Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSQ1

Clec18a, C-type lectin domain family 18 member A, mousemouse

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Length 534 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clec18aQ7TSQ1 Cntrobos-201ENSMUST00000132834 383 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Clec18aQ7TSQ1 E130307A14Rik-203ENSMUST00000136862 608 ntTSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Clec18aQ7TSQ1 Cdpf1-205ENSMUST00000150995 566 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Clec18aQ7TSQ1 Mir6407-201ENSMUST00000184510 101 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Clec18aQ7TSQ1 Kdm4dl-201ENSMUST00000184843 1187 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Clec18aQ7TSQ1 Gm9116-201ENSMUST00000192400 1018 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Clec18aQ7TSQ1 Pbld1-204ENSMUST00000219045 602 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Clec18aQ7TSQ1 AC099934.4-201ENSMUST00000220745 523 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Clec18aQ7TSQ1 1700012P22Rik-201ENSMUST00000030323 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Clec18aQ7TSQ1 Gm23105-201ENSMUST00000083719 134 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Clec18aQ7TSQ1 Snrpg-201ENSMUST00000089558 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Clec18aQ7TSQ1 Gm5544-201ENSMUST00000098828 891 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Clec18aQ7TSQ1 9430015G10Rik-201ENSMUST00000072554 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Clec18aQ7TSQ1 Aldoart2-201ENSMUST00000080123 1658 ntAPPRIS P1 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Clec18aQ7TSQ1 Trim25-203ENSMUST00000107896 5590 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Clec18aQ7TSQ1 Nxpe5-204ENSMUST00000161047 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Clec18aQ7TSQ1 6030443J06Rik-201ENSMUST00000181209 2380 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Clec18aQ7TSQ1 Gm44573-201ENSMUST00000191753 2370 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Clec18aQ7TSQ1 Tbrg1-201ENSMUST00000117654 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Clec18aQ7TSQ1 Zfp593-201ENSMUST00000030644 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Clec18aQ7TSQ1 Tmem8b-201ENSMUST00000107864 4726 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Clec18aQ7TSQ1 Zbtb45-205ENSMUST00000210282 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Clec18aQ7TSQ1 Nop14-201ENSMUST00000041364 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Clec18aQ7TSQ1 Dna2-203ENSMUST00000131422 4122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Clec18aQ7TSQ1 Tacc2-217ENSMUST00000209108 3310 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Clec18aQ7TSQ1 Spdye4a-203ENSMUST00000195900 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Clec18aQ7TSQ1 Mknk1-202ENSMUST00000106513 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Clec18aQ7TSQ1 Tspoap1-201ENSMUST00000039627 7616 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Clec18aQ7TSQ1 Pigh-203ENSMUST00000217998 2868 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Clec18aQ7TSQ1 Tns1-209ENSMUST00000187691 2813 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Clec18aQ7TSQ1 Atp1a2-201ENSMUST00000085913 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Clec18aQ7TSQ1 Slc10a3-204ENSMUST00000114147 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Clec18aQ7TSQ1 Bco1-202ENSMUST00000167370 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Clec18aQ7TSQ1 Slc43a1-204ENSMUST00000121114 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Clec18aQ7TSQ1 Mest-210ENSMUST00000157040 2383 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Clec18aQ7TSQ1 AC153380.1-201ENSMUST00000214959 2364 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Clec18aQ7TSQ1 Gem-202ENSMUST00000108304 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Clec18aQ7TSQ1 Dclk1-215ENSMUST00000200352 1662 ntTSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Clec18aQ7TSQ1 Zfp384-206ENSMUST00000112425 2691 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Clec18aQ7TSQ1 4930520O04Rik-202ENSMUST00000131898 2660 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Clec18aQ7TSQ1 Ces2e-201ENSMUST00000034355 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Clec18aQ7TSQ1 Fut10-202ENSMUST00000110527 2327 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Clec18aQ7TSQ1 Prkd2-201ENSMUST00000086104 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Clec18aQ7TSQ1 Meaf6-205ENSMUST00000154689 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Clec18aQ7TSQ1 Apbb2-216ENSMUST00000162366 6540 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Clec18aQ7TSQ1 Anxa9-204ENSMUST00000164406 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Clec18aQ7TSQ1 Gm3716-202ENSMUST00000198582 2879 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Clec18aQ7TSQ1 Polr2i-203ENSMUST00000108193 488 ntTSL 3 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Clec18aQ7TSQ1 Gm11801-201ENSMUST00000117807 746 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Clec18aQ7TSQ1 Gm11244-201ENSMUST00000121243 237 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Clec18aQ7TSQ1 Tbata-203ENSMUST00000121297 1000 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Clec18aQ7TSQ1 1700008A23Rik-201ENSMUST00000191694 691 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Clec18aQ7TSQ1 D5Ertd615e-203ENSMUST00000198493 1032 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
