Protein–RNA interactions for Protein: Q99KN2

Ciao1, Probable cytosolic iron-sulfur protein assembly protein CIAO1, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ciao1Q99KN2 Gm18042-201ENSMUST00000219887 790 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Ciao1Q99KN2 AC167364.1-201ENSMUST00000221495 784 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ciao1Q99KN2 Gm31513-201ENSMUST00000223261 684 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ciao1Q99KN2 AC134793.1-202ENSMUST00000227444 803 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Ciao1Q99KN2 Gbgt1-201ENSMUST00000028172 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ciao1Q99KN2 Pbp2-201ENSMUST00000050471 1279 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ciao1Q99KN2 Psd3-213ENSMUST00000212505 3253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ciao1Q99KN2 Tubb1-201ENSMUST00000016399 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ciao1Q99KN2 Tmcc1-208ENSMUST00000173140 1910 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ciao1Q99KN2 Pou2f1-202ENSMUST00000069609 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ciao1Q99KN2 Bbs2-201ENSMUST00000034206 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ciao1Q99KN2 Anks1b-224ENSMUST00000182960 3397 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ciao1Q99KN2 Trmt2a-207ENSMUST00000140206 3520 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ciao1Q99KN2 Stxbp5l-201ENSMUST00000023526 3344 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ciao1Q99KN2 Smap1-202ENSMUST00000129254 1365 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ciao1Q99KN2 Oprm1-222ENSMUST00000135502 1363 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ciao1Q99KN2 Gtf2ird1-203ENSMUST00000100650 3487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ciao1Q99KN2 Mast3-203ENSMUST00000211948 4251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ciao1Q99KN2 Lrp2bp-201ENSMUST00000066451 1525 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ciao1Q99KN2 Olfml3-201ENSMUST00000029440 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ciao1Q99KN2 Gm7538-201ENSMUST00000200918 1348 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ciao1Q99KN2 Gm35363-201ENSMUST00000209330 1317 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ciao1Q99KN2 Ppp2r2cos-201ENSMUST00000152862 1491 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ciao1Q99KN2 Gm9951-202ENSMUST00000149618 1772 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ciao1Q99KN2 Srek1-201ENSMUST00000074616 3934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ciao1Q99KN2 Gm37969-201ENSMUST00000195777 3409 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Ciao1Q99KN2 Dcaf12-201ENSMUST00000030145 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ciao1Q99KN2 Scp2-202ENSMUST00000106701 772 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ciao1Q99KN2 1700071K01Rik-201ENSMUST00000117522 819 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Ciao1Q99KN2 Pcgf2-206ENSMUST00000169807 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ciao1Q99KN2 Ighv2-1-201ENSMUST00000170946 353 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Ciao1Q99KN2 Slc37a1-202ENSMUST00000171233 2929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ciao1Q99KN2 C230057A21Rik-202ENSMUST00000195781 600 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ciao1Q99KN2 Syde2-203ENSMUST00000200546 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ciao1Q99KN2 Gm33080-201ENSMUST00000205429 172 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Ciao1Q99KN2 Fosb-205ENSMUST00000208326 3654 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ciao1Q99KN2 Rspo2-203ENSMUST00000226810 3091 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ciao1Q99KN2 AC130477.1-201ENSMUST00000226982 420 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Ciao1Q99KN2 Becn1-205ENSMUST00000130916 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ciao1Q99KN2 Gm17230-201ENSMUST00000171194 3942 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Ciao1Q99KN2 Sec24d-201ENSMUST00000047923 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ciao1Q99KN2 Lgals8-201ENSMUST00000099820 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ciao1Q99KN2 Otud7b-201ENSMUST00000035519 8043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ciao1Q99KN2 Tmem151a-201ENSMUST00000077066 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ciao1Q99KN2 Olfr223-202ENSMUST00000215626 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ciao1Q99KN2 Wdfy2-201ENSMUST00000014691 6646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ciao1Q99KN2 Prdx2-201ENSMUST00000005292 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ciao1Q99KN2 Aldoa-202ENSMUST00000087566 1549 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ciao1Q99KN2 Col8a1-201ENSMUST00000089332 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ciao1Q99KN2 