Protein–RNA interactions for Protein: F6YKY3

Gm8005, Predicted gene 8005 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8005F6YKY3 Slc13a5-205ENSMUST00000208056 3111 ntTSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Gm8005F6YKY3 Arhgap4-202ENSMUST00000114404 2895 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Gm8005F6YKY3 Gm29480-201ENSMUST00000188589 1655 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Gm8005F6YKY3 Slc14a2-202ENSMUST00000163367 1428 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Gm8005F6YKY3 Ankrd33-201ENSMUST00000070875 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Gm8005F6YKY3 Bicd1-203ENSMUST00000111513 4049 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Gm8005F6YKY3 Mei4-203ENSMUST00000189832 2578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Gm8005F6YKY3 Polr2a-201ENSMUST00000058470 6740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Gm8005F6YKY3 Dnm3-201ENSMUST00000070330 4601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Gm8005F6YKY3 Pdp1-202ENSMUST00000095144 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Gm8005F6YKY3 Sox5os1-201ENSMUST00000156994 1585 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Gm8005F6YKY3 Ankrd34c-202ENSMUST00000185470 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Gm8005F6YKY3 Gm45699-201ENSMUST00000212838 1576 ntTSL 2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Gm8005F6YKY3 Astn1-201ENSMUST00000046110 7195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Gm8005F6YKY3 Cacna1c-214ENSMUST00000188106 6462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Gm8005F6YKY3 Zfp652-201ENSMUST00000091565 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Gm8005F6YKY3 Slc16a7-202ENSMUST00000105257 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Gm8005F6YKY3 Wdr37-212ENSMUST00000176922 3780 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Gm8005F6YKY3 Nipal3-202ENSMUST00000105856 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Gm8005F6YKY3 Syne1-201ENSMUST00000041639 6990 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Gm8005F6YKY3 Setd1b-201ENSMUST00000056053 7362 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Gm8005F6YKY3 Btrc-206ENSMUST00000224102 3037 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Gm8005F6YKY3 Arntl2-202ENSMUST00000111636 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Gm8005F6YKY3 Arntl2-203ENSMUST00000111638 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Gm8005F6YKY3 Arntl2-201ENSMUST00000080530 1740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Gm8005F6YKY3 Ctsa-202ENSMUST00000103092 3646 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Gm8005F6YKY3 Ighv1-58-201ENSMUST00000103529 351 ntAPPRIS P1 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Gm8005F6YKY3 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Gm8005F6YKY3 Dnmt3l-203ENSMUST00000131825 1113 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Gm8005F6YKY3 Dnmt3l-206ENSMUST00000139539 1279 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Gm8005F6YKY3 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Gm8005F6YKY3 Fhit-206ENSMUST00000162278 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Gm8005F6YKY3 Retn-202ENSMUST00000169234 1139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Gm8005F6YKY3 Gm17180-201ENSMUST00000172211 435 ntTSL 3 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Gm8005F6YKY3 Gm4271-201ENSMUST00000174444 973 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Gm8005F6YKY3 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Gm8005F6YKY3 Gm28345-201ENSMUST00000188769 1139 ntTSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Gm8005F6YKY3 Gm28970-201ENSMUST00000191098 1139 ntTSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Gm8005F6YKY3 Mllt11-204ENSMUST00000198948 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Gm8005F6YKY3 Ssr4-201ENSMUST00000002090 765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Gm8005F6YKY3 Mt3-203ENSMUST00000211930 477 ntTSL 2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Gm8005F6YKY3 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Gm8005F6YKY3 Timm9-203ENSMUST00000220482 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Gm8005F6YKY3 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Gm8005F6YKY3 Lss-201ENSMUST00000048678 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Gm8005F6YKY3 Cd8b1-201ENSMUST00000065248 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Gm8005F6YKY3 Mical1-201ENSMUST00000019967 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Gm8005F6YKY3 Snhg11-201ENSMUST00000109488 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Gm8005F6YKY3 Pfkfb2-208ENSMUST00000187089 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Gm8005F6YKY3 Zfp330-201ENSMUST00000034147 