Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0J2

Atg16l1, Autophagy-related protein 16-1, mousemouse

Predictions only

Length 607 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg16l1Q8C0J2 Flna-201ENSMUST00000033699 8312 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Atg16l1Q8C0J2 Spata5-201ENSMUST00000029277 2890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Atg16l1Q8C0J2 Gm28424-201ENSMUST00000187393 1319 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Atg16l1Q8C0J2 Nckap5-212ENSMUST00000162877 2630 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Atg16l1Q8C0J2 Atxn1l-202ENSMUST00000212605 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Atg16l1Q8C0J2 Tbl3-202ENSMUST00000126319 5226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Atg16l1Q8C0J2 5730405O15Rik-201ENSMUST00000127521 1749 ntTSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Atg16l1Q8C0J2 Flcn-203ENSMUST00000102697 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Atg16l1Q8C0J2 Gmip-202ENSMUST00000123453 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Atg16l1Q8C0J2 Plscr3-203ENSMUST00000108633 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Atg16l1Q8C0J2 Mrpl55-205ENSMUST00000108787 718 ntTSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Atg16l1Q8C0J2 3110009E18Rik-203ENSMUST00000112644 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Atg16l1Q8C0J2 Rbm3-204ENSMUST00000115617 1152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Atg16l1Q8C0J2 A330102I10Rik-202ENSMUST00000140415 682 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Atg16l1Q8C0J2 Gm15884-201ENSMUST00000143765 643 ntTSL 3 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Atg16l1Q8C0J2 9430093N23Rik-201ENSMUST00000152494 515 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Atg16l1Q8C0J2 Snhg9-201ENSMUST00000161706 183 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Atg16l1Q8C0J2 1110008E08Rik-202ENSMUST00000183621 723 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Atg16l1Q8C0J2 Gm37301-201ENSMUST00000195412 568 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Atg16l1Q8C0J2 Gm34728-201ENSMUST00000201510 414 ntTSL 3 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Atg16l1Q8C0J2 Gm18054-201ENSMUST00000207539 555 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Atg16l1Q8C0J2 Tpd52l1-205ENSMUST00000215515 857 ntTSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Atg16l1Q8C0J2 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Atg16l1Q8C0J2 Sit1-201ENSMUST00000030180 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Atg16l1Q8C0J2 Serac1-202ENSMUST00000097432 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Atg16l1Q8C0J2 Frmd4b-201ENSMUST00000032146 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Atg16l1Q8C0J2 Peg3-201ENSMUST00000051209 8694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Atg16l1Q8C0J2 Rufy2-202ENSMUST00000119567 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Atg16l1Q8C0J2 Ttll13-201ENSMUST00000058266 3010 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Atg16l1Q8C0J2 Nav2-204ENSMUST00000183659 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Atg16l1Q8C0J2 Lztr1-202ENSMUST00000115681 3394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Atg16l1Q8C0J2 Zfp114-203ENSMUST00000206547 3154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Atg16l1Q8C0J2 AC124732.3-201ENSMUST00000221835 1765 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Atg16l1Q8C0J2 Gramd2-201ENSMUST00000098661 1368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Atg16l1Q8C0J2 Lingo1-201ENSMUST00000053568 3295 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Atg16l1Q8C0J2 Trappc9-202ENSMUST00000089770 4047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Atg16l1Q8C0J2 Ddr1-201ENSMUST00000003628 3802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Atg16l1Q8C0J2 Ubap2-202ENSMUST00000108068 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Atg16l1Q8C0J2 Atxn1l-201ENSMUST00000093162 7526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Atg16l1Q8C0J2 Sh3d21-201ENSMUST00000094760 1859 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Atg16l1Q8C0J2 Vipas39-203ENSMUST00000179379 2418 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Atg16l1Q8C0J2 AC164092.1-201ENSMUST00000215635 2232 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Atg16l1Q8C0J2 Spata33-207ENSMUST00000212760 4074 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Atg16l1Q8C0J2 Tcp10a-202ENSMUST00000128533 2589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Atg16l1Q8C0J2 Eef1d-207ENSMUST00000116440 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Atg16l1Q8C0J2 Gm15501-201ENSMUST00000133910 849 ntTSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Atg16l1Q8C0J2 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Atg16l1Q8C0J2 Ager-207ENSMUST00000173992 1248 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Atg16l1Q8C0J2 Gm10807-201ENSMUST00000177134 795 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Atg16l1Q8C0J2 Gm6621-201ENSMUST00000193251 772 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Atg16l1Q8C0J2 Gm45113-201ENSMUST00000207518 165 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Atg16l1Q8C0J2 Gm6722-201ENSMUST00000221586 390 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Atg16l1Q8C0J2 AC159205.5-202ENSMUST00000224849 386 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Atg16l1Q8C0J2 Rps3a1-201ENSMUST00000029722 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Atg16l1Q8C0J2 Rpsa-ps10-201ENSMUST00000057740 885 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Atg16l1Q8C0J2 Ddx21-201ENSMUST00000045866 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Atg16l1Q8C0J2 Prom2-202ENSMUST00000103214 4190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Atg16l1Q8C0J2 Kcne2-202ENSMUST00000113971 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Atg16l1Q8C0J2 Optc-205ENSMUST00000153617 1615 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Atg16l1Q8C0J2 AC174797.1-201ENSMUST00000224339 1649 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Atg16l1Q8C0J2 Ube3a-203ENSMUST00000200758 9856 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Atg16l1Q8C0J2 Rps6ka6-204ENSMUST00000113428 4135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Atg16l1Q8C0J2 Pou2f1-206ENSMUST00000111429 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Atg16l1Q8C0J2 Plcxd2-201ENSMUST00000130481 7140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Atg16l1Q8C0J2 Mmp21-202ENSMUST00000122136 1599 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Atg16l1Q8C0J2 Apol7a-203ENSMUST00000175919 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Atg16l1Q8C0J2 Olfr156-203ENSMUST00000214843 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Atg16l1Q8C0J2 Egfr-201ENSMUST00000020329 10208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Atg16l1Q8C0J2 Tspear-201ENSMUST00000092366 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Atg16l1Q8C0J2 Otog-201ENSMUST00000164538 10043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.63
Atg16l1Q8C0J2 Gm9200-201ENSMUST00000118513 1354 ntBASIC11.15□□□□□ -0.63
Atg16l1Q8C0J2 Kcnab2-207ENSMUST00000160884 3922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Atg16l1Q8C0J2 Gm10686-201ENSMUST00000215389 3247 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Atg16l1Q8C0J2 Kif3c-201ENSMUST00000020999 6791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Atg16l1Q8C0J2 Ptp4a3-203ENSMUST00000165541 3539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Atg16l1Q8C0J2 Son-202ENSMUST00000114037 8399 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Atg16l1Q8C0J2 Ankrd11-201ENSMUST00000098333 7995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Atg16l1Q8C0J2 Nxpe5-201ENSMUST00000110929 2312 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Atg16l1Q8C0J2 Top3a-204ENSMUST00000120417 2318 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Atg16l1Q8C0J2 Gm8862-201ENSMUST00000198379 1346 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Atg16l1Q8C0J2 Pde4c-202ENSMUST00000110095 3290 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Atg16l1Q8C0J2 Uhrf1-202ENSMUST00000113035 3402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Atg16l1Q8C0J2 Tnk2-204ENSMUST00000115123 4225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Atg16l1Q8C0J2 Tmem176b-202ENSMUST00000164733 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Atg16l1Q8C0J2 C530005A16Rik-201ENSMUST00000142815 2436 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Atg16l1Q8C0J2 Tcp10a-203ENSMUST00000129709 1778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Atg16l1Q8C0J2 Pcdh15-233ENSMUST00000191709 5346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Atg16l1Q8C0J2 Fam49a-201ENSMUST00000069005 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Atg16l1Q8C0J2 Armcx2-202ENSMUST00000113193 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Atg16l1Q8C0J2 Ighv1-81-201ENSMUST00000103548 351 ntAPPRIS P1 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Atg16l1Q8C0J2 Gm15617-201ENSMUST00000118973 771 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Atg16l1Q8C0J2 Gm11651-201ENSMUST00000130673 529 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Atg16l1Q8C0J2 Gm15635-202ENSMUST00000131160 917 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Atg16l1Q8C0J2 Olfr668-201ENSMUST00000164391 957 ntAPPRIS P1 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Atg16l1Q8C0J2 Higd1c-202ENSMUST00000177211 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Atg16l1Q8C0J2 6530403H02Rik-204ENSMUST00000183276 659 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Atg16l1Q8C0J2 Gm5852-201ENSMUST00000194119 1021 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Atg16l1Q8C0J2 Gm36503-201ENSMUST00000204284 875 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Atg16l1Q8C0J2 Cldnd2-202ENSMUST00000206839 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Atg16l1Q8C0J2 Gm32111-201ENSMUST00000207689 846 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.5 ms