Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEQ0

Cdkl1, Cyclin-dependent kinase-like 1, mousemouse

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Length 352 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkl1Q8CEQ0 BC026585-203ENSMUST00000193791 778 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Cdkl1Q8CEQ0 Folr2-203ENSMUST00000210598 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Cdkl1Q8CEQ0 AC122350.1-201ENSMUST00000228135 533 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Cdkl1Q8CEQ0 Fpr-rs3-201ENSMUST00000071189 1032 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Cdkl1Q8CEQ0 Gm18210-201ENSMUST00000209001 1524 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Cdkl1Q8CEQ0 AC124732.3-201ENSMUST00000221835 1765 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Cdkl1Q8CEQ0 Tmem19-201ENSMUST00000092170 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Cdkl1Q8CEQ0 Myo1b-201ENSMUST00000018561 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Cdkl1Q8CEQ0 Wnt5a-201ENSMUST00000063465 7010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Cdkl1Q8CEQ0 Slit2-216ENSMUST00000174313 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Cdkl1Q8CEQ0 Ino80c-203ENSMUST00000141489 2207 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Cdkl1Q8CEQ0 Prf1-201ENSMUST00000035419 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Cdkl1Q8CEQ0 Pdzd7-203ENSMUST00000169459 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Cdkl1Q8CEQ0 Zeb2-203ENSMUST00000076836 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Cdkl1Q8CEQ0 Irak4-202ENSMUST00000109248 3437 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Cdkl1Q8CEQ0 Unkl-201ENSMUST00000015271 3414 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Cdkl1Q8CEQ0 Lrrc61-201ENSMUST00000101436 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Cdkl1Q8CEQ0 Zfp384-205ENSMUST00000112424 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Cdkl1Q8CEQ0 Fam172a-201ENSMUST00000091459 3892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Cdkl1Q8CEQ0 Plin4-202ENSMUST00000190703 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Cdkl1Q8CEQ0 Smtn-203ENSMUST00000075118 3117 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Cdkl1Q8CEQ0 Itga4-201ENSMUST00000099972 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Cdkl1Q8CEQ0 Lcorl-205ENSMUST00000121573 2378 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Cdkl1Q8CEQ0 Cd79b-201ENSMUST00000044228 1431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Cdkl1Q8CEQ0 Dmbx1-203ENSMUST00000124071 4017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Cdkl1Q8CEQ0 Abt1-201ENSMUST00000041782 4456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Cdkl1Q8CEQ0 Scaf1-206ENSMUST00000211735 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Cdkl1Q8CEQ0 Phc1-204ENSMUST00000159252 3744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Cdkl1Q8CEQ0 Gm45165-201ENSMUST00000207763 1631 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Cdkl1Q8CEQ0 Nudt13-203ENSMUST00000223663 1633 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Cdkl1Q8CEQ0 Rpl22-204ENSMUST00000139685 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cdkl1Q8CEQ0 Hspa5-201ENSMUST00000028222 3672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cdkl1Q8CEQ0 Prss47-202ENSMUST00000203968 1353 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cdkl1Q8CEQ0 Pcdh12-203ENSMUST00000194012 2702 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cdkl1Q8CEQ0 Gm43622-201ENSMUST00000200140 2019 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Cdkl1Q8CEQ0 Rcbtb2-223ENSMUST00000170677 3573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cdkl1Q8CEQ0 Scoc-202ENSMUST00000167525 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cdkl1Q8CEQ0 Gm10436-202ENSMUST00000220521 1788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cdkl1Q8CEQ0 Bmp3-203ENSMUST00000200388 6609 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cdkl1Q8CEQ0 Sertad3-201ENSMUST00000068641 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cdkl1Q8CEQ0 Tctn1-201ENSMUST00000111738 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cdkl1Q8CEQ0 Myl4-202ENSMUST00000106956 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cdkl1Q8CEQ0 S100a16-206ENSMUST00000107335 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cdkl1Q8CEQ0 Styxl1-205ENSMUST00000111164 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cdkl1Q8CEQ0 Creb1-209ENSMUST00000190348 1260 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cdkl1Q8CEQ0 Gm44315-201ENSMUST00000203041 219 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Cdkl1Q8CEQ0 Nt5dc1-206ENSMUST00000213269 802 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cdkl1Q8CEQ0 Gm5468-202ENSMUST00000227851 682 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Cdkl1Q8CEQ0 Ngdn-201ENSMUST00000022815 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cdkl1Q8CEQ0 Fam151b-201ENSMUST00000040106 