Protein–RNA interactions for Protein: P04230

H2-Eb1, H-2 class II histocompatibility antigen, E-B beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Eb1P04230 Arc-201ENSMUST00000023268 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
H2-Eb1P04230 Gm15883-201ENSMUST00000153562 1690 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
H2-Eb1P04230 Clrn1-203ENSMUST00000072551 1662 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
H2-Eb1P04230 Crot-201ENSMUST00000003720 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
H2-Eb1P04230 Chdh-202ENSMUST00000118917 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
H2-Eb1P04230 Pou2f1-206ENSMUST00000111429 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
H2-Eb1P04230 Casc1-203ENSMUST00000111728 2682 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
H2-Eb1P04230 Il27ra-201ENSMUST00000005601 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
H2-Eb1P04230 Gm37651-201ENSMUST00000194679 1494 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
H2-Eb1P04230 Ikzf2-202ENSMUST00000187184 2013 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
H2-Eb1P04230 Gm6903-201ENSMUST00000160509 1366 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
H2-Eb1P04230 Timm22-202ENSMUST00000120699 746 ntTSL 3 BASIC11.08□□□□□ -0.64
H2-Eb1P04230 Gm15595-201ENSMUST00000120840 961 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
H2-Eb1P04230 Gm12749-201ENSMUST00000122138 1159 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
H2-Eb1P04230 Tctex1d1-205ENSMUST00000140654 891 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
H2-Eb1P04230 Mcfd2-205ENSMUST00000145895 751 ntTSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
H2-Eb1P04230 Gm24990-201ENSMUST00000157406 323 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
H2-Eb1P04230 1110038B12Rik-208ENSMUST00000174714 520 ntTSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
H2-Eb1P04230 Rpl31-202ENSMUST00000178079 487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
H2-Eb1P04230 Gm27441-201ENSMUST00000185000 105 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
H2-Eb1P04230 Gm40639-201ENSMUST00000214642 625 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
H2-Eb1P04230 Abracl-204ENSMUST00000220110 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
H2-Eb1P04230 Immp1l-201ENSMUST00000037499 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
H2-Eb1P04230 Lrmda-201ENSMUST00000075639 908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
H2-Eb1P04230 Mrpl18-201ENSMUST00000079121 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
H2-Eb1P04230 Cryge-201ENSMUST00000087359 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
H2-Eb1P04230 Anks1b-218ENSMUST00000182595 3715 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
H2-Eb1P04230 Oxct1-201ENSMUST00000110690 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
H2-Eb1P04230 Carns1-201ENSMUST00000167055 3968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
H2-Eb1P04230 Gm10681-202ENSMUST00000178221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
H2-Eb1P04230 Tle6-210ENSMUST00000142948 1961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
H2-Eb1P04230 Ttll5-202ENSMUST00000040273 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
H2-Eb1P04230 Krba1-201ENSMUST00000031815 3685 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
H2-Eb1P04230 Habp2-201ENSMUST00000078284 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
H2-Eb1P04230 Cycs-202ENSMUST00000161401 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
H2-Eb1P04230 Riox2-202ENSMUST00000120667 2200 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
H2-Eb1P04230 Ntm-201ENSMUST00000075069 3022 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
H2-Eb1P04230 Tom1l2-206ENSMUST00000102683 4999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
H2-Eb1P04230 Trim46-203ENSMUST00000107464 3252 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
H2-Eb1P04230 Zfp462-202ENSMUST00000079605 4684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
H2-Eb1P04230 Arpp21-217ENSMUST00000161412 1687 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
H2-Eb1P04230 Fntb-201ENSMUST00000041008 2613 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
H2-Eb1P04230 Gm37031-201ENSMUST00000195487 2530 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
H2-Eb1P04230 Enpp5-201ENSMUST00000024756 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
H2-Eb1P04230 Zfp354a-204ENSMUST00000109122 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
H2-Eb1P04230 Dctn1-203ENSMUST00000113913 4163 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
H2-Eb1P04230 Hsd3b6-201ENSMUST00000029463 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
H2-Eb1P04230 Satb1-204ENSMUST00000133574 3461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
H2-Eb1P04230 Nudt7-203ENSMUST00000109109 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
