Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB90

Smg9, Protein SMG9, mousemouse

Predictions only

Length 520 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smg9Q9DB90 Gm26670-202ENSMUST00000226862 340 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Smg9Q9DB90 AC122035.1-201ENSMUST00000227576 1016 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Smg9Q9DB90 Cxcl1-201ENSMUST00000031327 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Smg9Q9DB90 Lect2-201ENSMUST00000062806 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Smg9Q9DB90 Cast-212ENSMUST00000223309 1529 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Smg9Q9DB90 Fcrl1-203ENSMUST00000167200 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Smg9Q9DB90 Alg12-201ENSMUST00000043087 1793 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Smg9Q9DB90 Cfb-202ENSMUST00000128767 2751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Smg9Q9DB90 Stat5b-202ENSMUST00000107358 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Smg9Q9DB90 Mterf3-201ENSMUST00000021991 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Smg9Q9DB90 Gm5641-201ENSMUST00000091130 1488 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Smg9Q9DB90 Dmbt1-206ENSMUST00000213064 5779 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Smg9Q9DB90 Oma1-201ENSMUST00000035780 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Smg9Q9DB90 Rapgef3-204ENSMUST00000128775 3586 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Smg9Q9DB90 Rbl2-210ENSMUST00000211136 4504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Smg9Q9DB90 Prdm9-205ENSMUST00000147532 1447 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Smg9Q9DB90 Vcp-201ENSMUST00000030164 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Smg9Q9DB90 Tubgcp4-201ENSMUST00000039541 4206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Smg9Q9DB90 Chd3-202ENSMUST00000108661 7261 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Smg9Q9DB90 Kcnma1-213ENSMUST00000188991 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Smg9Q9DB90 Pi16-202ENSMUST00000114701 2756 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Smg9Q9DB90 Epb41l1-203ENSMUST00000103136 6249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Smg9Q9DB90 Klhdc10-206ENSMUST00000144272 1387 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Smg9Q9DB90 Zbtb44-201ENSMUST00000115222 8861 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Smg9Q9DB90 Rasgrp4-205ENSMUST00000159975 2296 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Smg9Q9DB90 Srebf1-201ENSMUST00000020846 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Smg9Q9DB90 1700082M22Rik-201ENSMUST00000067136 2022 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Smg9Q9DB90 Gm29644-201ENSMUST00000189003 1341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Smg9Q9DB90 Tdrd9-201ENSMUST00000079009 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Smg9Q9DB90 Nrde2-201ENSMUST00000021596 3718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Smg9Q9DB90 Gm18210-201ENSMUST00000209001 1524 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Smg9Q9DB90 Csgalnact1-203ENSMUST00000130214 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Smg9Q9DB90 Frmd4a-202ENSMUST00000091497 6208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Smg9Q9DB90 Rbm10-202ENSMUST00000082089 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Smg9Q9DB90 Zdhhc21-202ENSMUST00000107239 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Smg9Q9DB90 Banf2-202ENSMUST00000110032 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Smg9Q9DB90 Gm15617-201ENSMUST00000118973 771 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Smg9Q9DB90 Gm12453-201ENSMUST00000121981 331 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Smg9Q9DB90 Gm15620-201ENSMUST00000122949 270 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Smg9Q9DB90 Gm13572-201ENSMUST00000153675 559 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Smg9Q9DB90 Gm12718-202ENSMUST00000156144 660 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Smg9Q9DB90 Ins2-208ENSMUST00000162317 297 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Smg9Q9DB90 Gm5294-201ENSMUST00000179205 651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Smg9Q9DB90 1110036E04Rik-201ENSMUST00000181151 777 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Smg9Q9DB90 Gm9162-201ENSMUST00000182081 991 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Smg9Q9DB90 Nmbr-206ENSMUST00000190114 662 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Smg9Q9DB90 C230057A21Rik-202ENSMUST00000195781 600 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Smg9Q9DB90 1700017M07Rik-201ENSMUST00000198307 940 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Smg9Q9DB90 Gm43249-201ENSMUST00000200464 458 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Smg9Q9DB90 