Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXT8

Pmpcb, Mitochondrial-processing peptidase subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 489 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PmpcbQ9CXT8 Gm13422-201ENSMUST00000118834 504 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
PmpcbQ9CXT8 Gm16071-201ENSMUST00000119589 793 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
PmpcbQ9CXT8 1700003G13Rik-202ENSMUST00000131342 705 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
PmpcbQ9CXT8 Cfap100-204ENSMUST00000134224 849 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
PmpcbQ9CXT8 Rdh9-203ENSMUST00000136223 1276 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
PmpcbQ9CXT8 Nr5a1os-201ENSMUST00000146954 926 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
PmpcbQ9CXT8 Spdye4a-202ENSMUST00000160502 1245 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
PmpcbQ9CXT8 Gm17391-201ENSMUST00000171036 126 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
PmpcbQ9CXT8 Mrip-ps-201ENSMUST00000184613 940 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
PmpcbQ9CXT8 Gm17826-201ENSMUST00000189720 798 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
PmpcbQ9CXT8 Med8-201ENSMUST00000019229 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
PmpcbQ9CXT8 Gm37458-201ENSMUST00000194055 410 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
PmpcbQ9CXT8 A430050A11Rik-201ENSMUST00000195348 646 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
PmpcbQ9CXT8 Fxr1-206ENSMUST00000198051 2127 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
PmpcbQ9CXT8 Gm43349-201ENSMUST00000200047 503 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
PmpcbQ9CXT8 Gm44980-201ENSMUST00000205826 314 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
PmpcbQ9CXT8 Psenen-203ENSMUST00000207747 669 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
PmpcbQ9CXT8 AC125486.1-201ENSMUST00000218701 320 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
PmpcbQ9CXT8 Gm19046-201ENSMUST00000221263 1298 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
PmpcbQ9CXT8 Gm6430-201ENSMUST00000054664 1248 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
PmpcbQ9CXT8 Hopx-201ENSMUST00000081964 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
PmpcbQ9CXT8 Gm10702-201ENSMUST00000098929 1268 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
PmpcbQ9CXT8 Lrrc55-201ENSMUST00000099930 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
PmpcbQ9CXT8 Fam107b-201ENSMUST00000027965 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
PmpcbQ9CXT8 Nod1-201ENSMUST00000060655 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
PmpcbQ9CXT8 Gm15674-201ENSMUST00000143266 2438 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
PmpcbQ9CXT8 Zfp68-203ENSMUST00000110905 4749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
PmpcbQ9CXT8 Ascc2-202ENSMUST00000109930 4844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
PmpcbQ9CXT8 Maml3-202ENSMUST00000121440 8288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
PmpcbQ9CXT8 Pcgf3-201ENSMUST00000046975 7708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
PmpcbQ9CXT8 Syncrip-208ENSMUST00000174282 3404 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
PmpcbQ9CXT8 Acsm2-202ENSMUST00000098084 2099 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
PmpcbQ9CXT8 AC164426.2-201ENSMUST00000225993 2492 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
PmpcbQ9CXT8 Pip5k1a-205ENSMUST00000107233 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
PmpcbQ9CXT8 Oard1-202ENSMUST00000167180 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
PmpcbQ9CXT8 Scn8a-203ENSMUST00000108908 7030 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
PmpcbQ9CXT8 Wdr31-202ENSMUST00000107452 1437 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
PmpcbQ9CXT8 Rab11fip2-202ENSMUST00000170819 1539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
PmpcbQ9CXT8 Prdx2-201ENSMUST00000005292 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
PmpcbQ9CXT8 Anxa9-204ENSMUST00000164406 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
PmpcbQ9CXT8 AC174797.1-201ENSMUST00000224339 1649 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
PmpcbQ9CXT8 Jade1-201ENSMUST00000026865 5481 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
PmpcbQ9CXT8 Tcim-201ENSMUST00000052622 1805 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
PmpcbQ9CXT8 Asns-202ENSMUST00000115542 2016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
PmpcbQ9CXT8 Gm36940-201ENSMUST00000194281 2036 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
PmpcbQ9CXT8 Phactr1-201ENSMUST00000066928 2013 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
PmpcbQ9CXT8 Elmod3-201ENSMUST00000070990 2122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
PmpcbQ9CXT8 9430015G10Rik-201ENSMUST00000072554 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
PmpcbQ9CXT8 Ccdc129-201ENSMUST00000044729 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
