Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKP8

Chrac1, Chromatin accessibility complex protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 129 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chrac1Q9JKP8 Tmem219-203ENSMUST00000120007 1087 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Chrac1Q9JKP8 Gm13665-201ENSMUST00000120830 528 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Chrac1Q9JKP8 Lyzl4os-202ENSMUST00000156364 726 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Chrac1Q9JKP8 Lmo3-202ENSMUST00000161450 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Chrac1Q9JKP8 Ubl5-206ENSMUST00000161486 794 ntTSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Chrac1Q9JKP8 Gm16505-201ENSMUST00000179981 232 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Chrac1Q9JKP8 Mrip-ps-201ENSMUST00000184613 940 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Chrac1Q9JKP8 1700113H08Rik-202ENSMUST00000189456 974 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Chrac1Q9JKP8 Gm38293-201ENSMUST00000193209 600 ntTSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Chrac1Q9JKP8 Gm42797-201ENSMUST00000197573 494 ntTSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Chrac1Q9JKP8 3110031N09Rik-201ENSMUST00000201115 326 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Chrac1Q9JKP8 Gm44974-201ENSMUST00000206387 1279 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Chrac1Q9JKP8 Gm45433-201ENSMUST00000209386 247 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Chrac1Q9JKP8 Rpl10-201ENSMUST00000008826 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Chrac1Q9JKP8 Samd4b-201ENSMUST00000040531 4349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Chrac1Q9JKP8 Sel1l-204ENSMUST00000167466 5544 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Chrac1Q9JKP8 Col15a1-203ENSMUST00000107730 1755 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Chrac1Q9JKP8 Eef1a1-201ENSMUST00000042235 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Chrac1Q9JKP8 Reps1-210ENSMUST00000164556 2537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Chrac1Q9JKP8 Gm13812-201ENSMUST00000118061 1347 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Chrac1Q9JKP8 Gm13810-201ENSMUST00000118584 1347 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Chrac1Q9JKP8 Dgkh-201ENSMUST00000074729 3967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Chrac1Q9JKP8 Wwp2-204ENSMUST00000212205 2758 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Chrac1Q9JKP8 Prpf6-203ENSMUST00000136481 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Chrac1Q9JKP8 Dixdc1-203ENSMUST00000117646 5719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Chrac1Q9JKP8 Brsk1-204ENSMUST00000205666 1398 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Chrac1Q9JKP8 Dnmt3a-218ENSMUST00000174817 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Chrac1Q9JKP8 Nos3-202ENSMUST00000115090 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Chrac1Q9JKP8 Rnf6-206ENSMUST00000161859 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Chrac1Q9JKP8 Rin1-208ENSMUST00000225427 4503 ntAPPRIS P2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Chrac1Q9JKP8 Ankrd52-201ENSMUST00000014642 6620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Chrac1Q9JKP8 Dcaf8-201ENSMUST00000074144 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Chrac1Q9JKP8 Brat1-203ENSMUST00000110806 3854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Chrac1Q9JKP8 Erbin-201ENSMUST00000022222 6369 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Chrac1Q9JKP8 Hottip-201ENSMUST00000141300 2346 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Chrac1Q9JKP8 Mkks-202ENSMUST00000110089 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Chrac1Q9JKP8 Il16-203ENSMUST00000145610 3183 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Chrac1Q9JKP8 Kdm3a-202ENSMUST00000167220 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Chrac1Q9JKP8 Myo15-203ENSMUST00000094135 11715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Chrac1Q9JKP8 Nudt1-205ENSMUST00000110827 744 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Chrac1Q9JKP8 Gm15329-201ENSMUST00000121408 155 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Chrac1Q9JKP8 Got2-ps1-201ENSMUST00000121655 1293 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Chrac1Q9JKP8 Gm16341-201ENSMUST00000126385 377 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Chrac1Q9JKP8 Gm13822-201ENSMUST00000127563 346 ntTSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Chrac1Q9JKP8 Lage3-201ENSMUST00000015433 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Chrac1Q9JKP8 Gm10320-201ENSMUST00000170205 527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Chrac1Q9JKP8 Malat1-205ENSMUST00000174808 656 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Chrac1Q9JKP8 1700013M08Rik-202ENSMUST00000200080 798 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Chrac1Q9JKP8 