Protein–RNA interactions for Protein: Q8BL06

Usp54, Inactive ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 54, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,588 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp54Q8BL06 4930447F24Rik-201ENSMUST00000194140 1341 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Usp54Q8BL06 Prr18-202ENSMUST00000163887 3251 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Usp54Q8BL06 Cct3-208ENSMUST00000168062 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Usp54Q8BL06 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Usp54Q8BL06 Gm23132-201ENSMUST00000104254 132 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Usp54Q8BL06 Gm13426-201ENSMUST00000117887 795 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Usp54Q8BL06 1700064H15Rik-201ENSMUST00000119133 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Usp54Q8BL06 Gm12207-201ENSMUST00000143016 494 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Usp54Q8BL06 Platr20-202ENSMUST00000143209 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Usp54Q8BL06 Gm17936-201ENSMUST00000199413 988 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Usp54Q8BL06 Gm43866-201ENSMUST00000203894 839 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Usp54Q8BL06 Madcam1-202ENSMUST00000217748 944 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Usp54Q8BL06 AC165260.2-201ENSMUST00000225371 395 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Usp54Q8BL06 Scgb2b2-201ENSMUST00000038835 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Usp54Q8BL06 Olfr456-201ENSMUST00000057251 1052 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Usp54Q8BL06 Olfr1121-201ENSMUST00000062555 945 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Usp54Q8BL06 C530043K16Rik-201ENSMUST00000201865 3109 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Usp54Q8BL06 Gm5697-201ENSMUST00000122295 2482 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Usp54Q8BL06 Vrtn-201ENSMUST00000095551 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Usp54Q8BL06 Pkn1-208ENSMUST00000144258 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Usp54Q8BL06 Ppid-201ENSMUST00000029382 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Usp54Q8BL06 Phldb1-218ENSMUST00000156918 3485 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Usp54Q8BL06 Apbb2-215ENSMUST00000162349 3362 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Usp54Q8BL06 Apbb2-201ENSMUST00000087256 3362 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Usp54Q8BL06 Arhgap20-204ENSMUST00000130405 3881 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Usp54Q8BL06 Slc43a1-204ENSMUST00000121114 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Usp54Q8BL06 Tlr9-201ENSMUST00000062241 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Usp54Q8BL06 Oscp1-203ENSMUST00000143712 1473 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Usp54Q8BL06 Akap3-202ENSMUST00000202574 2879 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Usp54Q8BL06 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Usp54Q8BL06 Tmigd1-202ENSMUST00000102495 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Usp54Q8BL06 4930512J16Rik-201ENSMUST00000203704 1859 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Usp54Q8BL06 Nek5-202ENSMUST00000209656 2253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Usp54Q8BL06 Slc52a2-201ENSMUST00000023220 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Usp54Q8BL06 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Usp54Q8BL06 Pde1c-209ENSMUST00000203372 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Usp54Q8BL06 Gm8725-201ENSMUST00000221829 1333 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Usp54Q8BL06 Stamos-201ENSMUST00000152524 801 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Usp54Q8BL06 Gm26208-201ENSMUST00000158677 124 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Usp54Q8BL06 Rab26-204ENSMUST00000176533 965 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Usp54Q8BL06 Gm4960-201ENSMUST00000182928 1001 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Usp54Q8BL06 Gm42859-201ENSMUST00000199572 193 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Usp54Q8BL06 Gm45783-201ENSMUST00000210877 656 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Usp54Q8BL06 Tmod3-205ENSMUST00000215821 898 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Usp54Q8BL06 AC140381.2-201ENSMUST00000217935 1260 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Usp54Q8BL06 Calm4-201ENSMUST00000042219 917 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Usp54Q8BL06 1110034G24Rik-201ENSMUST00000061891 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Usp54Q8BL06 Zfp868-201ENSMUST00000074982 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Usp54Q8BL06 Klk1b22-201ENSMUST00000077528 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Usp54Q8BL06 Drc7-201ENSMUST00000058479 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Usp54Q8BL06 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Usp54Q8BL06 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Usp54Q8BL06 Xkr5-201ENSMUST00000055503 3176 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Usp54Q8BL06 Atp5s-204ENSMUST00000220916 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Usp54Q8BL06 Hdac5-204ENSMUST00000107152 3788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Usp54Q8BL06 Metap2-208ENSMUST00000181091 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Usp54Q8BL06 Mcemp1-201ENSMUST00000014118 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Usp54Q8BL06 Gpr19-213ENSMUST00000215088 1484 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Usp54Q8BL06 Tfe3-204ENSMUST00000115677 2943 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Usp54Q8BL06 Platr6-201ENSMUST00000180731 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Usp54Q8BL06 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Usp54Q8BL06 Rasgrp4-208ENSMUST00000161522 3242 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Usp54Q8BL06 Bnc2-202ENSMUST00000107198 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
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Usp54Q8BL06 Fam214a-205ENSMUST00000215370 4205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Usp54Q8BL06 1600014C10Rik-201ENSMUST00000067854 3143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Usp54Q8BL06 Cebpd-201ENSMUST00000096232 3746 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
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Usp54Q8BL06 Trav13-2-201ENSMUST00000103658 390 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Usp54Q8BL06 Gm13326-201ENSMUST00000118730 1011 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
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Usp54Q8BL06 Tctex1d1-205ENSMUST00000140654 891 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Usp54Q8BL06 4930444A19Rik-202ENSMUST00000190007 633 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Usp54Q8BL06 Ccl25-201ENSMUST00000024004 1058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Usp54Q8BL06 Mcpt4-201ENSMUST00000043249 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Usp54Q8BL06 Olfr1394-201ENSMUST00000052668 939 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Usp54Q8BL06 Ifne-201ENSMUST00000056014 664 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Usp54Q8BL06 S1pr1-201ENSMUST00000055676 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Usp54Q8BL06 Klhl15-201ENSMUST00000096369 3944 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Usp54Q8BL06 Vsir-203ENSMUST00000105460 4843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Usp54Q8BL06 Vsir-201ENSMUST00000020301 4846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Usp54Q8BL06 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Usp54Q8BL06 Glis2-201ENSMUST00000014447 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Usp54Q8BL06 Nfx1-202ENSMUST00000091614 3617 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Usp54Q8BL06 Ninl-201ENSMUST00000109896 5093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Usp54Q8BL06 Ccdc191-201ENSMUST00000122014 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Usp54Q8BL06 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Usp54Q8BL06 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Usp54Q8BL06 Gm12847-201ENSMUST00000156219 413 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Usp54Q8BL06 Gm22994-201ENSMUST00000175422 82 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Usp54Q8BL06 Gm25591-201ENSMUST00000177317 94 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Usp54Q8BL06 Fut1-202ENSMUST00000209379 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Usp54Q8BL06 Thy1-205ENSMUST00000215156 460 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Usp54Q8BL06 2310039L15Rik-203ENSMUST00000220058 727 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Usp54Q8BL06 AC139155.1-201ENSMUST00000226043 444 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Usp54Q8BL06 Tex46-201ENSMUST00000046647 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Usp54Q8BL06 Hax1-201ENSMUST00000079724 1139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Usp54Q8BL06 Eloc-208ENSMUST00000188641 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
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