Protein–RNA interactions for Protein: Q99JW4

Lims1, LIM and senescent cell antigen-like-containing domain protein 1, mousemouse

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Length 325 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lims1Q99JW4 Gm11642-201ENSMUST00000150442 440 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Lims1Q99JW4 Gm23085-201ENSMUST00000157849 293 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Lims1Q99JW4 Arf4os-201ENSMUST00000166902 566 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Lims1Q99JW4 3110045C21Rik-201ENSMUST00000180638 1135 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Lims1Q99JW4 Dleu2-205ENSMUST00000182325 463 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Lims1Q99JW4 Dleu2-212ENSMUST00000183079 535 ntTSL 3 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Lims1Q99JW4 Pmvk-203ENSMUST00000184515 1156 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Lims1Q99JW4 Gm28287-201ENSMUST00000186612 546 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Lims1Q99JW4 Gm28746-201ENSMUST00000187453 380 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Lims1Q99JW4 Gm9540-201ENSMUST00000188230 478 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Lims1Q99JW4 Ighv1-48-201ENSMUST00000191795 294 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Lims1Q99JW4 Gm36991-201ENSMUST00000191800 648 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Lims1Q99JW4 Gm37319-201ENSMUST00000193500 636 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Lims1Q99JW4 Gm43378-201ENSMUST00000199336 582 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Lims1Q99JW4 Gm4482-201ENSMUST00000200876 742 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Lims1Q99JW4 Gm8342-201ENSMUST00000209839 757 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Lims1Q99JW4 Gm33175-201ENSMUST00000211562 461 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Lims1Q99JW4 Gm18730-201ENSMUST00000218038 343 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Lims1Q99JW4 AC153830.1-201ENSMUST00000218522 594 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Lims1Q99JW4 Ift43-205ENSMUST00000222821 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Lims1Q99JW4 AC134860.1-201ENSMUST00000224867 660 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Lims1Q99JW4 Cmtm2b-201ENSMUST00000041973 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Lims1Q99JW4 Gm8385-201ENSMUST00000058999 643 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Lims1Q99JW4 Eef1d-203ENSMUST00000089680 973 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Lims1Q99JW4 Gm21811-201ENSMUST00000096485 930 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Lims1Q99JW4 Gtf2i-202ENSMUST00000082057 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Lims1Q99JW4 Pygo1-201ENSMUST00000038489 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Lims1Q99JW4 Mybph-201ENSMUST00000038445 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Lims1Q99JW4 Nudt7-203ENSMUST00000109109 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Lims1Q99JW4 Gm44617-202ENSMUST00000209122 2763 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Lims1Q99JW4 Cldn19-202ENSMUST00000094823 4168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Lims1Q99JW4 Scamp1-203ENSMUST00000152555 1877 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Lims1Q99JW4 Ankub1-202ENSMUST00000197088 1854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Lims1Q99JW4 Pcdhb22-202ENSMUST00000192409 6609 ntAPPRIS P1 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Lims1Q99JW4 Gm3765-201ENSMUST00000130985 1447 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Lims1Q99JW4 6030466F02Rik-201ENSMUST00000212339 1434 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Lims1Q99JW4 Epn3-202ENSMUST00000127305 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Lims1Q99JW4 Megf11-203ENSMUST00000118485 3944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Lims1Q99JW4 Evi2a-201ENSMUST00000103236 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Lims1Q99JW4 Plagl2-201ENSMUST00000056924 5485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Lims1Q99JW4 Cacna1c-212ENSMUST00000187940 7507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Lims1Q99JW4 6430550D23Rik-201ENSMUST00000086145 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Lims1Q99JW4 AC108416.1-201ENSMUST00000228755 1558 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Lims1Q99JW4 D630029K05Rik-201ENSMUST00000033651 2133 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Lims1Q99JW4 Mob3b-201ENSMUST00000102975 6030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Lims1Q99JW4 AC160411.1-201ENSMUST00000218544 4560 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Lims1Q99JW4 Flicr-201ENSMUST00000144719 3455 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Lims1Q99JW4 Sp6-201ENSMUST00000047997 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Lims1Q99JW4 A830018L16Rik-202ENSMUST00000135014 6451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Lims1Q99JW4 