Protein–RNA interactions for Protein: B2RW11

Ankrd34a, Ankyrin repeat domain 34A, mousemouse

Predictions only

Length 495 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ankrd34aB2RW11 Btnl4-201ENSMUST00000065841 1761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.48
Ankrd34aB2RW11 Cops7b-202ENSMUST00000121534 5383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.48
Ankrd34aB2RW11 Chrnb2-201ENSMUST00000029562 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Ankrd34aB2RW11 Gdpd2-201ENSMUST00000019503 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Ankrd34aB2RW11 Ptchd3-201ENSMUST00000036690 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Ankrd34aB2RW11 Rps6kb1-207ENSMUST00000154617 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Ankrd34aB2RW11 Mark4-201ENSMUST00000085715 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Ankrd34aB2RW11 4930555B11Rik-201ENSMUST00000123210 1533 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Ankrd34aB2RW11 Slc35f6-205ENSMUST00000196740 1972 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Ankrd34aB2RW11 Rbms3-201ENSMUST00000044901 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Ankrd34aB2RW11 Fcho1-201ENSMUST00000093444 3073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Ankrd34aB2RW11 Trim46-202ENSMUST00000090924 2721 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Ankrd34aB2RW11 Tnnt3-209ENSMUST00000105947 780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Ankrd34aB2RW11 Klk6-201ENSMUST00000107966 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Ankrd34aB2RW11 Hist1h2bk-201ENSMUST00000110455 476 ntAPPRIS P1 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Ankrd34aB2RW11 Rps10-202ENSMUST00000114881 604 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Ankrd34aB2RW11 Gm11560-201ENSMUST00000117567 948 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
Ankrd34aB2RW11 Rbm3os-201ENSMUST00000124018 839 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Ankrd34aB2RW11 Gm11789-203ENSMUST00000140645 737 ntTSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Ankrd34aB2RW11 Gm14102-201ENSMUST00000147678 464 ntTSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Ankrd34aB2RW11 Cideb-201ENSMUST00000001497 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Ankrd34aB2RW11 9430093N23Rik-201ENSMUST00000152494 515 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Ankrd34aB2RW11 Gm9866-204ENSMUST00000183238 351 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Ankrd34aB2RW11 Gm28011-201ENSMUST00000184097 175 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
Ankrd34aB2RW11 Mmp7-201ENSMUST00000018767 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Ankrd34aB2RW11 Gm18799-201ENSMUST00000189104 913 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
Ankrd34aB2RW11 Ighv1-2-201ENSMUST00000195325 378 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
Ankrd34aB2RW11 1700016D08Rik-202ENSMUST00000195807 368 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
Ankrd34aB2RW11 Gm43695-201ENSMUST00000196545 196 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Ankrd34aB2RW11 Fkbp6-204ENSMUST00000201791 1297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Ankrd34aB2RW11 Gm18539-201ENSMUST00000204745 1090 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
Ankrd34aB2RW11 Gm44559-201ENSMUST00000207177 1012 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
Ankrd34aB2RW11 Gm3433-201ENSMUST00000210149 1058 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
Ankrd34aB2RW11 Gm34655-202ENSMUST00000215259 877 ntTSL 3 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Ankrd34aB2RW11 AC116797.2-202ENSMUST00000223587 1017 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
Ankrd34aB2RW11 Pcgf5-204ENSMUST00000224772 1266 ntAPPRIS ALT1 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Ankrd34aB2RW11 Mitd1-201ENSMUST00000027257 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Ankrd34aB2RW11 Cdk19os-201ENSMUST00000044774 534 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Ankrd34aB2RW11 Spink2-201ENSMUST00000065216 631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Ankrd34aB2RW11 Lhfpl5-201ENSMUST00000080780 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Ankrd34aB2RW11 Tbl1xr1-211ENSMUST00000202747 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Ankrd34aB2RW11 Lmo7-205ENSMUST00000159314 5774 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Ankrd34aB2RW11 Slc46a2-201ENSMUST00000030081 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Ankrd34aB2RW11 Gm44897-201ENSMUST00000206187 1341 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
Ankrd34aB2RW11 Agtrap-201ENSMUST00000030865 3996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Ankrd34aB2RW11 Ms4a7-203ENSMUST00000067532 1334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Ankrd34aB2RW11 Bbip1-201ENSMUST00000135402 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Ankrd34aB2RW11 Gm43984-201ENSMUST00000204572 2864 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
