Protein–RNA interactions for Protein: J3QNP2

Smim18, Small integral membrane protein 18, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim18J3QNP2 Gm19409-201ENSMUST00000198244 2858 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Smim18J3QNP2 Enpp5-201ENSMUST00000024756 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Smim18J3QNP2 Gm26670-201ENSMUST00000180429 3287 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Smim18J3QNP2 Sept6-202ENSMUST00000060474 3457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Smim18J3QNP2 4930570G19Rik-201ENSMUST00000139363 3112 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Smim18J3QNP2 Orc4-201ENSMUST00000028098 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Smim18J3QNP2 Gm7553-201ENSMUST00000185805 1426 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Smim18J3QNP2 Cyb5rl-202ENSMUST00000106756 1604 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Smim18J3QNP2 Gm4810-201ENSMUST00000177721 1607 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Smim18J3QNP2 Gm42633-201ENSMUST00000198853 2764 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Smim18J3QNP2 Atxn7l1-212ENSMUST00000146040 2973 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Smim18J3QNP2 Nampt-201ENSMUST00000020886 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Smim18J3QNP2 Hapln3-203ENSMUST00000206092 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Smim18J3QNP2 4930451G09Rik-201ENSMUST00000090457 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Smim18J3QNP2 Hemk1-202ENSMUST00000118051 453 ntTSL 3 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Smim18J3QNP2 Gm11941-201ENSMUST00000119904 610 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Smim18J3QNP2 Gm25661-201ENSMUST00000157704 296 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Smim18J3QNP2 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Smim18J3QNP2 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Smim18J3QNP2 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Smim18J3QNP2 Gm6981-201ENSMUST00000182467 1008 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Smim18J3QNP2 Mturn-202ENSMUST00000187701 503 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Smim18J3QNP2 Gpx1-204ENSMUST00000193987 653 ntTSL 3 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Smim18J3QNP2 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Smim18J3QNP2 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Smim18J3QNP2 AC158516.1-201ENSMUST00000213921 205 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Smim18J3QNP2 1700127F24Rik-201ENSMUST00000221685 604 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Smim18J3QNP2 Tatdn3-201ENSMUST00000027945 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Smim18J3QNP2 Tex26-201ENSMUST00000031667 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Smim18J3QNP2 Tm2d3-201ENSMUST00000032726 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Smim18J3QNP2 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Smim18J3QNP2 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Smim18J3QNP2 Myh4-201ENSMUST00000018632 6016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Smim18J3QNP2 Cfi-201ENSMUST00000077918 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Smim18J3QNP2 Nexmif-203ENSMUST00000118314 11476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Smim18J3QNP2 Gm498-202ENSMUST00000152910 1507 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Smim18J3QNP2 Pde2a-202ENSMUST00000166652 3977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Smim18J3QNP2 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Smim18J3QNP2 Rap1gds1-201ENSMUST00000029796 3383 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Smim18J3QNP2 Gm10857-201ENSMUST00000195343 2794 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Smim18J3QNP2 Taf8-201ENSMUST00000067103 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Smim18J3QNP2 Gm9271-201ENSMUST00000185988 2580 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Smim18J3QNP2 Gm26751-201ENSMUST00000181218 4245 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Smim18J3QNP2 Bicd1-203ENSMUST00000111513 4049 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Smim18J3QNP2 Cckar-202ENSMUST00000200691 3230 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Smim18J3QNP2 Cd200r2-201ENSMUST00000102805 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Smim18J3QNP2 Dhx35-202ENSMUST00000109478 3284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Smim18J3QNP2 Mfsd11-201ENSMUST00000021173 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Smim18J3QNP2 Gm26805-201ENSMUST00000181885 3089 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Smim18J3QNP2 Hipk2-204ENSMUST00000160360 3907 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Smim18J3QNP2 Rpgrip1-201ENSMUST00000111600 4565 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Smim18J3QNP2 Micu1-212ENSMUST00000179709 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Smim18J3QNP2 C330027C09Rik-201ENSMUST00000048374 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Smim18J3QNP2 Cep250-204ENSMUST00000109619 7977 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Smim18J3QNP2 Cep250-201ENSMUST00000039994 7979 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Smim18J3QNP2 Aen-203ENSMUST00000107425 4956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Smim18J3QNP2 Grb2-204ENSMUST00000106499 2333 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Smim18J3QNP2 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Smim18J3QNP2 Tec-203ENSMUST00000113594 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Smim18J3QNP2 Il6st-210ENSMUST00000184949 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Smim18J3QNP2 Usp2-208ENSMUST00000177054 2370 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Smim18J3QNP2 Hsd17b6-203ENSMUST00000219447 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Smim18J3QNP2 Zdbf2-202ENSMUST00000114132 12629 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Smim18J3QNP2 Arhgap4-205ENSMUST00000114407 3051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Smim18J3QNP2 Mc3r-201ENSMUST00000038532 2623 ntAPPRIS P1 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Smim18J3QNP2 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Smim18J3QNP2 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Smim18J3QNP2 Rhbdl2-202ENSMUST00000106204 1120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Smim18J3QNP2 Cstl1-202ENSMUST00000109954 454 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Smim18J3QNP2 Tpm1-207ENSMUST00000113687 962 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Smim18J3QNP2 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Smim18J3QNP2 Acyp1-204ENSMUST00000121930 634 ntTSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Smim18J3QNP2 D630024D03Rik-201ENSMUST00000126265 720 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Smim18J3QNP2 Eif4e1b-204ENSMUST00000132005 706 ntTSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Smim18J3QNP2 Immp2l-202ENSMUST00000132121 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Smim18J3QNP2 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Smim18J3QNP2 Gm11754-201ENSMUST00000156576 661 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Smim18J3QNP2 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Smim18J3QNP2 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Smim18J3QNP2 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Smim18J3QNP2 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Smim18J3QNP2 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Smim18J3QNP2 Gm42859-201ENSMUST00000199572 193 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Smim18J3QNP2 Gm9353-201ENSMUST00000200472 604 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Smim18J3QNP2 Gm44420-201ENSMUST00000203669 490 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Smim18J3QNP2 Gm44008-201ENSMUST00000204345 412 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Smim18J3QNP2 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Smim18J3QNP2 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Smim18J3QNP2 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Smim18J3QNP2 Mrto4-ps1-201ENSMUST00000220565 721 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Smim18J3QNP2 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Smim18J3QNP2 AC154436.1-201ENSMUST00000227272 782 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Smim18J3QNP2 AC125117.1-201ENSMUST00000228121 468 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Smim18J3QNP2 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Smim18J3QNP2 Ccs-201ENSMUST00000037246 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Smim18J3QNP2 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Smim18J3QNP2 Tubd1-205ENSMUST00000167178 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Smim18J3QNP2 Tceanc-202ENSMUST00000112188 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Smim18J3QNP2 Osmr-201ENSMUST00000022746 5491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Smim18J3QNP2 Timd2-202ENSMUST00000109225 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms