Protein–RNA interactions for Protein: F6W043

Vmn2r40, Vomeronasal 2, receptor 40, mousemouse

Predictions only

Length 852 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn2r40F6W043 Pard3-213ENSMUST00000160766 4949 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Vmn2r40F6W043 Trmt12-201ENSMUST00000036937 4454 ntAPPRIS P1 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Vmn2r40F6W043 Serpine1-202ENSMUST00000077523 2697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Vmn2r40F6W043 Gm21998-201ENSMUST00000117552 1308 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Vmn2r40F6W043 Osr2-204ENSMUST00000228152 1324 ntAPPRIS P1 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Vmn2r40F6W043 Tfdp1-201ENSMUST00000170909 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Vmn2r40F6W043 Tnnt3-209ENSMUST00000105947 780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Vmn2r40F6W043 Timm22-202ENSMUST00000120699 746 ntTSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Vmn2r40F6W043 Gm26759-201ENSMUST00000181773 1251 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Vmn2r40F6W043 Nkx2-2os-202ENSMUST00000184407 458 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Vmn2r40F6W043 1700029J03Rik-201ENSMUST00000185803 789 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Vmn2r40F6W043 Gm29499-201ENSMUST00000189151 486 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Vmn2r40F6W043 Gm28694-201ENSMUST00000190681 722 ntTSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Vmn2r40F6W043 Gm28329-201ENSMUST00000191208 689 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Vmn2r40F6W043 Gm29171-201ENSMUST00000191397 486 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Vmn2r40F6W043 Gm37695-201ENSMUST00000191765 530 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Vmn2r40F6W043 0610033M10Rik-201ENSMUST00000204546 506 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Vmn2r40F6W043 Gng8-204ENSMUST00000205716 432 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Vmn2r40F6W043 Psenen-203ENSMUST00000207747 669 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Vmn2r40F6W043 Hcst-203ENSMUST00000208740 366 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Vmn2r40F6W043 Ddo-207ENSMUST00000216830 806 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Vmn2r40F6W043 AC154290.1-201ENSMUST00000223786 1240 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Vmn2r40F6W043 Rln1-201ENSMUST00000044143 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Vmn2r40F6W043 Nceh1-202ENSMUST00000091284 830 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Vmn2r40F6W043 Rsg1-201ENSMUST00000097813 985 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Vmn2r40F6W043 Brsk2-216ENSMUST00000174499 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Vmn2r40F6W043 Htr1f-201ENSMUST00000063076 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Vmn2r40F6W043 Wdr36-201ENSMUST00000053663 3281 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Vmn2r40F6W043 Tyro3-202ENSMUST00000110783 4460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Vmn2r40F6W043 Slc25a51-201ENSMUST00000107796 4433 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Vmn2r40F6W043 Mest-210ENSMUST00000157040 2383 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Vmn2r40F6W043 Celf3-213ENSMUST00000199775 2351 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Vmn2r40F6W043 Slc38a5-202ENSMUST00000115590 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Vmn2r40F6W043 Chit1-203ENSMUST00000160060 1580 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Vmn2r40F6W043 Prdm16-203ENSMUST00000097759 8544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Vmn2r40F6W043 4930588G17Rik-201ENSMUST00000208075 1474 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Vmn2r40F6W043 2610005L07Rik-202ENSMUST00000140111 4009 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Vmn2r40F6W043 Gm19178-201ENSMUST00000217524 1819 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Vmn2r40F6W043 Gm42141-201ENSMUST00000196534 2172 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Vmn2r40F6W043 Msh5-201ENSMUST00000007250 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Vmn2r40F6W043 Zfp866-202ENSMUST00000137573 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Vmn2r40F6W043 Gm13910-201ENSMUST00000121752 1428 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Vmn2r40F6W043 Pisd-ps2-201ENSMUST00000127960 1424 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Vmn2r40F6W043 Odf2-209ENSMUST00000113764 2450 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Vmn2r40F6W043 Ap1s2-203ENSMUST00000112294 3199 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Vmn2r40F6W043 Treml4-201ENSMUST00000059873 1744 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Vmn2r40F6W043 Imp4-201ENSMUST00000027303 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Vmn2r40F6W043 Flvcr2-201ENSMUST00000040461 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Vmn2r40F6W043 Slc45a4-207ENSMUST00000151288 7509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Vmn2r40F6W043 