Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSF1

Dsg1b, Desmoglein-1-beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,060 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg1bQ7TSF1 S100a4-201ENSMUST00000001046 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Dsg1bQ7TSF1 Ctrc-202ENSMUST00000105781 784 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Dsg1bQ7TSF1 Zfp189-202ENSMUST00000107696 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Dsg1bQ7TSF1 Tprkb-203ENSMUST00000113751 692 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Dsg1bQ7TSF1 Olfr1267-ps1-201ENSMUST00000118957 930 ntAPPRIS P1 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Dsg1bQ7TSF1 Srrm3os-201ENSMUST00000131896 1271 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Dsg1bQ7TSF1 Gm13010-201ENSMUST00000140495 828 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Dsg1bQ7TSF1 Gm11290-203ENSMUST00000147811 314 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Dsg1bQ7TSF1 H2-M2-202ENSMUST00000171139 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Dsg1bQ7TSF1 Gm6358-202ENSMUST00000187643 489 ntAPPRIS P5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Dsg1bQ7TSF1 B230112I24Rik-201ENSMUST00000203953 1229 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Dsg1bQ7TSF1 CT009754.4-201ENSMUST00000221430 565 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Dsg1bQ7TSF1 Mrps34-201ENSMUST00000043907 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Dsg1bQ7TSF1 Gm23680-201ENSMUST00000083162 164 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Dsg1bQ7TSF1 Gm6509-201ENSMUST00000098286 1218 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Dsg1bQ7TSF1 Emc1-201ENSMUST00000042096 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Dsg1bQ7TSF1 Madd-208ENSMUST00000111370 5879 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Dsg1bQ7TSF1 Madd-214ENSMUST00000111381 5873 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Dsg1bQ7TSF1 Brd4-202ENSMUST00000114475 2731 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Dsg1bQ7TSF1 Sgca-202ENSMUST00000103162 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Dsg1bQ7TSF1 Lingo4-201ENSMUST00000050975 3645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Dsg1bQ7TSF1 Hnrnph2-205ENSMUST00000113203 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Dsg1bQ7TSF1 Samd11-201ENSMUST00000179919 2610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Dsg1bQ7TSF1 Hsd17b13-202ENSMUST00000112803 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Dsg1bQ7TSF1 Gm8899-201ENSMUST00000214635 1332 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Dsg1bQ7TSF1 Nmt1-201ENSMUST00000021314 4861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Dsg1bQ7TSF1 E230029C05Rik-203ENSMUST00000208028 2066 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Dsg1bQ7TSF1 Pdzk1-202ENSMUST00000107069 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Dsg1bQ7TSF1 Rtn4ip1-201ENSMUST00000054418 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Dsg1bQ7TSF1 Atp6v1a-201ENSMUST00000063661 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Dsg1bQ7TSF1 Megf11-203ENSMUST00000118485 3944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Dsg1bQ7TSF1 Tfdp2-205ENSMUST00000179416 2408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Dsg1bQ7TSF1 Mybph-201ENSMUST00000038445 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Dsg1bQ7TSF1 Tgoln1-201ENSMUST00000070524 5013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Dsg1bQ7TSF1 Dmp1-201ENSMUST00000066708 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Dsg1bQ7TSF1 Rnf144b-201ENSMUST00000068891 4640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Dsg1bQ7TSF1 Muc3-201ENSMUST00000041226 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Dsg1bQ7TSF1 Grm4-202ENSMUST00000118489 2976 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Dsg1bQ7TSF1 Prrxl1-204ENSMUST00000189022 2985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Dsg1bQ7TSF1 4930484H19Rik-201ENSMUST00000218870 1737 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Dsg1bQ7TSF1 Gm12208-201ENSMUST00000122004 163 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Dsg1bQ7TSF1 Nhp2-202ENSMUST00000127405 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Dsg1bQ7TSF1 1700122E12Rik-202ENSMUST00000147538 479 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Dsg1bQ7TSF1 Plgrkt-209ENSMUST00000152936 604 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Dsg1bQ7TSF1 Elof1-202ENSMUST00000166335 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Dsg1bQ7TSF1 Gm17709-201ENSMUST00000174536 1096 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Dsg1bQ7TSF1 Gm28306-201ENSMUST00000191315 529 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Dsg1bQ7TSF1 Gm35025-203ENSMUST00000193519 634 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Dsg1bQ7TSF1 Fxyd4-202ENSMUST00000203066 522 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Dsg1bQ7TSF1 Itgax-203ENSMUST00000205460 