Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEC0

Nup88, Nuclear pore complex protein Nup88, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 753 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup88Q8CEC0 Platr25-207ENSMUST00000222477 1705 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Nup88Q8CEC0 Rnf165-202ENSMUST00000182024 4309 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Nup88Q8CEC0 5430405H02Rik-201ENSMUST00000153616 1431 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Nup88Q8CEC0 Gm19299-202ENSMUST00000215724 1435 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Nup88Q8CEC0 Gm1840-201ENSMUST00000051687 1432 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Nup88Q8CEC0 Rps9-202ENSMUST00000108623 1347 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Nup88Q8CEC0 Abcc10-202ENSMUST00000095261 5266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Nup88Q8CEC0 Ptbp1-202ENSMUST00000095457 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Nup88Q8CEC0 Camk1d-202ENSMUST00000114987 1295 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Nup88Q8CEC0 Gm13830-203ENSMUST00000148916 247 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Nup88Q8CEC0 Gm44805-202ENSMUST00000150569 587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Nup88Q8CEC0 Prss36-208ENSMUST00000156152 1132 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Nup88Q8CEC0 Gm3329-201ENSMUST00000159873 556 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Nup88Q8CEC0 Gm6485-201ENSMUST00000160676 439 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Nup88Q8CEC0 Ccl19-ps3-201ENSMUST00000179634 324 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Nup88Q8CEC0 Gm12407-201ENSMUST00000180219 324 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Nup88Q8CEC0 Gm10731-201ENSMUST00000181171 448 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Nup88Q8CEC0 Gm27241-202ENSMUST00000185013 570 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Nup88Q8CEC0 Gm37458-201ENSMUST00000194055 410 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Nup88Q8CEC0 Gm5982-201ENSMUST00000196234 512 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Nup88Q8CEC0 Fxyd4-203ENSMUST00000203082 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Nup88Q8CEC0 Gm33201-201ENSMUST00000204791 855 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Nup88Q8CEC0 Pgpep1l-202ENSMUST00000207874 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Nup88Q8CEC0 Gm6108-201ENSMUST00000208365 367 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Nup88Q8CEC0 Gm45285-201ENSMUST00000210418 749 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Nup88Q8CEC0 Gm40652-201ENSMUST00000218944 895 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Nup88Q8CEC0 AC112945.1-201ENSMUST00000226413 514 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Nup88Q8CEC0 Ifi27-201ENSMUST00000066701 889 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Nup88Q8CEC0 Cntn4-203ENSMUST00000113258 2464 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Nup88Q8CEC0 Gm45053-201ENSMUST00000206112 2499 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Nup88Q8CEC0 Ehmt1-203ENSMUST00000102938 4680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Nup88Q8CEC0 Cxcl12-203ENSMUST00000112871 3132 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Nup88Q8CEC0 Krt7-201ENSMUST00000068904 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Nup88Q8CEC0 Kat6b-201ENSMUST00000069648 7649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Nup88Q8CEC0 Pip5k1a-205ENSMUST00000107233 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Nup88Q8CEC0 Kcnmb3-201ENSMUST00000164954 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Nup88Q8CEC0 Apon-202ENSMUST00000218722 1747 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Nup88Q8CEC0 Slc12a7-201ENSMUST00000017900 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Nup88Q8CEC0 Coch-201ENSMUST00000085412 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Nup88Q8CEC0 Chrne-201ENSMUST00000014753 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Nup88Q8CEC0 B4galt4-201ENSMUST00000023482 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Nup88Q8CEC0 Trim45-201ENSMUST00000037409 4612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Nup88Q8CEC0 Bcl2l2-203ENSMUST00000133397 3813 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Nup88Q8CEC0 Gm13556-201ENSMUST00000132692 1412 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Nup88Q8CEC0 Cit-202ENSMUST00000102560 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Nup88Q8CEC0 Lhx9-204ENSMUST00000112026 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Nup88Q8CEC0 Ism2-201ENSMUST00000051601 1350 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Nup88Q8CEC0 Ric8a-201ENSMUST00000026558 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Nup88Q8CEC0 Rbm39-201ENSMUST00000029149 2711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Nup88Q8CEC0 