Protein–RNA interactions for Protein: Q6VGS5

Ccdc88c, Protein Daple, mousemouse

Predictions only

Length 2,009 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc88cQ6VGS5 Pgap2-201ENSMUST00000033292 1201 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ccdc88cQ6VGS5 H2-Aa-201ENSMUST00000040655 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ccdc88cQ6VGS5 Adck1-201ENSMUST00000101165 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ccdc88cQ6VGS5 6030443J06Rik-201ENSMUST00000181209 2380 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ccdc88cQ6VGS5 4930558J22Rik-201ENSMUST00000139822 1480 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ccdc88cQ6VGS5 Sspn-201ENSMUST00000032383 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ccdc88cQ6VGS5 Eogt-201ENSMUST00000054344 4424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ccdc88cQ6VGS5 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ccdc88cQ6VGS5 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ccdc88cQ6VGS5 Vangl1-208ENSMUST00000168312 1740 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ccdc88cQ6VGS5 4930402K13Rik-201ENSMUST00000059967 1781 ntAPPRIS P1 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ccdc88cQ6VGS5 Ing1-206ENSMUST00000210740 1866 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ccdc88cQ6VGS5 Fggy-201ENSMUST00000043335 1910 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ccdc88cQ6VGS5 Slitrk4-202ENSMUST00000114679 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ccdc88cQ6VGS5 A930006I01Rik-201ENSMUST00000139065 2229 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ccdc88cQ6VGS5 Wdr82-201ENSMUST00000020490 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ccdc88cQ6VGS5 Gdpd2-201ENSMUST00000019503 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ccdc88cQ6VGS5 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ccdc88cQ6VGS5 Ikzf4-201ENSMUST00000133342 5150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ccdc88cQ6VGS5 Tcf7l2-204ENSMUST00000111649 982 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ccdc88cQ6VGS5 Yipf6-202ENSMUST00000113811 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ccdc88cQ6VGS5 Gm13351-201ENSMUST00000118087 414 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Ccdc88cQ6VGS5 Gsta3-202ENSMUST00000121676 894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ccdc88cQ6VGS5 Dydc1-202ENSMUST00000161837 829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ccdc88cQ6VGS5 Pax4-202ENSMUST00000164519 1229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
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Ccdc88cQ6VGS5 Gm8701-201ENSMUST00000169259 874 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Ccdc88cQ6VGS5 Pax4-203ENSMUST00000171089 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ccdc88cQ6VGS5 Gm9574-201ENSMUST00000173127 845 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Ccdc88cQ6VGS5 2310057N15Rik-201ENSMUST00000054223 1028 ntAPPRIS P1 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ccdc88cQ6VGS5 Try5-201ENSMUST00000064324 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ccdc88cQ6VGS5 Prr19-201ENSMUST00000080288 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ccdc88cQ6VGS5 Gm10020-201ENSMUST00000081993 612 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Ccdc88cQ6VGS5 Olfr553-201ENSMUST00000098222 981 ntAPPRIS P1 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ccdc88cQ6VGS5 Ndufaf1-203ENSMUST00000110802 1308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ccdc88cQ6VGS5 Arih1-202ENSMUST00000165322 1431 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ccdc88cQ6VGS5 Becn1-205ENSMUST00000130916 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ccdc88cQ6VGS5 Gm15984-202ENSMUST00000156466 1534 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ccdc88cQ6VGS5 Apol9a-202ENSMUST00000089452 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ccdc88cQ6VGS5 Gm6560-201ENSMUST00000198588 1591 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Ccdc88cQ6VGS5 Gm5122-202ENSMUST00000216854 1637 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ccdc88cQ6VGS5 Gm5739-201ENSMUST00000208601 1703 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Ccdc88cQ6VGS5 Trim56-201ENSMUST00000054384 9279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ccdc88cQ6VGS5 Rab11fip4os1-201ENSMUST00000145652 2187 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ccdc88cQ6VGS5 