Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0F6

Rfc5, Replication factor C subunit 5, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rfc5Q9D0F6 Lypd6-202ENSMUST00000112712 3495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rfc5Q9D0F6 Lrrn1-201ENSMUST00000049285 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rfc5Q9D0F6 Sec16a-202ENSMUST00000114082 8797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rfc5Q9D0F6 Gm16237-201ENSMUST00000156666 1319 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rfc5Q9D0F6 Sertad3-201ENSMUST00000068641 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rfc5Q9D0F6 Rnf6-201ENSMUST00000067837 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rfc5Q9D0F6 Tmem132a-201ENSMUST00000025645 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rfc5Q9D0F6 L3mbtl2-208ENSMUST00000174229 2578 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rfc5Q9D0F6 Olfr755-ps1-201ENSMUST00000173568 910 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Rfc5Q9D0F6 Gm25072-201ENSMUST00000175233 235 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Rfc5Q9D0F6 Gm28727-201ENSMUST00000176549 443 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rfc5Q9D0F6 Dpf3-206ENSMUST00000177959 1298 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rfc5Q9D0F6 Gm10100-201ENSMUST00000179726 363 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rfc5Q9D0F6 1110036E04Rik-201ENSMUST00000181151 777 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rfc5Q9D0F6 Gm4753-201ENSMUST00000188327 1255 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Rfc5Q9D0F6 Gm5100-201ENSMUST00000195631 589 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Rfc5Q9D0F6 Gm31401-201ENSMUST00000207352 734 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rfc5Q9D0F6 Olfr567-ps1-201ENSMUST00000210349 857 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Rfc5Q9D0F6 Gm10752-201ENSMUST00000218348 729 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Rfc5Q9D0F6 AC122035.1-201ENSMUST00000227576 1016 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Rfc5Q9D0F6 Crygb-201ENSMUST00000027090 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rfc5Q9D0F6 Smco2-201ENSMUST00000032433 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rfc5Q9D0F6 Nme6-201ENSMUST00000035053 1074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rfc5Q9D0F6 Igsf3-201ENSMUST00000043983 7371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rfc5Q9D0F6 Rbm4b-201ENSMUST00000036744 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rfc5Q9D0F6 Psapl1-201ENSMUST00000052224 2548 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rfc5Q9D0F6 Qrich1-202ENSMUST00000112155 3040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rfc5Q9D0F6 Rsc1a1-201ENSMUST00000105782 1749 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rfc5Q9D0F6 Zim1-203ENSMUST00000203908 1740 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rfc5Q9D0F6 Celf1-204ENSMUST00000111448 4432 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rfc5Q9D0F6 A530032D15Rik-201ENSMUST00000160792 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rfc5Q9D0F6 Cacna1c-205ENSMUST00000112825 7577 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rfc5Q9D0F6 Mov10l1-203ENSMUST00000146993 4133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rfc5Q9D0F6 Slc39a6-201ENSMUST00000070726 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rfc5Q9D0F6 Ndc1-204ENSMUST00000139560 4584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rfc5Q9D0F6 Ecd-201ENSMUST00000022344 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rfc5Q9D0F6 Acsl6-208ENSMUST00000108899 1662 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rfc5Q9D0F6 Tsga10-202ENSMUST00000088072 3837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rfc5Q9D0F6 Prdm9-205ENSMUST00000147532 1447 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rfc5Q9D0F6 Gm14698-201ENSMUST00000096420 4226 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rfc5Q9D0F6 Aldh1a7-201ENSMUST00000025656 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rfc5Q9D0F6 Itpr3-201ENSMUST00000049308 8990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rfc5Q9D0F6 Gm5308-201ENSMUST00000196752 1354 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Rfc5Q9D0F6 Sirt5-201ENSMUST00000066804 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rfc5Q9D0F6 AC155245.1-201ENSMUST00000222266 1804 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Rfc5Q9D0F6 Nnt-203ENSMUST00000109204 3198 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rfc5Q9D0F6 Xkr5-201ENSMUST00000055503 3176 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rfc5Q9D0F6 Pias2-203ENSMUST00000168882 4984 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rfc5Q9D0F6 Gm1110-201ENSMUST00000115261 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rfc5Q9D0F6 