Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLF7

Tlr5, Toll-like receptor 5, mousemouse

Predictions only

Length 859 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tlr5Q9JLF7 Ccnk-202ENSMUST00000221167 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Tlr5Q9JLF7 Scaf1-206ENSMUST00000211735 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Tlr5Q9JLF7 Xpot-203ENSMUST00000218004 6005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Tlr5Q9JLF7 Phc1-204ENSMUST00000159252 3744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Tlr5Q9JLF7 Wars-201ENSMUST00000109848 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Tlr5Q9JLF7 Rfesd-201ENSMUST00000050997 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Tlr5Q9JLF7 Pdcd10-205ENSMUST00000161137 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Tlr5Q9JLF7 Nfia-202ENSMUST00000075448 9526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Tlr5Q9JLF7 Mbtps1-201ENSMUST00000081381 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Tlr5Q9JLF7 Slc35b3-202ENSMUST00000167513 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Tlr5Q9JLF7 Hk2-201ENSMUST00000000642 5513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Tlr5Q9JLF7 Srpk3-201ENSMUST00000002081 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Tlr5Q9JLF7 Cdc37-201ENSMUST00000019615 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Tlr5Q9JLF7 Sdccag8-201ENSMUST00000027785 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Tlr5Q9JLF7 Acox3-203ENSMUST00000114237 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Tlr5Q9JLF7 Cyb5b-201ENSMUST00000034400 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Tlr5Q9JLF7 Rbl2-210ENSMUST00000211136 4504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Tlr5Q9JLF7 Olfr482-202ENSMUST00000217304 2612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Tlr5Q9JLF7 Meaf6-205ENSMUST00000154689 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Tlr5Q9JLF7 Ifna15-201ENSMUST00000102809 573 ntAPPRIS P1 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Tlr5Q9JLF7 Gm25766-201ENSMUST00000104101 131 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Tlr5Q9JLF7 Gsto2-202ENSMUST00000120645 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Tlr5Q9JLF7 Gm1848-201ENSMUST00000120711 789 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Tlr5Q9JLF7 Gm14460-201ENSMUST00000121511 639 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Tlr5Q9JLF7 1700037C06Rik-201ENSMUST00000132824 874 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Tlr5Q9JLF7 AC158605.1-201ENSMUST00000156803 764 ntTSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Tlr5Q9JLF7 Gm11269-201ENSMUST00000157011 595 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Tlr5Q9JLF7 Gm22902-201ENSMUST00000158488 302 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Tlr5Q9JLF7 Gm7929-201ENSMUST00000178711 624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Tlr5Q9JLF7 Gm3015-202ENSMUST00000179803 624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Tlr5Q9JLF7 Sbsn-205ENSMUST00000182721 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Tlr5Q9JLF7 Mir7076-201ENSMUST00000183519 74 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Tlr5Q9JLF7 Gm9111-201ENSMUST00000219394 709 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Tlr5Q9JLF7 Gm29676-202ENSMUST00000222409 364 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Tlr5Q9JLF7 AC122035.1-201ENSMUST00000227576 1016 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Tlr5Q9JLF7 4921507G05Rik-201ENSMUST00000181348 1653 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Tlr5Q9JLF7 Bcat2-208ENSMUST00000211173 1684 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Tlr5Q9JLF7 Epb42-201ENSMUST00000023987 2695 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Tlr5Q9JLF7 Flad1-204ENSMUST00000129308 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Tlr5Q9JLF7 Capn15-201ENSMUST00000041641 3520 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Tlr5Q9JLF7 Tas1r2-202ENSMUST00000166773 2524 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Tlr5Q9JLF7 Gm5739-201ENSMUST00000208601 1703 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Tlr5Q9JLF7 Crybg2-201ENSMUST00000121391 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Tlr5Q9JLF7 Tubb4b-ps2-201ENSMUST00000187481 1337 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Tlr5Q9JLF7 Nek4-201ENSMUST00000050171 2793 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Tlr5Q9JLF7 Unkl-201ENSMUST00000015271 3414 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Tlr5Q9JLF7 Kif22-ps-201ENSMUST00000119302 1984 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Tlr5Q9JLF7 Zscan10-205ENSMUST00000120967 2609 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Tlr5Q9JLF7 Rbm8a-202ENSMUST00000196456 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Tlr5Q9JLF7 Fntb-201ENSMUST00000041008 2613 