Vps18-201ENSMUST00000037280 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Vmn2r40F6W043 Gem-202ENSMUST00000108304 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Vmn2r40F6W043 Plpbp-205ENSMUST00000209856 3954 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Vmn2r40F6W043 Sparc-209ENSMUST00000216313 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Vmn2r40F6W043 Bloc1s5-201ENSMUST00000035899 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Vmn2r40F6W043 Slc1a2-203ENSMUST00000111212 1957 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Vmn2r40F6W043 Gm8378-202ENSMUST00000167777 2624 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Vmn2r40F6W043 1110059E24Rik-201ENSMUST00000038830 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Vmn2r40F6W043 Rpl11-201ENSMUST00000102536 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Vmn2r40F6W043 Map2k7-205ENSMUST00000110996 1188 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Vmn2r40F6W043 Fam129a-203ENSMUST00000111875 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Vmn2r40F6W043 Gsg1-202ENSMUST00000111909 1087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Vmn2r40F6W043 Gm12579-201ENSMUST00000118040 783 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Vmn2r40F6W043 Gm14665-201ENSMUST00000122294 557 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Vmn2r40F6W043 Gm13257-201ENSMUST00000132840 665 ntTSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Vmn2r40F6W043 Rdh9-203ENSMUST00000136223 1276 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Vmn2r40F6W043 Gm15881-201ENSMUST00000148792 942 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Vmn2r40F6W043 Gm16036-201ENSMUST00000150385 1112 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Vmn2r40F6W043 Scgb1b19-201ENSMUST00000165813 418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Vmn2r40F6W043 Gm17168-201ENSMUST00000169146 345 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Vmn2r40F6W043 Gm17391-201ENSMUST00000171036 126 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Vmn2r40F6W043 Gm7030-202ENSMUST00000172968 899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Vmn2r40F6W043 Scgb1b3-201ENSMUST00000179481 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Vmn2r40F6W043 Vmn1r205-201ENSMUST00000185475 951 ntAPPRIS P1 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Vmn2r40F6W043 Gm5714-201ENSMUST00000197343 566 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Vmn2r40F6W043 Gm43966-201ENSMUST00000203301 612 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Vmn2r40F6W043 Fam168a-204ENSMUST00000207564 1083 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Vmn2r40F6W043 AC162938.2-204ENSMUST00000216455 984 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Vmn2r40F6W043 Gm33979-201ENSMUST00000219486 691 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Vmn2r40F6W043 AC159103.1-201ENSMUST00000228325 429 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Vmn2r40F6W043 Cysrt1-201ENSMUST00000043379 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Vmn2r40F6W043 Olfr323-201ENSMUST00000070804 972 ntAPPRIS P1 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Vmn2r40F6W043 Rpl35a-201ENSMUST00000078804 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Vmn2r40F6W043 Slc22a14-201ENSMUST00000093775 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Vmn2r40F6W043 Adcy7-204ENSMUST00000171456 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Vmn2r40F6W043 Atic-201ENSMUST00000027384 2845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Vmn2r40F6W043 Cxcl12-203ENSMUST00000112871 3132 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Vmn2r40F6W043 Etv1-211ENSMUST00000162563 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Vmn2r40F6W043 Ptpn21-202ENSMUST00000170188 5562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Vmn2r40F6W043 Hectd4-201ENSMUST00000042614 15482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Vmn2r40F6W043 Rxfp2-206ENSMUST00000201612 2470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Vmn2r40F6W043 Pml-202ENSMUST00000114136 4343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Vmn2r40F6W043 Spock2-203ENSMUST00000165024 3699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Vmn2r40F6W043 Dph6-203ENSMUST00000102542 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Vmn2r40F6W043 Hap1-202ENSMUST00000138603 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Vmn2r40F6W043 Nxpe5-204ENSMUST00000161047 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Vmn2r40F6W043 Pcdhga7-201ENSMUST00000192511 4730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Vmn2r40F6W043 Supt16-201ENSMUST00000046709 4673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Vmn2r40F6W043 Gm20671-201ENSMUST00000144673 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Vmn2r40F6W043 Crybg3-205ENSMUST00000172910 2870 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Vmn2r40F6W043 Gm2464-201ENSMUST00000180838 2551 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.3 ms