Protein–RNA interactions for Protein: A2A7B5

Prdm2, PR domain-containing 2, with ZNF domain, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,709 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm2A2A7B5 Rnf44-218ENSMUST00000177950 3941 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Prdm2A2A7B5 4933434E20Rik-206ENSMUST00000160640 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Prdm2A2A7B5 1500012K07Rik-201ENSMUST00000181846 2345 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Prdm2A2A7B5 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Prdm2A2A7B5 Atp6v0e2-202ENSMUST00000203011 1612 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Prdm2A2A7B5 Mir598-201ENSMUST00000102094 79 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Prdm2A2A7B5 Msrb1-202ENSMUST00000115262 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Prdm2A2A7B5 Olfr333-ps1-201ENSMUST00000122311 940 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Prdm2A2A7B5 Bud31-203ENSMUST00000160075 928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Prdm2A2A7B5 Gm26875-201ENSMUST00000181006 950 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Prdm2A2A7B5 Gm5865-201ENSMUST00000198713 637 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Prdm2A2A7B5 Gm42803-201ENSMUST00000201051 451 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Prdm2A2A7B5 AC113291.2-201ENSMUST00000215490 1205 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Prdm2A2A7B5 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Prdm2A2A7B5 Scgb2b2-201ENSMUST00000038835 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Prdm2A2A7B5 Phldb1-218ENSMUST00000156918 3485 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Prdm2A2A7B5 Gm4755-201ENSMUST00000181803 2647 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Prdm2A2A7B5 4930555A03Rik-201ENSMUST00000196052 1556 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Prdm2A2A7B5 Krt33b-201ENSMUST00000073890 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Prdm2A2A7B5 Rnf225-201ENSMUST00000045870 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Prdm2A2A7B5 C5ar1-202ENSMUST00000168818 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Prdm2A2A7B5 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Prdm2A2A7B5 Akr1d1-201ENSMUST00000040987 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Prdm2A2A7B5 Agxt2-204ENSMUST00000110542 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Prdm2A2A7B5 Slc7a4-207ENSMUST00000172164 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Prdm2A2A7B5 Fxr1-204ENSMUST00000197694 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Prdm2A2A7B5 Ntng1-208ENSMUST00000133268 5587 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Prdm2A2A7B5 Amd-ps3-201ENSMUST00000072796 1496 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
Prdm2A2A7B5 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Prdm2A2A7B5 Dnpep-203ENSMUST00000185419 2833 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Prdm2A2A7B5 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prdm2A2A7B5 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prdm2A2A7B5 Mettl18-202ENSMUST00000111490 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prdm2A2A7B5 Elmod3-202ENSMUST00000114069 2164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prdm2A2A7B5 Gm15746-201ENSMUST00000120684 1027 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Prdm2A2A7B5 Gm15373-201ENSMUST00000121495 214 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Prdm2A2A7B5 Gm13688-201ENSMUST00000121557 608 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Prdm2A2A7B5 Gm16178-201ENSMUST00000129408 677 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prdm2A2A7B5 Gm23432-201ENSMUST00000157181 131 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Prdm2A2A7B5 Kcnmb3-201ENSMUST00000164954 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prdm2A2A7B5 Tcl1-203ENSMUST00000175652 535 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prdm2A2A7B5 Gm26615-201ENSMUST00000181522 3201 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prdm2A2A7B5 Gm17514-201ENSMUST00000181863 1102 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prdm2A2A7B5 Gm6768-201ENSMUST00000022467 1878 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Prdm2A2A7B5 Adgb-201ENSMUST00000045328 1893 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prdm2A2A7B5 Fam186a-201ENSMUST00000062631 759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prdm2A2A7B5 A530013C23Rik-202ENSMUST00000141923 3489 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prdm2A2A7B5 Ufd1-201ENSMUST00000005394 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prdm2A2A7B5 Sh2d2a-202ENSMUST00000107581 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prdm2A2A7B5 A830018L16Rik-209ENSMUST00000179089 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prdm2A2A7B5 Oraov1-204ENSMUST00000128057 2231 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prdm2A2A7B5 Gm34425-201ENSMUST00000216269 3079 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prdm2A2A7B5 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prdm2A2A7B5 Stau2-202ENSMUST00000054668 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prdm2A2A7B5 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prdm2A2A7B5 Gas7-202ENSMUST00000108680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prdm2A2A7B5 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prdm2A2A7B5 Gm43622-201ENSMUST00000200140 2019 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Prdm2A2A7B5 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prdm2A2A7B5 Gm23132-201ENSMUST00000104254 132 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Prdm2A2A7B5 4930594O21Rik-201ENSMUST00000129750 629 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prdm2A2A7B5 Pebp1-201ENSMUST00000036951 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prdm2A2A7B5 Tex46-201ENSMUST00000046647 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prdm2A2A7B5 Olfr1219-201ENSMUST00000099797 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prdm2A2A7B5 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prdm2A2A7B5 Oprm1-205ENSMUST00000078634 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prdm2A2A7B5 Ptger4-201ENSMUST00000047379 3264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prdm2A2A7B5 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prdm2A2A7B5 Erich3-203ENSMUST00000189969 3460 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Prdm2A2A7B5 Dytn-201ENSMUST00000090313 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prdm2A2A7B5 Bpifb1-201ENSMUST00000028987 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prdm2A2A7B5 Heg1-201ENSMUST00000126532 6714 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prdm2A2A7B5 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prdm2A2A7B5 Sgk1-203ENSMUST00000100036 2476 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prdm2A2A7B5 Sgk1-201ENSMUST00000020145 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prdm2A2A7B5 Ndrg4-203ENSMUST00000080666 2738 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prdm2A2A7B5 Ccr6-202ENSMUST00000164411 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prdm2A2A7B5 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prdm2A2A7B5 Elk1-201ENSMUST00000009550 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prdm2A2A7B5 Stk17b-201ENSMUST00000027263 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prdm2A2A7B5 Dcst2-201ENSMUST00000208216 2285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prdm2A2A7B5 Tnnt3-203ENSMUST00000105941 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prdm2A2A7B5 Tnnt3-204ENSMUST00000105942 720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prdm2A2A7B5 Tnnt3-205ENSMUST00000105943 720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prdm2A2A7B5 Tnnt3-207ENSMUST00000105945 747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prdm2A2A7B5 Tnnt3-208ENSMUST00000105946 765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prdm2A2A7B5 Klra9-202ENSMUST00000112032 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prdm2A2A7B5 Gm12377-201ENSMUST00000118656 252 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Prdm2A2A7B5 Gm13954-201ENSMUST00000123441 543 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prdm2A2A7B5 Platr20-202ENSMUST00000143209 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prdm2A2A7B5 Rps18-206ENSMUST00000174609 527 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prdm2A2A7B5 Tnnt3-225ENSMUST00000179658 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prdm2A2A7B5 Gm17797-201ENSMUST00000182175 997 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Prdm2A2A7B5 Mylpf-206ENSMUST00000206772 653 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prdm2A2A7B5 H2-T3-201ENSMUST00000025312 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prdm2A2A7B5 Klra9-201ENSMUST00000071554 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prdm2A2A7B5 Tmem129-201ENSMUST00000019439 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prdm2A2A7B5 Mymk-201ENSMUST00000009358 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prdm2A2A7B5 Syne3-202ENSMUST00000095439 3357 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prdm2A2A7B5 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80 ms