Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2C9

Snapc3, snRNA-activating protein complex subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 407 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snapc3Q9D2C9 Brat1-202ENSMUST00000100505 3431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Snapc3Q9D2C9 Ets2-201ENSMUST00000023612 3890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Snapc3Q9D2C9 Zdhhc6-205ENSMUST00000224291 2603 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Snapc3Q9D2C9 Pigq-219ENSMUST00000208071 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Snapc3Q9D2C9 Mapre2-203ENSMUST00000118826 3052 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Snapc3Q9D2C9 Cct3-204ENSMUST00000164166 1804 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Snapc3Q9D2C9 AC155245.1-201ENSMUST00000222266 1804 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Snapc3Q9D2C9 Elmod3-201ENSMUST00000070990 2122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Snapc3Q9D2C9 Dync1i2-208ENSMUST00000112144 2565 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Snapc3Q9D2C9 Ncf1-202ENSMUST00000111275 2721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Snapc3Q9D2C9 Sec14l1-202ENSMUST00000090433 4654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Snapc3Q9D2C9 Pfkfb3-202ENSMUST00000049849 2076 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Snapc3Q9D2C9 4933424N20Rik-201ENSMUST00000200749 1463 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Snapc3Q9D2C9 Tab1-201ENSMUST00000023050 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Snapc3Q9D2C9 Nin-201ENSMUST00000021468 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Snapc3Q9D2C9 Ldb3-202ENSMUST00000022328 2468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Snapc3Q9D2C9 Dhx34-201ENSMUST00000094816 4073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Snapc3Q9D2C9 Myh1-201ENSMUST00000018637 5938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Snapc3Q9D2C9 Fam53c-201ENSMUST00000049281 4475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Snapc3Q9D2C9 Slc6a21-201ENSMUST00000085364 1732 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Snapc3Q9D2C9 Tctn3-201ENSMUST00000025981 2743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Snapc3Q9D2C9 Zfp654-202ENSMUST00000207826 6261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Snapc3Q9D2C9 Alms1-ps2-202ENSMUST00000161983 2290 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Snapc3Q9D2C9 Gm37333-201ENSMUST00000192904 2251 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Snapc3Q9D2C9 Fgf8-204ENSMUST00000111925 702 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Snapc3Q9D2C9 Gm16481-201ENSMUST00000119074 1227 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Snapc3Q9D2C9 Gm12266-201ENSMUST00000120311 962 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Snapc3Q9D2C9 4933406I18Rik-201ENSMUST00000124673 905 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Snapc3Q9D2C9 2010001A14Rik-203ENSMUST00000152790 714 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Snapc3Q9D2C9 Fhit-204ENSMUST00000161302 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Snapc3Q9D2C9 1110038B12Rik-208ENSMUST00000174714 520 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Snapc3Q9D2C9 Gm29499-201ENSMUST00000189151 486 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Snapc3Q9D2C9 Gm28329-201ENSMUST00000191208 689 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Snapc3Q9D2C9 Gm29171-201ENSMUST00000191397 486 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Snapc3Q9D2C9 Rpl36-ps9-201ENSMUST00000196458 277 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Snapc3Q9D2C9 Gm5996-201ENSMUST00000211110 718 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Snapc3Q9D2C9 Ift43-205ENSMUST00000222821 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Snapc3Q9D2C9 AC125070.1-201ENSMUST00000223523 555 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Snapc3Q9D2C9 Tex35-201ENSMUST00000027884 909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Snapc3Q9D2C9 Krtap19-5-201ENSMUST00000053460 483 ntAPPRIS P1 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Snapc3Q9D2C9 Olfr411-201ENSMUST00000080365 1049 ntAPPRIS P1 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Snapc3Q9D2C9 1700030K09Rik-202ENSMUST00000121902 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Snapc3Q9D2C9 Tank-204ENSMUST00000112501 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Snapc3Q9D2C9 Gm5420-201ENSMUST00000071008 2206 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Snapc3Q9D2C9 6430550D23Rik-201ENSMUST00000086145 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Snapc3Q9D2C9 Fam228a-201ENSMUST00000111154 3004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Snapc3Q9D2C9 Pa2g4-202ENSMUST00000131728 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Snapc3Q9D2C9 Akap12-201ENSMUST00000045730 6195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Snapc3Q9D2C9 Ipo4-201ENSMUST00000047131 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Snapc3Q9D2C9 