Protein–RNA interactions for Protein: Q8BHX3

Cdca8, Borealin, mousemouse

Predictions only

Length 289 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdca8Q8BHX3 Gm21103-202ENSMUST00000170923 1761 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cdca8Q8BHX3 Gm18798-201ENSMUST00000187264 1700 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Cdca8Q8BHX3 Uba1y-ps1-201ENSMUST00000188314 1708 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Cdca8Q8BHX3 Dpt-201ENSMUST00000027861 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cdca8Q8BHX3 Pdzd7-203ENSMUST00000169459 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cdca8Q8BHX3 4933438K21Rik-201ENSMUST00000175787 1693 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cdca8Q8BHX3 Gm6831-202ENSMUST00000213025 1673 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Cdca8Q8BHX3 Hist2h4-201ENSMUST00000171473 1630 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cdca8Q8BHX3 Gpcpd1-202ENSMUST00000060955 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cdca8Q8BHX3 Usp24-201ENSMUST00000094933 10575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cdca8Q8BHX3 Paqr8-203ENSMUST00000187651 1463 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cdca8Q8BHX3 Hsd17b6-203ENSMUST00000219447 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cdca8Q8BHX3 Map4-206ENSMUST00000169851 3446 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cdca8Q8BHX3 Pax5-203ENSMUST00000107825 1445 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cdca8Q8BHX3 Foxn2-201ENSMUST00000112238 5085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cdca8Q8BHX3 Tyw1-201ENSMUST00000040213 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cdca8Q8BHX3 Gsg1-202ENSMUST00000111909 1087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cdca8Q8BHX3 Gm8731-201ENSMUST00000118088 412 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Cdca8Q8BHX3 AA387200-201ENSMUST00000147463 1177 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cdca8Q8BHX3 Ntng1-211ENSMUST00000156177 4652 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cdca8Q8BHX3 Gm20495-201ENSMUST00000173902 235 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Cdca8Q8BHX3 Gm23771-201ENSMUST00000178702 110 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Cdca8Q8BHX3 Dnajb6-212ENSMUST00000198694 505 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cdca8Q8BHX3 AC161424.1-202ENSMUST00000213570 767 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cdca8Q8BHX3 Sat1-201ENSMUST00000026318 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cdca8Q8BHX3 Setdb1-202ENSMUST00000107170 4622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cdca8Q8BHX3 Cacna1s-201ENSMUST00000112064 6251 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cdca8Q8BHX3 Lrrn4-201ENSMUST00000049787 3715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cdca8Q8BHX3 Metap2-201ENSMUST00000047910 4424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cdca8Q8BHX3 Pde4b-203ENSMUST00000097950 2756 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cdca8Q8BHX3 Gp2-201ENSMUST00000033255 1993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cdca8Q8BHX3 Slc2a10-201ENSMUST00000029196 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cdca8Q8BHX3 Parp14-201ENSMUST00000042665 7417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cdca8Q8BHX3 Plin4-201ENSMUST00000002908 5755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cdca8Q8BHX3 9330182L06Rik-204ENSMUST00000134991 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cdca8Q8BHX3 Kbtbd12-206ENSMUST00000184878 3351 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cdca8Q8BHX3 Slc9a3-204ENSMUST00000225423 2589 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cdca8Q8BHX3 Klhl14-201ENSMUST00000049105 4018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cdca8Q8BHX3 4933431E20Rik-201ENSMUST00000131345 5407 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cdca8Q8BHX3 Ebf3-202ENSMUST00000106118 3736 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cdca8Q8BHX3 Gm26794-201ENSMUST00000180810 4312 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cdca8Q8BHX3 Vwa1-201ENSMUST00000042196 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cdca8Q8BHX3 Gm17281-201ENSMUST00000180732 3589 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cdca8Q8BHX3 Adarb1-204ENSMUST00000105406 6662 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cdca8Q8BHX3 Pdzk1-202ENSMUST00000107069 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cdca8Q8BHX3 Rsad1-201ENSMUST00000040487 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cdca8Q8BHX3 D130019J16Rik-201ENSMUST00000193261 2158 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Cdca8Q8BHX3 Tbcel-206ENSMUST00000138506 1534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cdca8Q8BHX3 Syk-201ENSMUST00000055087 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
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Cdca8Q8BHX3 AC169511.2-201ENSMUST00000226674 2063 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
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Cdca8Q8BHX3 Gm4409-201ENSMUST00000130734 1919 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cdca8Q8BHX3 Mov10l1-203ENSMUST00000146993 4133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
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Cdca8Q8BHX3 Tanc1-201ENSMUST00000037526 7873 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
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Cdca8Q8BHX3 Epha7-204ENSMUST00000108194 2323 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cdca8Q8BHX3 Gm14193-201ENSMUST00000105067 153 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Cdca8Q8BHX3 Gm14314-201ENSMUST00000118225 1015 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Cdca8Q8BHX3 2900011O08Rik-202ENSMUST00000118412 954 ntTSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cdca8Q8BHX3 4931406G06Rik-201ENSMUST00000147848 1252 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
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Cdca8Q8BHX3 Olfr354-201ENSMUST00000068475 1084 ntAPPRIS P1 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cdca8Q8BHX3 Gm4978-201ENSMUST00000071565 801 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Cdca8Q8BHX3 Zfp68-201ENSMUST00000063262 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cdca8Q8BHX3 Pcdhga6-201ENSMUST00000195823 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cdca8Q8BHX3 Npas2-201ENSMUST00000056815 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cdca8Q8BHX3 Smtn-203ENSMUST00000075118 3117 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cdca8Q8BHX3 Gm8378-202ENSMUST00000167777 2624 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cdca8Q8BHX3 Swap70-201ENSMUST00000033325 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cdca8Q8BHX3 Gm4869-201ENSMUST00000197549 2955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cdca8Q8BHX3 Madd-207ENSMUST00000111369 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cdca8Q8BHX3 Cd6-202ENSMUST00000039043 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cdca8Q8BHX3 Plscr1-202ENSMUST00000186364 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Cdca8Q8BHX3 Frmd4a-216ENSMUST00000176828 4355 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Cdca8Q8BHX3 Plin2-201ENSMUST00000000466 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Cdca8Q8BHX3 Gm20498-203ENSMUST00000166664 2284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Cdca8Q8BHX3 Sept9-205ENSMUST00000106354 3869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Cdca8Q8BHX3 Ccdc191-201ENSMUST00000122014 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Cdca8Q8BHX3 Tab1-201ENSMUST00000023050 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Cdca8Q8BHX3 Abt1-201ENSMUST00000041782 4456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Cdca8Q8BHX3 Myh2-201ENSMUST00000018641 6018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Cdca8Q8BHX3 Foxp1-201ENSMUST00000074346 2118 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Cdca8Q8BHX3 Tax1bp1-201ENSMUST00000080723 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Cdca8Q8BHX3 Gm37954-201ENSMUST00000195400 2071 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Cdca8Q8BHX3 Hvcn1-202ENSMUST00000100747 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Cdca8Q8BHX3 Capza1-201ENSMUST00000094028 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Cdca8Q8BHX3 Rps9-203ENSMUST00000108624 478 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.5 ms