Gm42867-201ENSMUST00000202995 469 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Chrac1Q9JKP8 Mt3-202ENSMUST00000211915 440 ntTSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Chrac1Q9JKP8 Dnajc4-201ENSMUST00000025915 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Chrac1Q9JKP8 Mea1-201ENSMUST00000002845 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Chrac1Q9JKP8 Aak1-201ENSMUST00000003710 7203 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Chrac1Q9JKP8 Olfr398-201ENSMUST00000053874 945 ntAPPRIS P1 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Chrac1Q9JKP8 S100a1-201ENSMUST00000060738 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Chrac1Q9JKP8 Gm17383-201ENSMUST00000078739 1041 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Chrac1Q9JKP8 Asb18-202ENSMUST00000097656 788 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Chrac1Q9JKP8 Pias2-203ENSMUST00000168882 4984 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Chrac1Q9JKP8 Tubb2b-201ENSMUST00000075774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Chrac1Q9JKP8 Nell2-202ENSMUST00000166170 3366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Chrac1Q9JKP8 Trpm1-217ENSMUST00000206263 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Chrac1Q9JKP8 Nanog-201ENSMUST00000012540 2211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Chrac1Q9JKP8 Dmbx1-203ENSMUST00000124071 4017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Chrac1Q9JKP8 Fn1-214ENSMUST00000188894 8043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Chrac1Q9JKP8 Gm10827-201ENSMUST00000181897 2586 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
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Chrac1Q9JKP8 Snx31-203ENSMUST00000161202 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Chrac1Q9JKP8 Ywhaz-201ENSMUST00000022894 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Chrac1Q9JKP8 Cer1-201ENSMUST00000048430 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
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Chrac1Q9JKP8 Golm1-201ENSMUST00000022039 3954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Chrac1Q9JKP8 Abcc10-202ENSMUST00000095261 5266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Chrac1Q9JKP8 Lin54-209ENSMUST00000152387 2760 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Chrac1Q9JKP8 Skp2-201ENSMUST00000096482 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Chrac1Q9JKP8 Dffa-201ENSMUST00000030816 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Chrac1Q9JKP8 Spata13-207ENSMUST00000160973 7467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Chrac1Q9JKP8 Gpcpd1-204ENSMUST00000110136 3546 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Chrac1Q9JKP8 Nrf1-219ENSMUST00000167972 1541 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Chrac1Q9JKP8 Nrf1-220ENSMUST00000170535 1527 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Chrac1Q9JKP8 Rab2b-201ENSMUST00000022765 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Chrac1Q9JKP8 Gosr2-201ENSMUST00000021329 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Chrac1Q9JKP8 Bod1l-201ENSMUST00000050556 10540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Chrac1Q9JKP8 Tcn2-206ENSMUST00000109992 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Chrac1Q9JKP8 Bace1-202ENSMUST00000078111 4041 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Chrac1Q9JKP8 Gm44826-201ENSMUST00000207648 2332 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Chrac1Q9JKP8 1810014B01Rik-202ENSMUST00000218095 1622 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Chrac1Q9JKP8 Clic3-202ENSMUST00000114265 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Chrac1Q9JKP8 Gm12247-201ENSMUST00000117585 670 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Chrac1Q9JKP8 1810063I02Rik-201ENSMUST00000130205 274 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Chrac1Q9JKP8 Prdx5-203ENSMUST00000149261 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Chrac1Q9JKP8 Gm27206-201ENSMUST00000154038 979 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Chrac1Q9JKP8 Gm22846-201ENSMUST00000157706 270 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Chrac1Q9JKP8 1700007P06Rik-201ENSMUST00000160380 823 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Chrac1Q9JKP8 Gm18734-201ENSMUST00000172937 808 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Chrac1Q9JKP8 Ssty2-201ENSMUST00000179136 684 ntAPPRIS P1 BASIC11□□□□□ -0.65
Chrac1Q9JKP8 Ssty2-202ENSMUST00000190565 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Chrac1Q9JKP8 Gm7504-201ENSMUST00000201449 424 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Chrac1Q9JKP8 Gm17825-201ENSMUST00000206836 794 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Chrac1Q9JKP8 Pbld1-204ENSMUST00000219045 602 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Chrac1Q9JKP8 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.7 ms