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Tlr5Q9JLF7 Odf2l-204ENSMUST00000106192 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Tlr5Q9JLF7 Gpcpd1-205ENSMUST00000110142 3703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Tlr5Q9JLF7 Mab21l1-201ENSMUST00000075422 2492 ntAPPRIS P1 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Tlr5Q9JLF7 Ncf1-202ENSMUST00000111275 2721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Tlr5Q9JLF7 Myo18a-211ENSMUST00000130627 6202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Tlr5Q9JLF7 Gm13556-201ENSMUST00000132692 1412 ntTSL 3 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Tlr5Q9JLF7 Clasp1-216ENSMUST00000189738 5373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Tlr5Q9JLF7 Togaram1-201ENSMUST00000066296 6372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Tlr5Q9JLF7 Tmem19-201ENSMUST00000092170 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Tlr5Q9JLF7 Trpm7-202ENSMUST00000103224 7107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Tlr5Q9JLF7 Syt14-201ENSMUST00000016344 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Tlr5Q9JLF7 Rbms2-201ENSMUST00000092033 1481 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Tlr5Q9JLF7 Nox4-201ENSMUST00000032781 3753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Tlr5Q9JLF7 D930020B18Rik-201ENSMUST00000120642 3335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Tlr5Q9JLF7 n-R5s84-201ENSMUST00000122591 109 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Tlr5Q9JLF7 2810408I11Rik-201ENSMUST00000122813 435 ntTSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Tlr5Q9JLF7 Smim1-204ENSMUST00000130175 477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Tlr5Q9JLF7 Smim1-206ENSMUST00000132541 490 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Tlr5Q9JLF7 Scgb1b19-201ENSMUST00000165813 418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Tlr5Q9JLF7 Gm7030-202ENSMUST00000172968 899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Tlr5Q9JLF7 Gm20400-201ENSMUST00000173695 665 ntTSL 3 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Tlr5Q9JLF7 Scgb1b3-201ENSMUST00000179481 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Tlr5Q9JLF7 Gm35025-203ENSMUST00000193519 634 ntTSL 3 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Tlr5Q9JLF7 Gm43552-201ENSMUST00000196121 365 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Tlr5Q9JLF7 Gm44126-201ENSMUST00000204831 514 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Tlr5Q9JLF7 Gm18561-201ENSMUST00000206027 804 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Tlr5Q9JLF7 Gm30671-201ENSMUST00000214898 318 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Tlr5Q9JLF7 CT485607.1-201ENSMUST00000216100 85 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Tlr5Q9JLF7 AC134248.1-201ENSMUST00000216113 1176 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Tlr5Q9JLF7 Gm4065-202ENSMUST00000218911 986 ntTSL 3 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Tlr5Q9JLF7 Fkbpl-201ENSMUST00000036720 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Tlr5Q9JLF7 Chmp3-202ENSMUST00000065364 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Tlr5Q9JLF7 Krtap5-1-201ENSMUST00000084413 588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Tlr5Q9JLF7 Bco1-203ENSMUST00000176860 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Tlr5Q9JLF7 Stc2-201ENSMUST00000020546 3940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Tlr5Q9JLF7 St6galnac5-201ENSMUST00000044278 5667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Tlr5Q9JLF7 Hacl1-212ENSMUST00000167066 1566 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Tlr5Q9JLF7 Cpsf4l-202ENSMUST00000100248 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Tlr5Q9JLF7 Klhl3-202ENSMUST00000160860 7149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Tlr5Q9JLF7 Gm5308-201ENSMUST00000196752 1354 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Tlr5Q9JLF7 AC158636.1-201ENSMUST00000220118 1393 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Tlr5Q9JLF7 Dis3l-201ENSMUST00000068367 3605 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Tlr5Q9JLF7 Klhl14-202ENSMUST00000122333 4423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Tlr5Q9JLF7 Adora1-203ENSMUST00000169927 4581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Tlr5Q9JLF7 Inpp4a-203ENSMUST00000114933 3004 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Tlr5Q9JLF7 Npl-201ENSMUST00000041874 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Tlr5Q9JLF7 Ints1-210ENSMUST00000200393 7070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Tlr5Q9JLF7 P2ry1-201ENSMUST00000029331 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Tlr5Q9JLF7 4732491K20Rik-201ENSMUST00000181774 3142 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Tlr5Q9JLF7 AC124732.3-201ENSMUST00000221835 1765 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43 ms