Protein–RNA interactions for Protein: P11531

Dmd, Dystrophin, mousemouse

Predictions only

Length 3,678 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DmdP11531 Gm22900-201ENSMUST00000104538 130 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
DmdP11531 Gm13792-201ENSMUST00000121350 423 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
DmdP11531 Gm13393-201ENSMUST00000141935 396 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
DmdP11531 Gm7138-201ENSMUST00000167669 693 ntAPPRIS P1 BASIC10.43□□□□□ -0.74
DmdP11531 Gm24368-201ENSMUST00000175388 106 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
DmdP11531 1700095B10Rik-201ENSMUST00000182349 978 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
DmdP11531 Mir6909-201ENSMUST00000184212 62 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
DmdP11531 BC002189-201ENSMUST00000195674 598 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
DmdP11531 Pcdh7-207ENSMUST00000199310 659 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
DmdP11531 Gm43482-201ENSMUST00000202797 1861 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
DmdP11531 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
DmdP11531 Abcf3-201ENSMUST00000003319 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
DmdP11531 Ndufab1-201ENSMUST00000033157 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
DmdP11531 Ahsg-201ENSMUST00000023583 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
DmdP11531 Pigq-219ENSMUST00000208071 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
DmdP11531 Ciz1-204ENSMUST00000113334 2871 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
DmdP11531 Gm13120-201ENSMUST00000117343 1446 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
DmdP11531 Gm13104-201ENSMUST00000119651 1446 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
DmdP11531 AC125108.1-201ENSMUST00000218986 2330 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
DmdP11531 Gm44975-201ENSMUST00000207435 1390 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
DmdP11531 Cd247-202ENSMUST00000027849 1317 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
DmdP11531 Gm6633-201ENSMUST00000173851 270 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
DmdP11531 A630023A22Rik-201ENSMUST00000178958 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
DmdP11531 Gm27953-201ENSMUST00000185171 143 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
DmdP11531 Gm28462-201ENSMUST00000185217 374 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
DmdP11531 Gm28406-201ENSMUST00000186516 397 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
DmdP11531 Gm28348-201ENSMUST00000187833 397 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
DmdP11531 Gm29404-201ENSMUST00000187914 397 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
DmdP11531 Gm29003-202ENSMUST00000190434 453 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
DmdP11531 Gm28313-201ENSMUST00000191411 397 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
DmdP11531 Gm35670-201ENSMUST00000192493 397 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
DmdP11531 Gm37656-201ENSMUST00000192673 397 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
DmdP11531 Gm37561-201ENSMUST00000195221 368 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
DmdP11531 Olfr139-203ENSMUST00000206280 1059 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
DmdP11531 Gm35412-201ENSMUST00000220437 999 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
DmdP11531 Gzmf-201ENSMUST00000022757 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
DmdP11531 Slc13a2-201ENSMUST00000001122 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
DmdP11531 Sdc1-201ENSMUST00000020911 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
DmdP11531 Saxo2-205ENSMUST00000207693 1927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
DmdP11531 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
DmdP11531 Parvg-201ENSMUST00000023074 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
DmdP11531 Vmn1r45-202ENSMUST00000226167 2893 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
DmdP11531 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
DmdP11531 Aldh3a1-202ENSMUST00000108716 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
DmdP11531 Gm38227-201ENSMUST00000193036 1602 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
DmdP11531 Gm16178-201ENSMUST00000129408 677 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
DmdP11531 Gm13465-201ENSMUST00000129687 979 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
DmdP11531 Mipep-ps-201ENSMUST00000177439 291 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
DmdP11531 Gm10318-201ENSMUST00000186874 930 ntAPPRIS P1 BASIC10.43□□□□□ -0.74
DmdP11531 Gm31597-201ENSMUST00000211176 515 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
DmdP11531 AC116680.1-201ENSMUST00000222804 613 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
DmdP11531 AC141884.2-201ENSMUST00000228811 775 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
DmdP11531 Tex29-201ENSMUST00000033909 822 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
DmdP11531 Tas2r135-201ENSMUST00000070178 1093 ntAPPRIS P1 BASIC10.43□□□□□ -0.74
DmdP11531 4933409D19Rik-201ENSMUST00000193674 1557 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
DmdP11531 Ercc5-201ENSMUST00000027214 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
DmdP11531 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
DmdP11531 Tab1-201ENSMUST00000023050 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
DmdP11531 Gm11231-201ENSMUST00000117895 1706 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
DmdP11531 Tubd1-203ENSMUST00000108030 1964 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
DmdP11531 Tfe3-203ENSMUST00000101695 2989 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
DmdP11531 Rnf6-206ENSMUST00000161859 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
DmdP11531 Gm8848-201ENSMUST00000197270 1343 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
DmdP11531 Itfg2-203ENSMUST00000142615 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
DmdP11531 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
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DmdP11531 Gm9513-201ENSMUST00000165591 306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
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DmdP11531 Gm2316-201ENSMUST00000190613 921 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
DmdP11531 Gm3889-201ENSMUST00000212467 612 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
DmdP11531 Myl10-201ENSMUST00000005611 688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
DmdP11531 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
DmdP11531 Mical1-202ENSMUST00000099934 3292 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
DmdP11531 Plscr1-202ENSMUST00000186364 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
DmdP11531 Fcho1-201ENSMUST00000093444 3073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
DmdP11531 Serpina1b-201ENSMUST00000095450 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
DmdP11531 Esr2-205ENSMUST00000218621 3342 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
DmdP11531 Entpd5-206ENSMUST00000122194 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
DmdP11531 Gm12688-201ENSMUST00000136525 701 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
DmdP11531 Tnni1-208ENSMUST00000154463 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
DmdP11531 Has2os-202ENSMUST00000163314 633 ntTSL 3 BASIC10.42□□□□□ -0.74
DmdP11531 Ndufc1-201ENSMUST00000038108 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
DmdP11531 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC10.42□□□□□ -0.74
DmdP11531 9430015G10Rik-201ENSMUST00000072554 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
DmdP11531 Cyp2d9-201ENSMUST00000089129 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
DmdP11531 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
DmdP11531 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
DmdP11531 Vbp1-201ENSMUST00000033540 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
DmdP11531 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
DmdP11531 Gm19951-201ENSMUST00000222616 1328 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
DmdP11531 Nlrx1-202ENSMUST00000168499 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
DmdP11531 Slc17a8-202ENSMUST00000105295 1863 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
DmdP11531 Foxred1-201ENSMUST00000043805 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
DmdP11531 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
DmdP11531 Adgrv1-214ENSMUST00000224088 1492 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
DmdP11531 1700112J05Rik-201ENSMUST00000129353 793 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
DmdP11531 Gm16263-201ENSMUST00000144680 502 ntTSL 3 BASIC10.42□□□□□ -0.74
DmdP11531 Gm6665-201ENSMUST00000165131 258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
DmdP11531 Gm28262-201ENSMUST00000185463 477 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
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