Ces2a-201ENSMUST00000034346 1960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rfc5Q9D0F6 Zmiz2-205ENSMUST00000109787 4116 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rfc5Q9D0F6 Gm26584-201ENSMUST00000180551 3216 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rfc5Q9D0F6 Tcf4-234ENSMUST00000201410 1915 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rfc5Q9D0F6 Krtap4-9-201ENSMUST00000105059 1059 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rfc5Q9D0F6 Gm13326-201ENSMUST00000118730 1011 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Rfc5Q9D0F6 Mfsd14b-203ENSMUST00000155487 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rfc5Q9D0F6 4930405O22Rik-201ENSMUST00000164605 954 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rfc5Q9D0F6 Ddt-201ENSMUST00000001716 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rfc5Q9D0F6 Rps28-203ENSMUST00000173019 437 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rfc5Q9D0F6 AU020206-201ENSMUST00000181224 656 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rfc5Q9D0F6 Gm28324-201ENSMUST00000187913 264 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Rfc5Q9D0F6 C630004L07Rik-201ENSMUST00000193236 1275 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Rfc5Q9D0F6 Gm39288-201ENSMUST00000210554 446 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Rfc5Q9D0F6 AC155266.1-201ENSMUST00000220762 904 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Rfc5Q9D0F6 Gm18363-201ENSMUST00000221671 730 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Rfc5Q9D0F6 AC153152.3-201ENSMUST00000222188 1135 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Rfc5Q9D0F6 Ly6i-201ENSMUST00000023250 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rfc5Q9D0F6 Apbb1-201ENSMUST00000081165 2530 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rfc5Q9D0F6 Olfr658-202ENSMUST00000210641 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rfc5Q9D0F6 Olfr658-201ENSMUST00000089296 2912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rfc5Q9D0F6 Alas2-202ENSMUST00000112715 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rfc5Q9D0F6 Map4-205ENSMUST00000165876 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rfc5Q9D0F6 Tcf4-238ENSMUST00000201631 2660 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rfc5Q9D0F6 Ciz1-204ENSMUST00000113334 2871 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rfc5Q9D0F6 Fbxo15-201ENSMUST00000037718 1437 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rfc5Q9D0F6 Slc45a4-201ENSMUST00000054266 4664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rfc5Q9D0F6 Gm26811-201ENSMUST00000181258 5485 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rfc5Q9D0F6 Zfp37-206ENSMUST00000222050 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rfc5Q9D0F6 Daxx-207ENSMUST00000174146 2424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rfc5Q9D0F6 Pde4c-201ENSMUST00000034307 3203 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rfc5Q9D0F6 Zfp426-202ENSMUST00000115562 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rfc5Q9D0F6 Gimap5-201ENSMUST00000055558 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rfc5Q9D0F6 Pip4k2c-201ENSMUST00000013970 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rfc5Q9D0F6 Gabra1-201ENSMUST00000020707 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rfc5Q9D0F6 Tmeff2-202ENSMUST00000114565 2718 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rfc5Q9D0F6 Gm10419-202ENSMUST00000196693 2530 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rfc5Q9D0F6 Sept9-205ENSMUST00000106354 3869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rfc5Q9D0F6 Zfp862-ps-201ENSMUST00000203457 3282 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Rfc5Q9D0F6 Gm14025-201ENSMUST00000145798 4242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rfc5Q9D0F6 Mier3-201ENSMUST00000047412 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rfc5Q9D0F6 Gipr-201ENSMUST00000094790 2856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rfc5Q9D0F6 Nmnat1-203ENSMUST00000119921 2657 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rfc5Q9D0F6 Gaa-203ENSMUST00000106259 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rfc5Q9D0F6 Ino80c-204ENSMUST00000153360 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rfc5Q9D0F6 Gm26615-201ENSMUST00000181522 3201 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rfc5Q9D0F6 Clec4a3-201ENSMUST00000088468 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rfc5Q9D0F6 Kcnh6-202ENSMUST00000106903 2816 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rfc5Q9D0F6 Lrp8-203ENSMUST00000106732 2648 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rfc5Q9D0F6 Gm37849-201ENSMUST00000194722 1881 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Rfc5Q9D0F6 Prkar1a-201ENSMUST00000049527 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.6 ms