Bcap31-201ENSMUST00000002091 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Smg9Q9DB90 AC122024.3-201ENSMUST00000217719 294 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Smg9Q9DB90 AC165260.5-201ENSMUST00000224640 1247 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Smg9Q9DB90 Capsl-202ENSMUST00000226688 739 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Smg9Q9DB90 Myoz2-201ENSMUST00000029761 1181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Smg9Q9DB90 Banf2-201ENSMUST00000037722 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Smg9Q9DB90 Gm8181-201ENSMUST00000062242 669 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Smg9Q9DB90 Taar7f-201ENSMUST00000071691 1077 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Smg9Q9DB90 Kdm5c-201ENSMUST00000082177 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Smg9Q9DB90 Myl9-201ENSMUST00000088552 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Smg9Q9DB90 Taar7d-201ENSMUST00000092657 1077 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Smg9Q9DB90 Lgr5-208ENSMUST00000173740 2508 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Smg9Q9DB90 Pigo-201ENSMUST00000067481 3525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Smg9Q9DB90 Pml-211ENSMUST00000153820 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Smg9Q9DB90 Preb-201ENSMUST00000074840 6300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Smg9Q9DB90 Slc45a4-201ENSMUST00000054266 4664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Smg9Q9DB90 Zdhhc6-205ENSMUST00000224291 2603 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Smg9Q9DB90 Paip2b-201ENSMUST00000058383 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Smg9Q9DB90 Prkcsh-202ENSMUST00000115331 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Smg9Q9DB90 Prdx2-202ENSMUST00000109733 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Smg9Q9DB90 Pde4b-206ENSMUST00000106907 1374 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Smg9Q9DB90 Yae1d1-204ENSMUST00000222796 1382 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Smg9Q9DB90 Dnajc13-201ENSMUST00000035170 8012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Smg9Q9DB90 Ank3-205ENSMUST00000092433 5072 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Smg9Q9DB90 Pnpla6-202ENSMUST00000111070 4496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Smg9Q9DB90 Susd5-201ENSMUST00000135338 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Smg9Q9DB90 Ttbk1-203ENSMUST00000225808 8926 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Smg9Q9DB90 Ltbp2-201ENSMUST00000002073 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Smg9Q9DB90 Sept11-201ENSMUST00000074733 5028 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Smg9Q9DB90 Kctd18-210ENSMUST00000164963 2114 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Smg9Q9DB90 Platr25-207ENSMUST00000222477 1705 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Smg9Q9DB90 Ikbip-201ENSMUST00000020149 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Smg9Q9DB90 Gm37014-201ENSMUST00000194723 2253 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Smg9Q9DB90 Ankrd31-203ENSMUST00000208758 5859 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Smg9Q9DB90 Pde9a-201ENSMUST00000047168 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Smg9Q9DB90 Pfkfb3-202ENSMUST00000049849 2076 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Smg9Q9DB90 Atp1b2-201ENSMUST00000047889 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Smg9Q9DB90 Accs-202ENSMUST00000068513 1872 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Smg9Q9DB90 1500004A13Rik-209ENSMUST00000185189 1659 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Smg9Q9DB90 Platr19-201ENSMUST00000171380 1466 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Smg9Q9DB90 Clec10a-201ENSMUST00000000327 1454 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Smg9Q9DB90 Reps1-201ENSMUST00000126390 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Smg9Q9DB90 Crybg2-201ENSMUST00000121391 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Smg9Q9DB90 1700036A12Rik-202ENSMUST00000190053 1828 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Smg9Q9DB90 Gm11554-201ENSMUST00000105056 890 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Smg9Q9DB90 Apoc3-202ENSMUST00000118649 453 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Smg9Q9DB90 Gm11979-201ENSMUST00000119629 743 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Smg9Q9DB90 Zfp133-ps-204ENSMUST00000149523 424 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Smg9Q9DB90 2210406O10Rik-203ENSMUST00000149687 1198 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Smg9Q9DB90 Gm10631-201ENSMUST00000153288 494 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Smg9Q9DB90 Gstt3-203ENSMUST00000173537 687 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.2 ms