Zfp85os-202ENSMUST00000143812 1784 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Snapc3Q9D2C9 Gm11924-201ENSMUST00000152306 1750 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Snapc3Q9D2C9 Col20a1-201ENSMUST00000108856 4489 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Snapc3Q9D2C9 Anxa11-202ENSMUST00000112364 1625 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Snapc3Q9D2C9 Armcx6-201ENSMUST00000052431 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Snapc3Q9D2C9 Lpin3-204ENSMUST00000109457 3215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Snapc3Q9D2C9 Calu-201ENSMUST00000031779 3229 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Snapc3Q9D2C9 Adra2b-202ENSMUST00000104934 4014 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Snapc3Q9D2C9 Dgkh-202ENSMUST00000226342 15261 ntAPPRIS P1 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Snapc3Q9D2C9 Rad51b-202ENSMUST00000171210 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Snapc3Q9D2C9 Usp17le-202ENSMUST00000211384 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Snapc3Q9D2C9 8430408G22Rik-202ENSMUST00000178241 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Snapc3Q9D2C9 Gm45765-202ENSMUST00000212921 1313 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Snapc3Q9D2C9 4930594M22Rik-202ENSMUST00000161599 3595 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Snapc3Q9D2C9 Uhrf1-202ENSMUST00000113035 3402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Snapc3Q9D2C9 Eno3-202ENSMUST00000108548 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Snapc3Q9D2C9 AC164092.1-201ENSMUST00000215635 2232 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Snapc3Q9D2C9 Rims1-204ENSMUST00000097810 6362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Snapc3Q9D2C9 Wdr31-202ENSMUST00000107452 1437 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Snapc3Q9D2C9 Gm5171-201ENSMUST00000214944 1415 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Snapc3Q9D2C9 H2-M3-201ENSMUST00000038580 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Snapc3Q9D2C9 Unc45a-202ENSMUST00000107368 3635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Snapc3Q9D2C9 Dclk2-202ENSMUST00000191752 8042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Snapc3Q9D2C9 Mlc1-202ENSMUST00000109368 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Snapc3Q9D2C9 Timeless-201ENSMUST00000055539 4457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Snapc3Q9D2C9 Ighg2c-201ENSMUST00000103416 1214 ntAPPRIS P5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Snapc3Q9D2C9 Gm15566-201ENSMUST00000121130 590 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Snapc3Q9D2C9 Gm15329-201ENSMUST00000121408 155 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Snapc3Q9D2C9 Rab15-203ENSMUST00000121716 739 ntTSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Snapc3Q9D2C9 Gm11290-201ENSMUST00000124833 396 ntTSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Snapc3Q9D2C9 Ccdc127-205ENSMUST00000162672 677 ntTSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Snapc3Q9D2C9 Gm27552-201ENSMUST00000183351 62 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Snapc3Q9D2C9 Gm27844-201ENSMUST00000183613 62 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Snapc3Q9D2C9 Gm12057-202ENSMUST00000189990 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Snapc3Q9D2C9 Gm33222-201ENSMUST00000193725 654 ntTSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Snapc3Q9D2C9 Gm43349-201ENSMUST00000200047 503 ntTSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Snapc3Q9D2C9 Gm7504-201ENSMUST00000201449 424 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Snapc3Q9D2C9 Gm18539-201ENSMUST00000204745 1090 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Snapc3Q9D2C9 1700003I16Rik-201ENSMUST00000205198 1058 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Snapc3Q9D2C9 Itgax-203ENSMUST00000205460 1215 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Snapc3Q9D2C9 Fabp4-201ENSMUST00000029041 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Snapc3Q9D2C9 Gm9785-201ENSMUST00000062642 1006 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Snapc3Q9D2C9 Elf2-206ENSMUST00000163748 2656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Snapc3Q9D2C9 Jade1-201ENSMUST00000026865 5481 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Snapc3Q9D2C9 Rab11fip2-202ENSMUST00000170819 1539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Snapc3Q9D2C9 Pcdh10-202ENSMUST00000170695 8234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Snapc3Q9D2C9 Ctsb-201ENSMUST00000006235 4743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Snapc3Q9D2C9 Impa1-202ENSMUST00000118410 2988 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Snapc3Q9D2C9 Gadl1-202ENSMUST00000119291 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Snapc3Q9D2C9 Esr2-205ENSMUST00000218621 3342 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Snapc3Q9D2C9 Gpr68-201ENSMUST00000053668 3099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms