Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5P7

Tdrp, Testis development-related protein, mousemouse

Predictions only

Length 182 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TdrpQ8C5P7 Tex2-202ENSMUST00000103070 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
TdrpQ8C5P7 Clasp1-216ENSMUST00000189738 5373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
TdrpQ8C5P7 Gphb5-201ENSMUST00000051079 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
TdrpQ8C5P7 Pacsin1-201ENSMUST00000045896 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
TdrpQ8C5P7 Tcf7l2-206ENSMUST00000111652 1041 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
TdrpQ8C5P7 Dnmt3l-203ENSMUST00000131825 1113 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
TdrpQ8C5P7 Dnmt3l-206ENSMUST00000139539 1279 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
TdrpQ8C5P7 Gm22846-201ENSMUST00000157706 270 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
TdrpQ8C5P7 Gm5778-201ENSMUST00000171003 1072 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
TdrpQ8C5P7 Gm26134-201ENSMUST00000178484 110 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
TdrpQ8C5P7 Gm29187-201ENSMUST00000186681 689 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
TdrpQ8C5P7 Gm29261-201ENSMUST00000188535 678 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
TdrpQ8C5P7 4930422M22Rik-201ENSMUST00000191492 948 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
TdrpQ8C5P7 Gm37905-201ENSMUST00000195310 341 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
TdrpQ8C5P7 Gm7600-201ENSMUST00000209657 785 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
TdrpQ8C5P7 Gm35625-201ENSMUST00000210416 316 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
TdrpQ8C5P7 Gm31166-202ENSMUST00000210638 1268 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
TdrpQ8C5P7 Sdf2-201ENSMUST00000002133 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
TdrpQ8C5P7 AC122891.1-201ENSMUST00000218671 268 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
TdrpQ8C5P7 CT010506.1-201ENSMUST00000223673 349 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
TdrpQ8C5P7 Prrxl1-205ENSMUST00000228878 723 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
TdrpQ8C5P7 Tas2r125-201ENSMUST00000076119 937 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
TdrpQ8C5P7 Hist1h2be-201ENSMUST00000051091 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
TdrpQ8C5P7 Fdxacb1-201ENSMUST00000042391 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
TdrpQ8C5P7 Nfasc-203ENSMUST00000163770 3903 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
TdrpQ8C5P7 Zcchc8-204ENSMUST00000196282 4350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
TdrpQ8C5P7 Ncoa6-203ENSMUST00000109670 7101 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
TdrpQ8C5P7 Eya2-201ENSMUST00000063433 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
TdrpQ8C5P7 Vps54-201ENSMUST00000006221 4323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
TdrpQ8C5P7 Samhd1-203ENSMUST00000109549 3245 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
TdrpQ8C5P7 Bmp1-201ENSMUST00000022693 3684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
TdrpQ8C5P7 Vcp-201ENSMUST00000030164 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
TdrpQ8C5P7 Zfp710-202ENSMUST00000164056 5871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
TdrpQ8C5P7 Gm28424-201ENSMUST00000187393 1319 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
TdrpQ8C5P7 Kcnd1-201ENSMUST00000009875 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
TdrpQ8C5P7 Nckap5-212ENSMUST00000162877 2630 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
TdrpQ8C5P7 Slc19a1-201ENSMUST00000105410 2347 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
TdrpQ8C5P7 Slc25a36-202ENSMUST00000085206 5227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
TdrpQ8C5P7 Zfp558-202ENSMUST00000034647 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
TdrpQ8C5P7 Smc3-201ENSMUST00000025930 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
TdrpQ8C5P7 Camk2b-207ENSMUST00000101586 1590 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
TdrpQ8C5P7 Gm2464-201ENSMUST00000180838 2551 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
TdrpQ8C5P7 Gm45206-201ENSMUST00000206885 2285 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
TdrpQ8C5P7 Add2-207ENSMUST00000203724 3143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
TdrpQ8C5P7 Tprkb-203ENSMUST00000113751 692 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
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TdrpQ8C5P7 Gm15412-201ENSMUST00000137193 1096 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
TdrpQ8C5P7 Gm20420-201ENSMUST00000173178 639 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
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TdrpQ8C5P7 Gm35822-201ENSMUST00000204954 562 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
TdrpQ8C5P7 AC165154.1-201ENSMUST00000226661 340 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
TdrpQ8C5P7 Rgs8-201ENSMUST00000041776 8474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
TdrpQ8C5P7 Rab27b-201ENSMUST00000069749 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
TdrpQ8C5P7 Tcim-201ENSMUST00000052622 1805 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
TdrpQ8C5P7 Zc3hc1-201ENSMUST00000080812 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
TdrpQ8C5P7 Vezt-202ENSMUST00000118077 2223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
TdrpQ8C5P7 Plekhg4-203ENSMUST00000160191 3339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
TdrpQ8C5P7 Rpl22-204ENSMUST00000139685 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
TdrpQ8C5P7 Nexmif-203ENSMUST00000118314 11476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
TdrpQ8C5P7 Tmem8b-209ENSMUST00000167153 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
TdrpQ8C5P7 Akap5-203ENSMUST00000172992 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
TdrpQ8C5P7 Spem2-201ENSMUST00000056941 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
TdrpQ8C5P7 Mageb4-202ENSMUST00000113969 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
TdrpQ8C5P7 Mageb4-201ENSMUST00000096378 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
TdrpQ8C5P7 Nsd3-210ENSMUST00000153597 1865 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
TdrpQ8C5P7 Yeats2-202ENSMUST00000115560 6116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
TdrpQ8C5P7 Dld-201ENSMUST00000110857 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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TdrpQ8C5P7 Sparcl1-201ENSMUST00000031249 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
TdrpQ8C5P7 Tmem138-201ENSMUST00000025568 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
TdrpQ8C5P7 Gcnt7-201ENSMUST00000099060 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
TdrpQ8C5P7 Sass6-204ENSMUST00000197335 2458 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
TdrpQ8C5P7 AC125374.1-201ENSMUST00000213573 1400 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
TdrpQ8C5P7 Pls3-201ENSMUST00000033547 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
TdrpQ8C5P7 Fcrla-201ENSMUST00000046322 1679 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
TdrpQ8C5P7 Qsox1-201ENSMUST00000035325 3348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
TdrpQ8C5P7 Ostm1-202ENSMUST00000105497 770 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
TdrpQ8C5P7 Gm3415-201ENSMUST00000110595 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
TdrpQ8C5P7 Gm3409-201ENSMUST00000110597 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
TdrpQ8C5P7 Gm8111-201ENSMUST00000117659 987 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
TdrpQ8C5P7 Gm12274-201ENSMUST00000120062 385 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
TdrpQ8C5P7 Gm4879-201ENSMUST00000122190 1272 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
TdrpQ8C5P7 Gm15619-201ENSMUST00000128415 1294 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
TdrpQ8C5P7 Nudt6-207ENSMUST00000141438 899 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
TdrpQ8C5P7 Gm14154-201ENSMUST00000142642 579 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
TdrpQ8C5P7 Gm12714-201ENSMUST00000143391 669 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
TdrpQ8C5P7 4930538E20Rik-202ENSMUST00000146717 497 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
TdrpQ8C5P7 Olfml3-204ENSMUST00000169286 874 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
TdrpQ8C5P7 Gm26778-201ENSMUST00000181443 3805 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
TdrpQ8C5P7 Iqcf3-202ENSMUST00000186668 633 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
TdrpQ8C5P7 Gm35025-203ENSMUST00000193519 634 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
TdrpQ8C5P7 Gm34023-201ENSMUST00000195539 217 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
TdrpQ8C5P7 Gm43552-201ENSMUST00000196121 365 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
TdrpQ8C5P7 Gm42657-201ENSMUST00000201746 211 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
TdrpQ8C5P7 Gm8579-201ENSMUST00000201943 733 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
TdrpQ8C5P7 Klk1b19-ps-201ENSMUST00000205322 696 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
TdrpQ8C5P7 Gng8-202ENSMUST00000205459 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
TdrpQ8C5P7 Gm45285-201ENSMUST00000210418 749 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
TdrpQ8C5P7 Gm36176-201ENSMUST00000218749 501 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms