ENSMUST00000137882 1872 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Defa-rs1P17533 Tspan32-202ENSMUST00000075172 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Defa-rs1P17533 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Defa-rs1P17533 Helq-201ENSMUST00000044684 3689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Defa-rs1P17533 Epha5-206ENSMUST00000113406 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Defa-rs1P17533 Bmp3-203ENSMUST00000200388 6609 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Defa-rs1P17533 Arhgef10l-202ENSMUST00000069623 4531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Defa-rs1P17533 Itpa-201ENSMUST00000103193 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Defa-rs1P17533 Smap1-202ENSMUST00000129254 1365 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Defa-rs1P17533 Gm26543-201ENSMUST00000180729 2221 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Defa-rs1P17533 Slc22a16-201ENSMUST00000019978 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Defa-rs1P17533 Bpnt1-201ENSMUST00000027916 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Defa-rs1P17533 Bcl2l11-204ENSMUST00000103211 672 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Defa-rs1P17533 Gm14829-201ENSMUST00000121499 1138 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Defa-rs1P17533 Gm15912-201ENSMUST00000128914 578 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Defa-rs1P17533 1700037C06Rik-201ENSMUST00000132824 874 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Defa-rs1P17533 4933416E03Rik-201ENSMUST00000133091 1126 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Defa-rs1P17533 Gm11770-201ENSMUST00000135048 548 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Defa-rs1P17533 1810020O05Rik-201ENSMUST00000162547 1047 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Defa-rs1P17533 4930505M18Rik-201ENSMUST00000175854 1288 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Defa-rs1P17533 Stx5a-219ENSMUST00000177373 995 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Defa-rs1P17533 Vmn2r-ps9-201ENSMUST00000177446 1099 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Defa-rs1P17533 Gm13290-201ENSMUST00000177806 968 ntAPPRIS P1 BASIC10.32□□□□□ -0.76
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Defa-rs1P17533 Gm43037-201ENSMUST00000196808 250 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Defa-rs1P17533 Gm42687-201ENSMUST00000199075 164 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Defa-rs1P17533 Olfr181-203ENSMUST00000205742 1104 ntAPPRIS P1 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Defa-rs1P17533 Gm4265-201ENSMUST00000206701 674 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Defa-rs1P17533 Olfr1315-ps1-201ENSMUST00000207542 1230 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Defa-rs1P17533 Gm31557-201ENSMUST00000213825 973 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Defa-rs1P17533 5830428M24Rik-201ENSMUST00000221805 825 ntTSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Defa-rs1P17533 Rnf181-202ENSMUST00000069595 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
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Defa-rs1P17533 Ctxn2-201ENSMUST00000099452 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Defa-rs1P17533 Cacng5-201ENSMUST00000039071 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Defa-rs1P17533 AC211878.3-201ENSMUST00000222629 2018 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Defa-rs1P17533 Coq3-201ENSMUST00000029909 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Defa-rs1P17533 Tekt3-201ENSMUST00000035732 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Defa-rs1P17533 Jmjd8-205ENSMUST00000133595 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Defa-rs1P17533 Gm37513-201ENSMUST00000194830 2268 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Defa-rs1P17533 Gm38378-201ENSMUST00000195153 2268 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Defa-rs1P17533 Myo16-201ENSMUST00000042103 6725 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Defa-rs1P17533 Ttc30b-201ENSMUST00000099996 2737 ntAPPRIS P1 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Defa-rs1P17533 Rpl22-204ENSMUST00000139685 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Defa-rs1P17533 Gm26599-201ENSMUST00000180590 3189 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Defa-rs1P17533 4930593A02Rik-201ENSMUST00000181694 1437 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Defa-rs1P17533 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Defa-rs1P17533 Robo1-201ENSMUST00000023600 7563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Defa-rs1P17533 Sfxn3-201ENSMUST00000062213 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Defa-rs1P17533 Tgm1-202ENSMUST00000168729 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Defa-rs1P17533 Myh10-203ENSMUST00000102611 7791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Defa-rs1P17533 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Defa-rs1P17533 Specc1-213ENSMUST00000202179 6676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Defa-rs1P17533 Rph3al-201ENSMUST00000021208 1690 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Defa-rs1P17533 Fads1-201ENSMUST00000010807 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Defa-rs1P17533 Grin1-208ENSMUST00000114318 3920 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Defa-rs1P17533 Hnrnpm-206ENSMUST00000148178 3934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Defa-rs1P17533 Drd1-201ENSMUST00000021932 3526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Defa-rs1P17533 Olfr707-203ENSMUST00000210644 1817 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Defa-rs1P17533 AC116503.1-201ENSMUST00000215445 2192 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Defa-rs1P17533 Vmn1r45-201ENSMUST00000054202 3341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Defa-rs1P17533 Gm10419-202ENSMUST00000196693 2530 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Defa-rs1P17533 Cyth3-201ENSMUST00000110727 2068 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Defa-rs1P17533 Gm8914-201ENSMUST00000101396 1035 ntAPPRIS P1 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Defa-rs1P17533 Gm5071-201ENSMUST00000104922 1035 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Defa-rs1P17533 Gm14716-201ENSMUST00000120138 718 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Defa-rs1P17533 Rpa3-201ENSMUST00000012627 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Defa-rs1P17533 Gm11417-201ENSMUST00000150536 920 ntTSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
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