Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERE8

Tlnrd1, Talin rod domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 362 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tlnrd1Q9ERE8 Gm13205-201ENSMUST00000123548 562 ntTSL 3 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Tlnrd1Q9ERE8 Gm13869-201ENSMUST00000146978 1054 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Tlnrd1Q9ERE8 C8g-201ENSMUST00000015227 822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Tlnrd1Q9ERE8 Gm13165-201ENSMUST00000152923 383 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Tlnrd1Q9ERE8 Gm5616-201ENSMUST00000165252 384 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Tlnrd1Q9ERE8 Ccdc188-201ENSMUST00000167061 747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Tlnrd1Q9ERE8 Gm8741-201ENSMUST00000174736 384 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Tlnrd1Q9ERE8 Gm34728-201ENSMUST00000201510 414 ntTSL 3 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Tlnrd1Q9ERE8 4930578M07Rik-202ENSMUST00000212946 552 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Tlnrd1Q9ERE8 Gm7293-201ENSMUST00000216682 1007 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Tlnrd1Q9ERE8 Gm9176-201ENSMUST00000219955 1120 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Tlnrd1Q9ERE8 Olfr1347-205ENSMUST00000220413 964 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Tlnrd1Q9ERE8 Gm19605-202ENSMUST00000221514 1084 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Tlnrd1Q9ERE8 1810062G17Rik-201ENSMUST00000029268 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Tlnrd1Q9ERE8 Olfr1347-201ENSMUST00000036357 964 ntAPPRIS P1 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Tlnrd1Q9ERE8 Gm11555-201ENSMUST00000073126 492 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Tlnrd1Q9ERE8 Gm12166-201ENSMUST00000093169 958 ntAPPRIS P1 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Tlnrd1Q9ERE8 Dnajb12-203ENSMUST00000142819 1495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Tlnrd1Q9ERE8 Adgrv1-214ENSMUST00000224088 1492 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Tlnrd1Q9ERE8 Smpd4-219ENSMUST00000170366 2256 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Tlnrd1Q9ERE8 Smarca2-209ENSMUST00000176030 5862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Tlnrd1Q9ERE8 Gm807-201ENSMUST00000181742 1723 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Tlnrd1Q9ERE8 Fam47e-202ENSMUST00000131166 1500 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Tlnrd1Q9ERE8 Zfp236-202ENSMUST00000182122 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Tlnrd1Q9ERE8 Tyw1-202ENSMUST00000044204 4698 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Tlnrd1Q9ERE8 Camta2-201ENSMUST00000036299 4495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Tlnrd1Q9ERE8 Prr5l-210ENSMUST00000171088 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Tlnrd1Q9ERE8 Tor1aip2-201ENSMUST00000060404 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Tlnrd1Q9ERE8 Brat1-203ENSMUST00000110806 3854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Tlnrd1Q9ERE8 Arhgap25-201ENSMUST00000071024 2635 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Tlnrd1Q9ERE8 Stk17b-201ENSMUST00000027263 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Tlnrd1Q9ERE8 Zmiz2-205ENSMUST00000109787 4116 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Tlnrd1Q9ERE8 Ifit1bl1-202ENSMUST00000168254 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Tlnrd1Q9ERE8 Tram2-201ENSMUST00000037998 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Tlnrd1Q9ERE8 Tcn2-207ENSMUST00000109993 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Tlnrd1Q9ERE8 Rabgef1-203ENSMUST00000119797 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Tlnrd1Q9ERE8 Slc5a9-201ENSMUST00000102719 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Tlnrd1Q9ERE8 Olfr222-202ENSMUST00000214351 2474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Tlnrd1Q9ERE8 Tfdp1-204ENSMUST00000209885 2511 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Tlnrd1Q9ERE8 Itgal-205ENSMUST00000170971 3662 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Tlnrd1Q9ERE8 4930517G19Rik-201ENSMUST00000206152 1676 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Tlnrd1Q9ERE8 Gm46355-201ENSMUST00000221434 1671 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Tlnrd1Q9ERE8 4833405L11Rik-202ENSMUST00000222639 2145 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Tlnrd1Q9ERE8 Itih3-205ENSMUST00000227995 2100 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Tlnrd1Q9ERE8 Lgals12-201ENSMUST00000079902 2590 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Tlnrd1Q9ERE8 Ciita-201ENSMUST00000023147 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Tlnrd1Q9ERE8 1700017B05Rik-201ENSMUST00000034846 4152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Tlnrd1Q9ERE8 4933408B17Rik-201ENSMUST00000056932 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Tlnrd1Q9ERE8 Crcp-201ENSMUST00000026608 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Tlnrd1Q9ERE8 