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cdkl1Q8CEQ0 Tas2r126-201ENSMUST00000059534 930 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cdkl1Q8CEQ0 Vmn1r220-201ENSMUST00000072385 897 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cdkl1Q8CEQ0 Slc38a3-202ENSMUST00000167868 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cdkl1Q8CEQ0 Cldn12-201ENSMUST00000060947 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cdkl1Q8CEQ0 Klhl29-202ENSMUST00000218384 2716 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cdkl1Q8CEQ0 Arhgap19-204ENSMUST00000177495 1652 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cdkl1Q8CEQ0 4921507G05Rik-201ENSMUST00000181348 1653 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cdkl1Q8CEQ0 Rin1-201ENSMUST00000025818 4184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cdkl1Q8CEQ0 Ppp1r16b-202ENSMUST00000052927 6685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cdkl1Q8CEQ0 Entpd8-201ENSMUST00000044078 2299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cdkl1Q8CEQ0 Dnajb12-204ENSMUST00000146590 3070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cdkl1Q8CEQ0 Wdr36-201ENSMUST00000053663 3281 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cdkl1Q8CEQ0 Bod1l-204ENSMUST00000202908 10399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cdkl1Q8CEQ0 Rufy4-202ENSMUST00000127134 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Cdkl1Q8CEQ0 Vgll4-201ENSMUST00000032459 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Cdkl1Q8CEQ0 A330033J07Rik-201ENSMUST00000180921 2816 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Cdkl1Q8CEQ0 Capza1-201ENSMUST00000094028 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Cdkl1Q8CEQ0 Myo16-201ENSMUST00000042103 6725 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Cdkl1Q8CEQ0 Cyp2a22-201ENSMUST00000170227 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Cdkl1Q8CEQ0 Slc12a7-201ENSMUST00000017900 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Cdkl1Q8CEQ0 Hars2-206ENSMUST00000152954 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cdkl1Q8CEQ0 Slc20a1-201ENSMUST00000028880 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cdkl1Q8CEQ0 Qsox1-201ENSMUST00000035325 3348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cdkl1Q8CEQ0 Gpr146-203ENSMUST00000100514 4264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cdkl1Q8CEQ0 Dennd1c-201ENSMUST00000011623 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cdkl1Q8CEQ0 Setd5-201ENSMUST00000042889 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cdkl1Q8CEQ0 Vstm2a-201ENSMUST00000109645 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cdkl1Q8CEQ0 Clec12b-201ENSMUST00000032261 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cdkl1Q8CEQ0 Polr3e-201ENSMUST00000033173 4194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cdkl1Q8CEQ0 Gm9415-201ENSMUST00000200462 1321 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Cdkl1Q8CEQ0 Rbm6-201ENSMUST00000035201 3999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cdkl1Q8CEQ0 Rnf133-201ENSMUST00000063548 1308 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cdkl1Q8CEQ0 Gm5124-202ENSMUST00000132683 2083 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Cdkl1Q8CEQ0 Arhgef2-207ENSMUST00000175903 3356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cdkl1Q8CEQ0 Fubp1-209ENSMUST00000198227 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cdkl1Q8CEQ0 Gm42815-201ENSMUST00000198787 1470 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Cdkl1Q8CEQ0 Hist1h3d-201ENSMUST00000105105 1249 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cdkl1Q8CEQ0 Gm9062-201ENSMUST00000117712 727 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Cdkl1Q8CEQ0 Gm12856-201ENSMUST00000119471 1293 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Cdkl1Q8CEQ0 Gm27441-201ENSMUST00000185000 105 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Cdkl1Q8CEQ0 1700088E04Rik-206ENSMUST00000187550 1168 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cdkl1Q8CEQ0 Gm28306-201ENSMUST00000191315 529 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cdkl1Q8CEQ0 Gm37312-201ENSMUST00000195753 685 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cdkl1Q8CEQ0 Gm17590-202ENSMUST00000197881 1232 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cdkl1Q8CEQ0 Gm17831-201ENSMUST00000205579 900 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Cdkl1Q8CEQ0 AC122024.3-201ENSMUST00000217719 294 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Cdkl1Q8CEQ0 Cct2-206ENSMUST00000219573 637 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cdkl1Q8CEQ0 AC125070.1-201ENSMUST00000223523 555 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cdkl1Q8CEQ0 Ccdc28b-201ENSMUST00000030586 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cdkl1Q8CEQ0 Gm23105-201ENSMUST00000083719 134 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
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