Rin1-201ENSMUST00000025818 4184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Lims1Q99JW4 B630019A10Rik-201ENSMUST00000149488 2407 ntTSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Lims1Q99JW4 Itgal-205ENSMUST00000170971 3662 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Lims1Q99JW4 Dmbt1-202ENSMUST00000208311 6272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Lims1Q99JW4 Gm26631-201ENSMUST00000181462 2505 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Lims1Q99JW4 Mms19-201ENSMUST00000026168 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Lims1Q99JW4 Tnnt3-206ENSMUST00000105944 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Lims1Q99JW4 Tnnt3-210ENSMUST00000105948 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Lims1Q99JW4 Tnnt3-212ENSMUST00000105950 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Lims1Q99JW4 Ucp3-202ENSMUST00000107059 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Lims1Q99JW4 Fgf8-204ENSMUST00000111925 702 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Lims1Q99JW4 Gm12106-201ENSMUST00000116006 1200 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Lims1Q99JW4 Gm14028-201ENSMUST00000117434 479 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Lims1Q99JW4 Gm15515-201ENSMUST00000117827 822 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Lims1Q99JW4 Gm12501-201ENSMUST00000119163 529 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Lims1Q99JW4 Gm14208-201ENSMUST00000119645 678 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Lims1Q99JW4 Endov-204ENSMUST00000129327 1184 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Lims1Q99JW4 Tnnt3-224ENSMUST00000169299 1013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Lims1Q99JW4 Hspb9-202ENSMUST00000169833 726 ntAPPRIS P2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Lims1Q99JW4 Smpd4-223ENSMUST00000172182 516 ntTSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Lims1Q99JW4 Gm21778-201ENSMUST00000178779 471 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Lims1Q99JW4 Tnnt3-226ENSMUST00000180152 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Lims1Q99JW4 Mir6979-201ENSMUST00000183927 56 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Lims1Q99JW4 Gm44044-201ENSMUST00000205178 1089 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Lims1Q99JW4 Gm2594-201ENSMUST00000214774 742 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Lims1Q99JW4 AC154461.3-201ENSMUST00000224831 573 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Lims1Q99JW4 Pgpep1l-201ENSMUST00000032770 953 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Lims1Q99JW4 Olfr450-201ENSMUST00000067503 933 ntAPPRIS P1 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Lims1Q99JW4 Tcn2-206ENSMUST00000109992 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Lims1Q99JW4 5930430L01Rik-201ENSMUST00000145042 3994 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Lims1Q99JW4 Atp6v1e1-201ENSMUST00000019354 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Lims1Q99JW4 Krtap10-10-201ENSMUST00000218843 1306 ntAPPRIS P1 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Lims1Q99JW4 Trim56-201ENSMUST00000054384 9279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Lims1Q99JW4 Sertad3-201ENSMUST00000068641 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Lims1Q99JW4 Prpf19-203ENSMUST00000179297 6035 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Lims1Q99JW4 Adamts5-201ENSMUST00000023611 8091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Lims1Q99JW4 Banp-204ENSMUST00000170857 5444 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Lims1Q99JW4 Gm5124-202ENSMUST00000132683 2083 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Lims1Q99JW4 Zfp354a-204ENSMUST00000109122 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Lims1Q99JW4 Mybpc3-203ENSMUST00000169776 4163 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Lims1Q99JW4 Gm9244-201ENSMUST00000056767 2129 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Lims1Q99JW4 Tubb2b-201ENSMUST00000075774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Lims1Q99JW4 Gm8271-201ENSMUST00000171053 1469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Lims1Q99JW4 Gm10829-201ENSMUST00000202084 2988 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Lims1Q99JW4 Elavl2-207ENSMUST00000107118 3797 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Lims1Q99JW4 Lexm-204ENSMUST00000189032 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Lims1Q99JW4 Vmn2r18-201ENSMUST00000165928 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Lims1Q99JW4 Rasgrp4-213ENSMUST00000204845 3182 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Lims1Q99JW4 Nek1-208ENSMUST00000211256 4810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Lims1Q99JW4 Syt7-202ENSMUST00000076968 6624 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Lims1Q99JW4 Mei4-203ENSMUST00000189832 2578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
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