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Gm8005F6YKY3 Slc39a14-210ENSMUST00000152067 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Gm8005F6YKY3 Ttll1-201ENSMUST00000016897 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Gm8005F6YKY3 Hipk2-204ENSMUST00000160360 3907 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Gm8005F6YKY3 Celsr3-201ENSMUST00000024238 11547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Gm8005F6YKY3 Carmil1-202ENSMUST00000110398 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Gm8005F6YKY3 Cdyl-201ENSMUST00000075220 3470 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Gm8005F6YKY3 Hyal3-201ENSMUST00000040059 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Gm8005F6YKY3 Gm45278-201ENSMUST00000209650 2414 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Gm8005F6YKY3 Bfar-201ENSMUST00000023365 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Gm8005F6YKY3 Nemp2-201ENSMUST00000165859 3396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Gm8005F6YKY3 Hyal2-206ENSMUST00000195681 2968 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Gm8005F6YKY3 A1cf-201ENSMUST00000075838 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Gm8005F6YKY3 Ddx25-201ENSMUST00000034612 6934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Gm8005F6YKY3 Fam122b-201ENSMUST00000071023 4334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Gm8005F6YKY3 Esrp2-201ENSMUST00000115979 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Gm8005F6YKY3 Fam71e2-202ENSMUST00000174409 2716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Gm8005F6YKY3 Cxcl12-201ENSMUST00000073043 5627 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Gm8005F6YKY3 Carmil2-203ENSMUST00000213019 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Gm8005F6YKY3 Gm42741-201ENSMUST00000201340 2278 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
Gm8005F6YKY3 Srpx2-201ENSMUST00000033606 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Gm8005F6YKY3 Tubb2a-ps2-201ENSMUST00000221547 1339 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
Gm8005F6YKY3 Osr2-204ENSMUST00000228152 1324 ntAPPRIS P1 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Gm8005F6YKY3 A430105I19Rik-201ENSMUST00000059997 4703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Gm8005F6YKY3 Scml4-201ENSMUST00000063063 4885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Gm8005F6YKY3 Plekhg5-203ENSMUST00000105662 3933 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Gm8005F6YKY3 Mpo-203ENSMUST00000121303 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Gm8005F6YKY3 Gm5159-201ENSMUST00000212733 1652 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
Gm8005F6YKY3 Kif2b-201ENSMUST00000061019 2244 ntAPPRIS P1 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Gm8005F6YKY3 Elp5-201ENSMUST00000108594 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Gm8005F6YKY3 Efcab12-201ENSMUST00000032468 2551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Gm8005F6YKY3 Sptan1-205ENSMUST00000113719 8018 ntTSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Gm8005F6YKY3 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Gm8005F6YKY3 Ufc1-202ENSMUST00000111302 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Gm8005F6YKY3 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Gm8005F6YKY3 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Gm8005F6YKY3 Gm12058-201ENSMUST00000118614 437 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
Gm8005F6YKY3 Vmn1r-ps104-201ENSMUST00000120960 771 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
Gm8005F6YKY3 Gm16275-201ENSMUST00000147774 712 ntTSL 3 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Gm8005F6YKY3 Cox16-204ENSMUST00000166723 579 ntTSL 2 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Gm8005F6YKY3 U2af1l4-218ENSMUST00000166960 747 ntTSL 3 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Gm8005F6YKY3 Gm17028-201ENSMUST00000170026 704 ntTSL 3 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Gm8005F6YKY3 Gm19412-201ENSMUST00000185388 436 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Gm8005F6YKY3 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
Gm8005F6YKY3 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Gm8005F6YKY3 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Gm8005F6YKY3 Gm44710-201ENSMUST00000208885 471 ntTSL 2 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Gm8005F6YKY3 Gm29705-201ENSMUST00000212598 474 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
Gm8005F6YKY3 Gm867-202ENSMUST00000219979 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Gm8005F6YKY3 Pcgf5-203ENSMUST00000224679 1269 ntAPPRIS P5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Gm8005F6YKY3 Morn3-201ENSMUST00000031437 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.8 ms