Protein–RNA interactions for Protein: P13372

Vpreb1, Immunoglobulin iota chain, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb1P13372 Strada-202ENSMUST00000103072 1517 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Vpreb1P13372 AC126257.1-201ENSMUST00000213195 1536 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Vpreb1P13372 Cgnl1-201ENSMUST00000072899 6754 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Vpreb1P13372 R3hdm2-205ENSMUST00000105251 3739 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Vpreb1P13372 Lin54-209ENSMUST00000152387 2760 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Vpreb1P13372 Gm43517-201ENSMUST00000110746 3904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Vpreb1P13372 Gm19409-201ENSMUST00000198244 2858 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Vpreb1P13372 Gm14005-209ENSMUST00000224993 1832 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Vpreb1P13372 Nxpe5-203ENSMUST00000159964 3585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Vpreb1P13372 Snd1-206ENSMUST00000167201 3781 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Vpreb1P13372 Atg7-201ENSMUST00000032457 3761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Vpreb1P13372 Gm15446-201ENSMUST00000112544 2417 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Vpreb1P13372 Mx2-202ENSMUST00000188251 2421 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Vpreb1P13372 Isl1-201ENSMUST00000036060 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Vpreb1P13372 Lrguk-202ENSMUST00000101564 967 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Vpreb1P13372 Tnfrsf18-202ENSMUST00000103173 1189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Vpreb1P13372 Fthl17d-201ENSMUST00000105004 856 ntAPPRIS P1 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Vpreb1P13372 Gm11591-201ENSMUST00000120063 702 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Vpreb1P13372 Gm13562-201ENSMUST00000125198 797 ntTSL 2 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Vpreb1P13372 Psma1-203ENSMUST00000135570 960 ntTSL 3 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Vpreb1P13372 Gm16302-201ENSMUST00000159268 428 ntTSL 3 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Vpreb1P13372 Gm16339-201ENSMUST00000160954 929 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Vpreb1P13372 1810008B01Rik-201ENSMUST00000162325 829 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Vpreb1P13372 Tmem52-204ENSMUST00000178188 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Vpreb1P13372 Tmem52-205ENSMUST00000178238 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Vpreb1P13372 Gm35986-201ENSMUST00000197370 655 ntTSL 2 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Vpreb1P13372 Gm44364-201ENSMUST00000198368 141 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Vpreb1P13372 Gm42902-201ENSMUST00000199508 662 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Vpreb1P13372 AC125070.1-201ENSMUST00000223523 555 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Vpreb1P13372 AC133598.1-201ENSMUST00000224327 660 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Vpreb1P13372 Gm807-202ENSMUST00000224929 408 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Vpreb1P13372 4930569F06Rik-201ENSMUST00000036821 433 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Vpreb1P13372 Cldnd2-201ENSMUST00000040227 664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Vpreb1P13372 Gm11559-201ENSMUST00000092694 1096 ntAPPRIS P1 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Vpreb1P13372 1700003D09Rik-201ENSMUST00000141929 1389 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Vpreb1P13372 Gm42853-201ENSMUST00000201273 1387 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Vpreb1P13372 Lrrfip2-214ENSMUST00000217117 1363 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Vpreb1P13372 L1cam-201ENSMUST00000066576 4116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Vpreb1P13372 Rasgrp4-201ENSMUST00000032811 4621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Vpreb1P13372 Btnl7-ps-201ENSMUST00000023469 1763 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Vpreb1P13372 F830115B05Rik-201ENSMUST00000197638 1894 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Vpreb1P13372 Slc25a45-206ENSMUST00000155697 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Vpreb1P13372 Nelfcd-201ENSMUST00000016397 2280 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Vpreb1P13372 Fndc9-201ENSMUST00000060185 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Vpreb1P13372 Mcam-202ENSMUST00000098852 2772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Vpreb1P13372 Slc7a14-202ENSMUST00000108245 3080 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Vpreb1P13372 Rsrc1-201ENSMUST00000046542 3062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Vpreb1P13372 Slc5a9-203ENSMUST00000102721 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Vpreb1P13372 Cntnap2-205ENSMUST00000199100 6279 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Vpreb1P13372 