Pde4c-207ENSMUST00000224874 3099 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ciao1Q99KN2 Hgs-201ENSMUST00000026900 2908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ciao1Q99KN2 Spata7-203ENSMUST00000101146 1913 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ciao1Q99KN2 Pdcd10-205ENSMUST00000161137 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ciao1Q99KN2 Gm33677-201ENSMUST00000220074 2765 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ciao1Q99KN2 Kmt5b-207ENSMUST00000113974 4150 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ciao1Q99KN2 Tspan14-202ENSMUST00000224209 2477 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ciao1Q99KN2 Mfsd9-201ENSMUST00000039672 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ciao1Q99KN2 Epha7-204ENSMUST00000108194 2323 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ciao1Q99KN2 Hspa4l-208ENSMUST00000204702 9479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ciao1Q99KN2 Epb41-207ENSMUST00000105975 5235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ciao1Q99KN2 Rin2-202ENSMUST00000110005 4641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ciao1Q99KN2 Kdm2b-202ENSMUST00000046073 5180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ciao1Q99KN2 Il34-201ENSMUST00000076846 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ciao1Q99KN2 Srebf1-201ENSMUST00000020846 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ciao1Q99KN2 Zfp1-202ENSMUST00000211926 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ciao1Q99KN2 Ebf3-202ENSMUST00000106118 3736 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ciao1Q99KN2 Lrrn1-201ENSMUST00000049285 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ciao1Q99KN2 Smarca2-216ENSMUST00000176769 5703 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ciao1Q99KN2 Kcnk10-201ENSMUST00000110113 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ciao1Q99KN2 Taf9b-201ENSMUST00000055497 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ciao1Q99KN2 Zdhhc21-202ENSMUST00000107239 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ciao1Q99KN2 Gm11884-201ENSMUST00000131639 641 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ciao1Q99KN2 Gm22146-201ENSMUST00000157397 288 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Ciao1Q99KN2 Mipep-ps-201ENSMUST00000177439 291 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Ciao1Q99KN2 Gm20781-201ENSMUST00000193154 693 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Ciao1Q99KN2 Gm6677-201ENSMUST00000195100 441 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Ciao1Q99KN2 Gm21736-201ENSMUST00000195399 693 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Ciao1Q99KN2 Gm31274-201ENSMUST00000197356 229 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Ciao1Q99KN2 Gm42588-201ENSMUST00000200538 1297 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Ciao1Q99KN2 Klk1b15-ps-201ENSMUST00000206273 715 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Ciao1Q99KN2 Gm35713-201ENSMUST00000210516 199 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Ciao1Q99KN2 AC168279.1-201ENSMUST00000214611 382 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Ciao1Q99KN2 Gm6390-201ENSMUST00000215034 589 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Ciao1Q99KN2 Acy1-211ENSMUST00000216400 1030 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ciao1Q99KN2 Gm7959-201ENSMUST00000221823 1078 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Ciao1Q99KN2 AC164429.1-201ENSMUST00000224210 518 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Ciao1Q99KN2 Gm4604-201ENSMUST00000025040 390 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Ciao1Q99KN2 E330021D16Rik-201ENSMUST00000058713 1116 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ciao1Q99KN2 Rnf181-202ENSMUST00000069595 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ciao1Q99KN2 Ptpn1-201ENSMUST00000029053 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ciao1Q99KN2 Lamb3-209ENSMUST00000194677 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ciao1Q99KN2 Col14a1-201ENSMUST00000023053 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ciao1Q99KN2 Gm30228-201ENSMUST00000218501 1949 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ciao1Q99KN2 Triml2-202ENSMUST00000209200 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ciao1Q99KN2 Rubie-203ENSMUST00000227803 2430 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Ciao1Q99KN2 Igf1-207ENSMUST00000122386 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ciao1Q99KN2 Gprasp1-201ENSMUST00000113144 5843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ciao1Q99KN2 Gm3755-201ENSMUST00000169555 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ciao1Q99KN2 Srpk3-201ENSMUST00000002081 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ciao1Q99KN2 Akap10-202ENSMUST00000102650 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60 ms