1215 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Dsg1bQ7TSF1 Gm31166-202ENSMUST00000210638 1268 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Dsg1bQ7TSF1 Acy1-209ENSMUST00000215395 1051 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Dsg1bQ7TSF1 Gm36176-201ENSMUST00000218749 501 ntAPPRIS P1 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Dsg1bQ7TSF1 AC160929.1-201ENSMUST00000221247 415 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Dsg1bQ7TSF1 Lgi3-203ENSMUST00000226548 1001 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Dsg1bQ7TSF1 Atp6v1g1-201ENSMUST00000035301 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Dsg1bQ7TSF1 Frg2f1-201ENSMUST00000079611 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Dsg1bQ7TSF1 Tom1l2-206ENSMUST00000102683 4999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Dsg1bQ7TSF1 Bzw1-201ENSMUST00000050552 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Dsg1bQ7TSF1 Slc22a5-201ENSMUST00000019044 3062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Dsg1bQ7TSF1 Trim46-201ENSMUST00000041022 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Dsg1bQ7TSF1 Tubd1-203ENSMUST00000108030 1964 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Dsg1bQ7TSF1 Ces2a-201ENSMUST00000034346 1960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Dsg1bQ7TSF1 Tenm2-201ENSMUST00000057207 8298 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Dsg1bQ7TSF1 Ank3-204ENSMUST00000092432 5832 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Dsg1bQ7TSF1 Pla2g6-206ENSMUST00000173163 3018 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Dsg1bQ7TSF1 Olfr624-201ENSMUST00000062144 5731 ntAPPRIS P1 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Dsg1bQ7TSF1 Cbfa2t2-204ENSMUST00000109725 6080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Dsg1bQ7TSF1 Brd3-201ENSMUST00000028282 5419 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Dsg1bQ7TSF1 Rap1gap-201ENSMUST00000047243 3247 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Dsg1bQ7TSF1 Nlrp6-203ENSMUST00000183845 4436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Dsg1bQ7TSF1 Drd1-202ENSMUST00000221470 3576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Dsg1bQ7TSF1 Grin1-208ENSMUST00000114318 3920 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Dsg1bQ7TSF1 Nars2-201ENSMUST00000044466 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Dsg1bQ7TSF1 Cpsf4l-202ENSMUST00000100248 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Dsg1bQ7TSF1 BC024139-202ENSMUST00000089654 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Dsg1bQ7TSF1 Fnbp1-210ENSMUST00000113564 3892 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Dsg1bQ7TSF1 Gm32856-201ENSMUST00000212145 3767 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Dsg1bQ7TSF1 Wnt7b-203ENSMUST00000167968 3408 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Dsg1bQ7TSF1 Msantd2-204ENSMUST00000211060 2165 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Dsg1bQ7TSF1 Ighv1-81-201ENSMUST00000103548 351 ntAPPRIS P1 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Dsg1bQ7TSF1 Trgv2-201ENSMUST00000103563 491 ntAPPRIS P1 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Dsg1bQ7TSF1 Xlr4c-204ENSMUST00000114531 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Dsg1bQ7TSF1 Vmn1r-ps104-201ENSMUST00000120960 771 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Dsg1bQ7TSF1 Gm13366-201ENSMUST00000122198 970 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Dsg1bQ7TSF1 Gm21972-201ENSMUST00000135197 776 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Dsg1bQ7TSF1 Tmem40-206ENSMUST00000170625 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Dsg1bQ7TSF1 Ddt-202ENSMUST00000172820 574 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Dsg1bQ7TSF1 Gm20420-201ENSMUST00000173178 639 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Dsg1bQ7TSF1 Gm19246-201ENSMUST00000173599 255 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Dsg1bQ7TSF1 Gm18351-201ENSMUST00000188646 883 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Dsg1bQ7TSF1 Gm37800-202ENSMUST00000193667 553 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Dsg1bQ7TSF1 Gm43163-201ENSMUST00000196571 442 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Dsg1bQ7TSF1 Gm43298-201ENSMUST00000200887 866 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Dsg1bQ7TSF1 Gm8615-202ENSMUST00000201946 737 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Dsg1bQ7TSF1 Gm18561-201ENSMUST00000206027 804 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Dsg1bQ7TSF1 AC114645.1-201ENSMUST00000215831 187 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Dsg1bQ7TSF1 Gm34973-201ENSMUST00000217087 572 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Dsg1bQ7TSF1 Gm35638-201ENSMUST00000220724 652 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Dsg1bQ7TSF1 AC102368.1-201ENSMUST00000227161 892 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.4 ms