PmpcbQ9CXT8 Fbn2-201ENSMUST00000025497 10480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
PmpcbQ9CXT8 Tmcc2-203ENSMUST00000132435 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
PmpcbQ9CXT8 Tmem134-216ENSMUST00000171743 3701 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
PmpcbQ9CXT8 Nlrp6-201ENSMUST00000106045 3823 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
PmpcbQ9CXT8 Dnmt3a-203ENSMUST00000111186 5424 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
PmpcbQ9CXT8 4930594M22Rik-202ENSMUST00000161599 3595 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
PmpcbQ9CXT8 Gtf2ird2-201ENSMUST00000016086 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
PmpcbQ9CXT8 Kirrel2-201ENSMUST00000045817 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
PmpcbQ9CXT8 Spata5-202ENSMUST00000108112 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
PmpcbQ9CXT8 Spock3-203ENSMUST00000118003 2860 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
PmpcbQ9CXT8 Ces2d-ps-201ENSMUST00000043209 1656 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
PmpcbQ9CXT8 Kng2-203ENSMUST00000115349 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
PmpcbQ9CXT8 Gm44153-201ENSMUST00000204162 1580 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
PmpcbQ9CXT8 Pbx1-205ENSMUST00000176540 6876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
PmpcbQ9CXT8 Use1-202ENSMUST00000110053 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
PmpcbQ9CXT8 Gm4993-201ENSMUST00000118719 1174 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
PmpcbQ9CXT8 Gm15131-201ENSMUST00000119124 595 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
PmpcbQ9CXT8 Csf1-204ENSMUST00000120654 821 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
PmpcbQ9CXT8 Gm11246-201ENSMUST00000120880 345 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
PmpcbQ9CXT8 Dnmt3bos-201ENSMUST00000124988 718 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
PmpcbQ9CXT8 Anp32a-205ENSMUST00000135395 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
PmpcbQ9CXT8 2310057J18Rik-204ENSMUST00000152363 1043 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
PmpcbQ9CXT8 Bhmt-ps1-201ENSMUST00000178743 1224 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
PmpcbQ9CXT8 Gm27438-201ENSMUST00000183480 110 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
PmpcbQ9CXT8 Gm27910-201ENSMUST00000185004 107 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
PmpcbQ9CXT8 Gm28694-201ENSMUST00000190681 722 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
PmpcbQ9CXT8 Ccdc12-201ENSMUST00000019803 834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
PmpcbQ9CXT8 Sox2ot-217ENSMUST00000200414 710 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
PmpcbQ9CXT8 Crcp-204ENSMUST00000202163 931 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
PmpcbQ9CXT8 Chn2-212ENSMUST00000204115 783 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
PmpcbQ9CXT8 Gm44545-201ENSMUST00000208262 746 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
PmpcbQ9CXT8 Gm29961-201ENSMUST00000214692 644 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
PmpcbQ9CXT8 Timm9-201ENSMUST00000021486 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
PmpcbQ9CXT8 Acy1-209ENSMUST00000215395 1051 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
PmpcbQ9CXT8 AC101677.2-201ENSMUST00000218733 741 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
PmpcbQ9CXT8 Hmgb1-202ENSMUST00000093196 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
PmpcbQ9CXT8 Smtn-202ENSMUST00000020721 3335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
PmpcbQ9CXT8 Gm26811-201ENSMUST00000181258 5485 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
PmpcbQ9CXT8 Rad17-201ENSMUST00000022136 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
PmpcbQ9CXT8 Gm45234-201ENSMUST00000129411 4359 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
PmpcbQ9CXT8 Tmem132a-201ENSMUST00000025645 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
PmpcbQ9CXT8 Slc37a4-207ENSMUST00000215420 2128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
PmpcbQ9CXT8 Gem-202ENSMUST00000108304 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
PmpcbQ9CXT8 Tcn2-207ENSMUST00000109993 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
PmpcbQ9CXT8 Csf1r-202ENSMUST00000115268 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
PmpcbQ9CXT8 Gm14137-201ENSMUST00000069711 3067 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
PmpcbQ9CXT8 Platr6-201ENSMUST00000180731 1818 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
PmpcbQ9CXT8 Rufy2-202ENSMUST00000119567 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
PmpcbQ9CXT8 Zim1-203ENSMUST00000203908 1740 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
PmpcbQ9CXT8 Ippk-201ENSMUST00000021817 2856 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
PmpcbQ9CXT8 Gm38140-201ENSMUST00000193617 2755 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.6 ms