Tmbim1-202ENSMUST00000113796 11011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ccdc88cQ6VGS5 Rai2-201ENSMUST00000061514 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ccdc88cQ6VGS5 Ebf2-202ENSMUST00000176029 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ccdc88cQ6VGS5 Pfn4-204ENSMUST00000219503 4775 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ccdc88cQ6VGS5 Nexmif-202ENSMUST00000087879 10891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ccdc88cQ6VGS5 Cic-212ENSMUST00000169266 8221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ccdc88cQ6VGS5 Dpp8-201ENSMUST00000034960 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ccdc88cQ6VGS5 Inpp4a-203ENSMUST00000114933 3004 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ccdc88cQ6VGS5 Tbc1d14-204ENSMUST00000130417 2665 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
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Ccdc88cQ6VGS5 Cct3-208ENSMUST00000168062 1943 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ccdc88cQ6VGS5 Atp6v0e2-202ENSMUST00000203011 1612 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ccdc88cQ6VGS5 Anxa3-205ENSMUST00000198631 1523 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ccdc88cQ6VGS5 Cacna1g-204ENSMUST00000107785 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
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Ccdc88cQ6VGS5 Slc37a4-202ENSMUST00000213268 1353 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
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Ccdc88cQ6VGS5 Gm26686-201ENSMUST00000181951 3467 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ccdc88cQ6VGS5 Cc2d1a-201ENSMUST00000040383 3471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ccdc88cQ6VGS5 Pip5k1a-204ENSMUST00000107232 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ccdc88cQ6VGS5 Flvcr2-201ENSMUST00000040461 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ccdc88cQ6VGS5 Csnk1a1-202ENSMUST00000163205 3204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ccdc88cQ6VGS5 Angptl4-201ENSMUST00000002360 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ccdc88cQ6VGS5 Dnajc12-201ENSMUST00000043317 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ccdc88cQ6VGS5 Hnrnpk-202ENSMUST00000116403 2970 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ccdc88cQ6VGS5 Emp1-201ENSMUST00000032330 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ccdc88cQ6VGS5 Fntb-201ENSMUST00000041008 2613 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ccdc88cQ6VGS5 Cyb5r3-202ENSMUST00000162178 2547 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ccdc88cQ6VGS5 Lrp12-201ENSMUST00000022916 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ccdc88cQ6VGS5 Rspry1-201ENSMUST00000060389 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ccdc88cQ6VGS5 Gm16677-201ENSMUST00000181229 2174 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ccdc88cQ6VGS5 Gm27174-201ENSMUST00000184493 2174 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ccdc88cQ6VGS5 Hcn1-201ENSMUST00000006991 14141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ccdc88cQ6VGS5 Mylk-201ENSMUST00000023538 7824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ccdc88cQ6VGS5 Map4-214ENSMUST00000199498 4055 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ccdc88cQ6VGS5 Nudt7-203ENSMUST00000109109 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ccdc88cQ6VGS5 Slc52a2-201ENSMUST00000023220 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ccdc88cQ6VGS5 Pigu-205ENSMUST00000165234 1626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ccdc88cQ6VGS5 Dync1i2-201ENSMUST00000081710 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ccdc88cQ6VGS5 Impdh2-ps-201ENSMUST00000120826 1545 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Ccdc88cQ6VGS5 Agpat3-211ENSMUST00000166360 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ccdc88cQ6VGS5 Vcp-rs-201ENSMUST00000120233 2406 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Ccdc88cQ6VGS5 Rabggtb-202ENSMUST00000167111 1418 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ccdc88cQ6VGS5 Ighv13-1-201ENSMUST00000103480 294 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Ccdc88cQ6VGS5 Cdc42se1-203ENSMUST00000107200 637 ntTSL 3 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ccdc88cQ6VGS5 Gm11980-201ENSMUST00000121445 986 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
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