Ankrd34aB2RW11 Kctd18-210ENSMUST00000164963 2114 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Ankrd34aB2RW11 Wdr26-208ENSMUST00000162963 6452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Ankrd34aB2RW11 1700010I14Rik-201ENSMUST00000024650 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Ankrd34aB2RW11 Tpcn2-201ENSMUST00000058022 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Ankrd34aB2RW11 Cyp2s1-201ENSMUST00000043314 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Ankrd34aB2RW11 Poll-201ENSMUST00000026239 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Ankrd34aB2RW11 Traf7-201ENSMUST00000070777 2384 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ankrd34aB2RW11 Shc1-201ENSMUST00000039110 3250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ankrd34aB2RW11 Steap3-204ENSMUST00000112643 2873 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ankrd34aB2RW11 Cul9-201ENSMUST00000066026 7818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ankrd34aB2RW11 Srsf5-205ENSMUST00000110356 1568 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ankrd34aB2RW11 Syde2-203ENSMUST00000200546 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ankrd34aB2RW11 Gm39321-203ENSMUST00000217090 1575 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ankrd34aB2RW11 Sema3f-201ENSMUST00000080560 3395 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ankrd34aB2RW11 Arhgap24-206ENSMUST00000112854 2991 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ankrd34aB2RW11 Csrnp1-204ENSMUST00000215916 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ankrd34aB2RW11 Pdp1-202ENSMUST00000095144 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ankrd34aB2RW11 Srek1-201ENSMUST00000074616 3934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ankrd34aB2RW11 Slc44a2-201ENSMUST00000034697 3456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ankrd34aB2RW11 A730071L15Rik-201ENSMUST00000181545 1615 ntAPPRIS P1 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ankrd34aB2RW11 Plxnb2-202ENSMUST00000109331 6377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ankrd34aB2RW11 Tcf12-201ENSMUST00000034755 4621 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ankrd34aB2RW11 AI464131-201ENSMUST00000054920 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ankrd34aB2RW11 Usp24-204ENSMUST00000165709 10594 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ankrd34aB2RW11 Wdr20rt-201ENSMUST00000046331 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ankrd34aB2RW11 Arhgef2-203ENSMUST00000170653 4238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ankrd34aB2RW11 Trav13d-4-201ENSMUST00000103607 264 ntAPPRIS P1 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ankrd34aB2RW11 Art5-202ENSMUST00000106934 843 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ankrd34aB2RW11 Gm5150-201ENSMUST00000108347 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ankrd34aB2RW11 Gng12-205ENSMUST00000114226 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ankrd34aB2RW11 Gm11619-201ENSMUST00000117474 237 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Ankrd34aB2RW11 Atp6v1g2-202ENSMUST00000118384 483 ntTSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ankrd34aB2RW11 Gm15726-201ENSMUST00000144738 509 ntTSL 3 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ankrd34aB2RW11 Platr3-201ENSMUST00000146980 412 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ankrd34aB2RW11 Gm12406-201ENSMUST00000155382 697 ntTSL 3 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ankrd34aB2RW11 Gm25604-201ENSMUST00000158359 133 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Ankrd34aB2RW11 Acat3-202ENSMUST00000160378 987 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ankrd34aB2RW11 Klrb1a-202ENSMUST00000171306 989 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ankrd34aB2RW11 Gm20574-201ENSMUST00000182867 917 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Ankrd34aB2RW11 Trav13-4-dv7-202ENSMUST00000184905 264 ntAPPRIS P1 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ankrd34aB2RW11 Gm20914-202ENSMUST00000188887 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ankrd34aB2RW11 Gm4870-201ENSMUST00000198525 1251 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Ankrd34aB2RW11 Gm43380-201ENSMUST00000200421 220 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Ankrd34aB2RW11 Gm7504-201ENSMUST00000201449 424 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Ankrd34aB2RW11 Isoc2b-205ENSMUST00000208816 820 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ankrd34aB2RW11 Gm19572-201ENSMUST00000214326 338 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Ankrd34aB2RW11 Gm6390-201ENSMUST00000215034 589 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Ankrd34aB2RW11 AC123830.1-201ENSMUST00000217156 609 ntTSL 3 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ankrd34aB2RW11 Nmi-201ENSMUST00000028314 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ankrd34aB2RW11 C8g-202ENSMUST00000040042 1150 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ankrd34aB2RW11 Rps25-201ENSMUST00000080300 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ankrd34aB2RW11 Olfr806-201ENSMUST00000095245 942 ntAPPRIS P1 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.9 ms