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Clec18aQ7TSQ1 AC156501.1-201ENSMUST00000228219 270 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Clec18aQ7TSQ1 Nudt2-201ENSMUST00000030154 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Clec18aQ7TSQ1 H3f3a-201ENSMUST00000081026 888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Clec18aQ7TSQ1 Synpr-201ENSMUST00000070323 2541 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Clec18aQ7TSQ1 Gja8-201ENSMUST00000062944 6940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Clec18aQ7TSQ1 Gm28042-203ENSMUST00000156805 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Clec18aQ7TSQ1 Slc6a12-205ENSMUST00000166457 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Clec18aQ7TSQ1 Rab11fip4os1-201ENSMUST00000145652 2187 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Clec18aQ7TSQ1 Tmem109-201ENSMUST00000038128 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Clec18aQ7TSQ1 Gm20755-201ENSMUST00000196893 1827 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
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Clec18aQ7TSQ1 4933406M09Rik-201ENSMUST00000162187 1768 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Clec18aQ7TSQ1 Nr5a2-205ENSMUST00000192929 1756 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Clec18aQ7TSQ1 Swap70-201ENSMUST00000033325 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Clec18aQ7TSQ1 Triobp-203ENSMUST00000109689 7187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Clec18aQ7TSQ1 BC004004-203ENSMUST00000149405 1402 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Clec18aQ7TSQ1 Gm13684-201ENSMUST00000152569 2264 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Clec18aQ7TSQ1 Pdzd7-203ENSMUST00000169459 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Clec18aQ7TSQ1 Ecsit-204ENSMUST00000180180 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Clec18aQ7TSQ1 Flad1-202ENSMUST00000107426 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Clec18aQ7TSQ1 Abi1-204ENSMUST00000114544 2790 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Clec18aQ7TSQ1 Idi1-201ENSMUST00000169314 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Clec18aQ7TSQ1 Sparc-207ENSMUST00000213866 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Clec18aQ7TSQ1 Tfip11-201ENSMUST00000031288 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Clec18aQ7TSQ1 Ccdc96-201ENSMUST00000060100 3585 ntAPPRIS P1 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Clec18aQ7TSQ1 Ccndbp1-203ENSMUST00000099489 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Clec18aQ7TSQ1 Axin2-201ENSMUST00000052915 4260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Clec18aQ7TSQ1 Ncstn-201ENSMUST00000003550 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Clec18aQ7TSQ1 Alg12-204ENSMUST00000162183 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Clec18aQ7TSQ1 4930432K21Rik-202ENSMUST00000118856 2366 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Clec18aQ7TSQ1 Map4-206ENSMUST00000169851 3446 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Clec18aQ7TSQ1 Ccm2-202ENSMUST00000109721 1551 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Clec18aQ7TSQ1 Pip5kl1-201ENSMUST00000055304 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Clec18aQ7TSQ1 Prpf19-203ENSMUST00000179297 6035 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Clec18aQ7TSQ1 Sh2d2a-202ENSMUST00000107581 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Clec18aQ7TSQ1 Gm7642-201ENSMUST00000216345 1809 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Clec18aQ7TSQ1 Dlk1-201ENSMUST00000056110 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Clec18aQ7TSQ1 C1qtnf3-201ENSMUST00000022853 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Clec18aQ7TSQ1 Rsad1-201ENSMUST00000040487 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Clec18aQ7TSQ1 Ighv10-1-201ENSMUST00000103492 359 ntAPPRIS P1 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Clec18aQ7TSQ1 Nudt6-203ENSMUST00000108117 879 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Clec18aQ7TSQ1 Rpl15-204ENSMUST00000112598 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Clec18aQ7TSQ1 Gm14397-201ENSMUST00000124728 576 ntTSL 3 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 99.4 ms