Anxa4-202ENSMUST00000113675 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Nup88Q8CEC0 Slc20a1-201ENSMUST00000028880 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Nup88Q8CEC0 Gm13384-201ENSMUST00000117166 1344 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Nup88Q8CEC0 6820426E19Rik-201ENSMUST00000204274 1970 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Nup88Q8CEC0 1700080O16Rik-202ENSMUST00000114866 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Nup88Q8CEC0 Agbl3-201ENSMUST00000115009 806 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Nup88Q8CEC0 Gm1848-201ENSMUST00000120711 789 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Nup88Q8CEC0 Gm12798-201ENSMUST00000124786 666 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Nup88Q8CEC0 Gm15764-201ENSMUST00000150389 672 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Nup88Q8CEC0 Plgrkt-209ENSMUST00000152936 604 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Nup88Q8CEC0 Hmgn3-201ENSMUST00000161796 862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Nup88Q8CEC0 Rsph14-206ENSMUST00000166088 1203 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Nup88Q8CEC0 Gm18367-201ENSMUST00000176139 600 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Nup88Q8CEC0 Rsph14-207ENSMUST00000179546 1190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Nup88Q8CEC0 Mir8093-201ENSMUST00000185043 137 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Nup88Q8CEC0 Ssr4-201ENSMUST00000002090 765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Nup88Q8CEC0 6430531B16Rik-204ENSMUST00000209335 898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Nup88Q8CEC0 CT485606.1-201ENSMUST00000213187 878 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Nup88Q8CEC0 Gm10318-202ENSMUST00000217996 639 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Nup88Q8CEC0 AC154257.1-202ENSMUST00000224729 843 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Nup88Q8CEC0 Odf3-201ENSMUST00000026555 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Nup88Q8CEC0 Rpl35a-201ENSMUST00000078804 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Nup88Q8CEC0 Krtap6-2-201ENSMUST00000082065 786 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Nup88Q8CEC0 Rsph14-201ENSMUST00000009214 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Nup88Q8CEC0 Cdc7-204ENSMUST00000118261 3129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Nup88Q8CEC0 9330111N05Rik-203ENSMUST00000181508 1848 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Nup88Q8CEC0 Myh2-201ENSMUST00000018641 6018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Nup88Q8CEC0 Hdc-201ENSMUST00000028838 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Nup88Q8CEC0 Sh3pxd2a-201ENSMUST00000081619 10464 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Nup88Q8CEC0 Igf1-201ENSMUST00000062862 2292 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Nup88Q8CEC0 Bnc2-202ENSMUST00000107198 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Nup88Q8CEC0 Nr2f2-202ENSMUST00000089565 1664 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Nup88Q8CEC0 Rps6ka1-209ENSMUST00000174481 2228 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Nup88Q8CEC0 Dpep1-201ENSMUST00000019422 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Nup88Q8CEC0 Arhgap11a-202ENSMUST00000110947 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Nup88Q8CEC0 Kng2-203ENSMUST00000115349 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Nup88Q8CEC0 Myo18a-211ENSMUST00000130627 6202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Nup88Q8CEC0 Asb15-201ENSMUST00000031696 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Nup88Q8CEC0 Lrrc74b-202ENSMUST00000065125 1539 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Nup88Q8CEC0 Asns-202ENSMUST00000115542 2016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Nup88Q8CEC0 Lgr5-208ENSMUST00000173740 2508 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Nup88Q8CEC0 Cd55-201ENSMUST00000027650 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Nup88Q8CEC0 Sox8-201ENSMUST00000025003 3000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Nup88Q8CEC0 Dennd4c-202ENSMUST00000082026 7940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Nup88Q8CEC0 Gm9544-201ENSMUST00000223349 2482 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Nup88Q8CEC0 Apol9a-201ENSMUST00000081776 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Nup88Q8CEC0 AC125409.1-201ENSMUST00000223213 3370 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Nup88Q8CEC0 Gm18262-201ENSMUST00000222560 1946 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Nup88Q8CEC0 Pstpip2-201ENSMUST00000114741 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Nup88Q8CEC0 Abhd12b-203ENSMUST00000169156 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Nup88Q8CEC0 Olfr582-202ENSMUST00000210119 1787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
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