H2-Eb1P04230 Pla2g4c-201ENSMUST00000043612 3382 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
H2-Eb1P04230 Optc-205ENSMUST00000153617 1615 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
H2-Eb1P04230 Cdc20b-203ENSMUST00000181117 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
H2-Eb1P04230 Gm45165-201ENSMUST00000207763 1631 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
H2-Eb1P04230 Plekhm1-201ENSMUST00000041272 5968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
H2-Eb1P04230 Zfp30-202ENSMUST00000122387 3342 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
H2-Eb1P04230 CT009489.1-201ENSMUST00000227740 1893 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
H2-Eb1P04230 Il1rap-202ENSMUST00000096129 4438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
H2-Eb1P04230 Myh8-201ENSMUST00000019625 6149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
H2-Eb1P04230 Ighg2c-201ENSMUST00000103416 1214 ntAPPRIS P5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
H2-Eb1P04230 Gm13035-201ENSMUST00000117496 342 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
H2-Eb1P04230 Gm12218-201ENSMUST00000117666 399 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
H2-Eb1P04230 Gm13809-201ENSMUST00000117921 597 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
H2-Eb1P04230 Gm14208-201ENSMUST00000119645 678 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
H2-Eb1P04230 Gm12216-202ENSMUST00000120776 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
H2-Eb1P04230 Gm11244-201ENSMUST00000121243 237 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
H2-Eb1P04230 Gm14397-201ENSMUST00000124728 576 ntTSL 3 BASIC11.07□□□□□ -0.64
H2-Eb1P04230 Gm15412-201ENSMUST00000137193 1096 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
H2-Eb1P04230 Gm19246-201ENSMUST00000173599 255 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
H2-Eb1P04230 Gm38114-201ENSMUST00000191877 1232 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
H2-Eb1P04230 Gng8-204ENSMUST00000205716 432 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.07□□□□□ -0.64
H2-Eb1P04230 Gm45909-201ENSMUST00000212413 1031 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
H2-Eb1P04230 Gm34973-201ENSMUST00000217087 572 ntTSL 3 BASIC11.07□□□□□ -0.64
H2-Eb1P04230 9430041J12Rik-201ENSMUST00000050989 534 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
H2-Eb1P04230 Gm25125-201ENSMUST00000083340 136 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
H2-Eb1P04230 Ccdc130-202ENSMUST00000098578 2119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
H2-Eb1P04230 A930024N18Rik-201ENSMUST00000181251 3955 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
H2-Eb1P04230 Ntrk2-207ENSMUST00000225488 4706 ntAPPRIS P1 BASIC11.07□□□□□ -0.64
H2-Eb1P04230 Cit-201ENSMUST00000051704 9514 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
H2-Eb1P04230 Gpr37-202ENSMUST00000200812 3035 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
H2-Eb1P04230 F10-205ENSMUST00000152034 1449 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
H2-Eb1P04230 Arih1-202ENSMUST00000165322 1431 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
H2-Eb1P04230 Sgca-205ENSMUST00000166320 1428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
H2-Eb1P04230 Gm2822-201ENSMUST00000164299 2910 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
H2-Eb1P04230 Gm13652-201ENSMUST00000143898 3412 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
H2-Eb1P04230 Unkl-202ENSMUST00000039734 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
H2-Eb1P04230 Gm45041-201ENSMUST00000207366 3108 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
H2-Eb1P04230 Gpcpd1-204ENSMUST00000110136 3546 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
H2-Eb1P04230 Add2-203ENSMUST00000203279 1454 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
H2-Eb1P04230 Tenm2-201ENSMUST00000057207 8298 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
H2-Eb1P04230 Bsnd-201ENSMUST00000054472 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
H2-Eb1P04230 Zmynd11-203ENSMUST00000110634 3824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
H2-Eb1P04230 Tasp1-203ENSMUST00000110079 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
H2-Eb1P04230 Zfp398-201ENSMUST00000079881 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
H2-Eb1P04230 Rufy2-203ENSMUST00000122231 2664 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
H2-Eb1P04230 Immt-205ENSMUST00000166938 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
H2-Eb1P04230 Cpeb1-209ENSMUST00000178892 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
H2-Eb1P04230 Nrg1-212ENSMUST00000208598 1778 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
H2-Eb1P04230 Impa1-202ENSMUST00000118410 2988 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
H2-Eb1P04230 Xlr4c-201ENSMUST00000068551 1500 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
H2-Eb1P04230 Pdcd10-205ENSMUST00000161137 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.8 ms