Protein–RNA interactions for Protein: B0V2N1

Ptprs, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase S, mousemouse

Predictions only

Length 1,907 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprsB0V2N1 Gm15802-202ENSMUST00000209595 1094 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
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PtprsB0V2N1 AC122035.1-201ENSMUST00000227576 1016 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
PtprsB0V2N1 Tmem220-202ENSMUST00000079077 1147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
PtprsB0V2N1 Gm4950-201ENSMUST00000091905 618 ntAPPRIS P1 BASIC10.28□□□□□ -0.76
PtprsB0V2N1 Taar8b-201ENSMUST00000092654 1035 ntAPPRIS P1 BASIC10.28□□□□□ -0.76
PtprsB0V2N1 Etaa1-201ENSMUST00000076661 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
PtprsB0V2N1 AC207128.2-201ENSMUST00000223708 1924 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
PtprsB0V2N1 Krt33b-201ENSMUST00000073890 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
PtprsB0V2N1 Bicd1-202ENSMUST00000086829 9667 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
PtprsB0V2N1 Gm18210-201ENSMUST00000209001 1524 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
PtprsB0V2N1 Gm37264-201ENSMUST00000194916 2192 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
PtprsB0V2N1 Gm12766-201ENSMUST00000140298 1823 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
PtprsB0V2N1 Pex13-201ENSMUST00000020523 4146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
PtprsB0V2N1 Hdac6-201ENSMUST00000033501 4142 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
PtprsB0V2N1 Gm37651-201ENSMUST00000194679 1494 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
PtprsB0V2N1 Brwd1-201ENSMUST00000023631 8209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
PtprsB0V2N1 Slc39a14-210ENSMUST00000152067 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
PtprsB0V2N1 Rasal1-201ENSMUST00000031606 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
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PtprsB0V2N1 Nrf1-208ENSMUST00000115208 2492 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.76
PtprsB0V2N1 Setd1a-202ENSMUST00000047157 5927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.76
PtprsB0V2N1 Synpo-211ENSMUST00000155195 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
PtprsB0V2N1 Btbd9-201ENSMUST00000079924 6657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
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PtprsB0V2N1 Parvaos-201ENSMUST00000154848 1285 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
PtprsB0V2N1 Mrgpra2a-201ENSMUST00000159004 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
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PtprsB0V2N1 Gm20420-201ENSMUST00000173178 639 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
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PtprsB0V2N1 Mt1-202ENSMUST00000211807 1085 ntBASIC10.27□□□□□ -0.76
PtprsB0V2N1 AC134248.1-201ENSMUST00000216113 1176 ntBASIC10.27□□□□□ -0.76
PtprsB0V2N1 Gm36074-201ENSMUST00000221383 591 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.76
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PtprsB0V2N1 Mgp-201ENSMUST00000032342 617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
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PtprsB0V2N1 Rpl4-201ENSMUST00000034966 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
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PtprsB0V2N1 Gm12248-202ENSMUST00000218429 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
PtprsB0V2N1 Zc3h12a-201ENSMUST00000036188 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
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PtprsB0V2N1 BC052040-201ENSMUST00000110918 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
PtprsB0V2N1 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
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PtprsB0V2N1 Nudt21-201ENSMUST00000034204 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
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PtprsB0V2N1 Gm42851-201ENSMUST00000201325 1411 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
PtprsB0V2N1 Swap70-201ENSMUST00000033325 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
PtprsB0V2N1 AC090962.2-201ENSMUST00000225064 1801 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
PtprsB0V2N1 AC211878.3-201ENSMUST00000222629 2018 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
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PtprsB0V2N1 Lrch1-201ENSMUST00000088970 4694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
PtprsB0V2N1 Gm16237-201ENSMUST00000156666 1319 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
PtprsB0V2N1 Gm4846-201ENSMUST00000143922 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
PtprsB0V2N1 Wdr46-ps-201ENSMUST00000200591 1712 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
PtprsB0V2N1 Slc10a6-201ENSMUST00000031263 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
PtprsB0V2N1 Apbb1-217ENSMUST00000191011 2712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
PtprsB0V2N1 Capn15-201ENSMUST00000041641 3520 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
PtprsB0V2N1 Ypel4-201ENSMUST00000090729 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
PtprsB0V2N1 Yipf6-202ENSMUST00000113811 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
PtprsB0V2N1 Gm3233-201ENSMUST00000168997 693 ntAPPRIS P1 BASIC10.26□□□□□ -0.77
PtprsB0V2N1 Dpf3-206ENSMUST00000177959 1298 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
PtprsB0V2N1 Gm4753-201ENSMUST00000188327 1255 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
PtprsB0V2N1 Mrps11-201ENSMUST00000032840 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
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PtprsB0V2N1 Rps18-ps3-201ENSMUST00000080443 456 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
PtprsB0V2N1 Wfdc6a-201ENSMUST00000099096 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
PtprsB0V2N1 Morf4l2-212ENSMUST00000164609 1811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
PtprsB0V2N1 Insrr-202ENSMUST00000107582 4694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.4 ms