Zmym3-209ENSMUST00000121520 5564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Tlnrd1Q9ERE8 Ccdc190-201ENSMUST00000094348 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Tlnrd1Q9ERE8 Dip2a-205ENSMUST00000160048 6551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Tlnrd1Q9ERE8 Gm829-202ENSMUST00000146622 722 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Tlnrd1Q9ERE8 Gm7568-202ENSMUST00000160446 709 ntTSL 3 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Tlnrd1Q9ERE8 Tepp-204ENSMUST00000161029 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Tlnrd1Q9ERE8 Rpl41-203ENSMUST00000176683 437 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Tlnrd1Q9ERE8 Adtrp-204ENSMUST00000179758 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Tlnrd1Q9ERE8 Swi5-207ENSMUST00000183946 768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Tlnrd1Q9ERE8 Pfn1-201ENSMUST00000018437 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Tlnrd1Q9ERE8 Gm43184-201ENSMUST00000197247 542 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Tlnrd1Q9ERE8 Emp3-203ENSMUST00000210297 601 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Tlnrd1Q9ERE8 Olfr981-201ENSMUST00000059859 997 ntAPPRIS P1 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Tlnrd1Q9ERE8 4930564D02Rik-201ENSMUST00000070584 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Tlnrd1Q9ERE8 Sh3tc2-201ENSMUST00000051720 4536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Tlnrd1Q9ERE8 Gm20125-205ENSMUST00000208005 1979 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Tlnrd1Q9ERE8 Fdxacb1-201ENSMUST00000042391 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Tlnrd1Q9ERE8 Mdm1-203ENSMUST00000164077 2922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Tlnrd1Q9ERE8 E030026E10Rik-201ENSMUST00000200395 2217 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Tlnrd1Q9ERE8 AC160562.2-201ENSMUST00000216374 2201 ntTSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Tlnrd1Q9ERE8 Strada-202ENSMUST00000103072 1517 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Tlnrd1Q9ERE8 Dab2-211ENSMUST00000161812 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Tlnrd1Q9ERE8 Nr1i3-202ENSMUST00000075469 1305 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Tlnrd1Q9ERE8 Zc3h12a-201ENSMUST00000036188 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Tlnrd1Q9ERE8 Art3-201ENSMUST00000113083 1561 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Tlnrd1Q9ERE8 4930563E18Rik-201ENSMUST00000180948 1553 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Tlnrd1Q9ERE8 4833411C07Rik-202ENSMUST00000207914 1568 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Tlnrd1Q9ERE8 Dmbx1-203ENSMUST00000124071 4017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Tlnrd1Q9ERE8 Zfp827-203ENSMUST00000119254 4549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Tlnrd1Q9ERE8 Zfp609-201ENSMUST00000159109 7777 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Tlnrd1Q9ERE8 Gm21986-201ENSMUST00000113671 5560 ntTSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Tlnrd1Q9ERE8 Scamp1-203ENSMUST00000152555 1877 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Tlnrd1Q9ERE8 Fam53c-201ENSMUST00000049281 4475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Tlnrd1Q9ERE8 Fam118b-202ENSMUST00000063782 1662 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Tlnrd1Q9ERE8 Gm15609-201ENSMUST00000155610 2960 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Tlnrd1Q9ERE8 Gpr158-201ENSMUST00000055946 7171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Tlnrd1Q9ERE8 Pml-202ENSMUST00000114136 4343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Tlnrd1Q9ERE8 Pin1-201ENSMUST00000034689 3843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Tlnrd1Q9ERE8 Vipas39-202ENSMUST00000072744 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Tlnrd1Q9ERE8 Dhx34-204ENSMUST00000121123 3880 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Tlnrd1Q9ERE8 BC035947-201ENSMUST00000170511 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Tlnrd1Q9ERE8 Hdac9-206ENSMUST00000209990 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Tlnrd1Q9ERE8 Tuft1-204ENSMUST00000196733 2555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Tlnrd1Q9ERE8 Ankrd26-201ENSMUST00000112830 6930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Tlnrd1Q9ERE8 Slc6a9-202ENSMUST00000063857 3146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Tlnrd1Q9ERE8 1700010I14Rik-201ENSMUST00000024650 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Tlnrd1Q9ERE8 9430064I24Rik-201ENSMUST00000206516 2669 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Tlnrd1Q9ERE8 Spint5-201ENSMUST00000103097 443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Tlnrd1Q9ERE8 Ighv2-6-8-201ENSMUST00000103455 342 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Tlnrd1Q9ERE8 Gm26286-201ENSMUST00000104166 134 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Tlnrd1Q9ERE8 Gm11596-201ENSMUST00000105058 1079 ntAPPRIS P1 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.6 ms