Gm19410-201ENSMUST00000207505 6352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Vpreb1P13372 Myo6-212ENSMUST00000184480 4139 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Vpreb1P13372 Bace1-202ENSMUST00000078111 4041 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Vpreb1P13372 Ric8a-201ENSMUST00000026558 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Vpreb1P13372 Spag6l-201ENSMUST00000023468 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Vpreb1P13372 Ptchd4-201ENSMUST00000048691 6890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Vpreb1P13372 AC164092.1-201ENSMUST00000215635 2232 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Vpreb1P13372 Numb-210ENSMUST00000154043 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Vpreb1P13372 Pmp2-201ENSMUST00000029034 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Vpreb1P13372 Gm20796-201ENSMUST00000180355 5838 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Vpreb1P13372 Pop1-201ENSMUST00000052290 3395 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Vpreb1P13372 Eef2-201ENSMUST00000047864 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Vpreb1P13372 Cd8a-202ENSMUST00000172321 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Vpreb1P13372 Stra6-213ENSMUST00000167479 2871 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Vpreb1P13372 Klf8-201ENSMUST00000039545 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Vpreb1P13372 Zfp940-202ENSMUST00000108223 2560 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Vpreb1P13372 B230317F23Rik-201ENSMUST00000052189 2472 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Vpreb1P13372 Cass4-201ENSMUST00000099061 3731 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Vpreb1P13372 Gm43820-201ENSMUST00000199414 3346 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Vpreb1P13372 Syne1-201ENSMUST00000041639 6990 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Vpreb1P13372 Rad51ap1-202ENSMUST00000112221 1871 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Vpreb1P13372 Stpg2-201ENSMUST00000062306 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Vpreb1P13372 H2-M10.3-201ENSMUST00000073546 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Vpreb1P13372 Tspan32-201ENSMUST00000009396 1582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Vpreb1P13372 H2-T10-201ENSMUST00000166442 1481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Vpreb1P13372 Gm10425-201ENSMUST00000181085 3364 ntTSL 2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Vpreb1P13372 Cdh23-205ENSMUST00000105464 11090 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Vpreb1P13372 Hcfc1-201ENSMUST00000033761 8138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Vpreb1P13372 Abhd1-202ENSMUST00000201125 1352 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Vpreb1P13372 Zbtb45-205ENSMUST00000210282 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Vpreb1P13372 Chd8-201ENSMUST00000089752 8190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Vpreb1P13372 Btk-202ENSMUST00000113213 2121 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Vpreb1P13372 Mymx-201ENSMUST00000113529 442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Vpreb1P13372 Thoc6-204ENSMUST00000115490 1157 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Vpreb1P13372 Gm12241-201ENSMUST00000118330 726 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Vpreb1P13372 Gm12058-201ENSMUST00000118614 437 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Vpreb1P13372 Myadml2os-201ENSMUST00000126642 1044 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Vpreb1P13372 Srrm3os-201ENSMUST00000131896 1271 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Vpreb1P13372 C030047K22Rik-201ENSMUST00000150382 1164 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Vpreb1P13372 Hoxb5os-202ENSMUST00000150698 596 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Vpreb1P13372 Gm7809-201ENSMUST00000153199 742 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Vpreb1P13372 Gm11379-201ENSMUST00000154678 381 ntTSL 3 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Vpreb1P13372 1700069L16Rik-203ENSMUST00000162388 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Vpreb1P13372 Gm3890-201ENSMUST00000182416 207 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Vpreb1P13372 Gm6114-201ENSMUST00000182472 968 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Vpreb1P13372 Tmem108-203ENSMUST00000189066 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Vpreb1P13372 Gm18935-201ENSMUST00000212692 664 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Vpreb1P13372 Gm10608-202ENSMUST00000213924 676 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Vpreb1P13372 Tnfrsf17-201ENSMUST00000023140 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Vpreb1P13372 4930562F07Rik-201ENSMUST00000028061 830 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Vpreb1P13372 Ccs-201ENSMUST00000037246 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.4 ms