Protein–RNA interactions for Protein: Q6KCD5

Nipbl, Nipped-B-like protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,798 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NipblQ6KCD5 Adgre5-201ENSMUST00000002964 2986 ntTSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
NipblQ6KCD5 Smtn-204ENSMUST00000110011 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.55□□□□□ -1.04
NipblQ6KCD5 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
NipblQ6KCD5 Atp6v0a1-210ENSMUST00000168757 3967 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.55□□□□□ -1.04
NipblQ6KCD5 Bcl2l2-203ENSMUST00000133397 3813 ntTSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
NipblQ6KCD5 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
NipblQ6KCD5 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
NipblQ6KCD5 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
NipblQ6KCD5 Gm5171-201ENSMUST00000214944 1415 ntBASIC8.55□□□□□ -1.04
NipblQ6KCD5 Mapk8-202ENSMUST00000111942 927 ntTSL 5 BASIC8.55□□□□□ -1.04
NipblQ6KCD5 Syngr4-202ENSMUST00000120299 722 ntTSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
NipblQ6KCD5 Tnni1-204ENSMUST00000139986 651 ntTSL 5 BASIC8.55□□□□□ -1.04
NipblQ6KCD5 Gm13412-201ENSMUST00000150621 677 ntTSL 3 BASIC8.55□□□□□ -1.04
NipblQ6KCD5 Gm17221-201ENSMUST00000163909 481 ntBASIC8.55□□□□□ -1.04
NipblQ6KCD5 Gm17073-201ENSMUST00000168069 556 ntBASIC8.55□□□□□ -1.04
NipblQ6KCD5 Gm26725-201ENSMUST00000180652 1113 ntTSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
NipblQ6KCD5 Mrip-ps-201ENSMUST00000184613 940 ntBASIC8.55□□□□□ -1.04
NipblQ6KCD5 Gm43564-201ENSMUST00000196185 211 ntBASIC8.55□□□□□ -1.04
NipblQ6KCD5 Olfr1380-201ENSMUST00000204300 938 ntAPPRIS P1 BASIC8.55□□□□□ -1.04
NipblQ6KCD5 4930447C11Rik-201ENSMUST00000204503 928 ntBASIC8.55□□□□□ -1.04
NipblQ6KCD5 Gm2721-202ENSMUST00000222652 459 ntTSL 5 BASIC8.55□□□□□ -1.04
NipblQ6KCD5 Yipf7-201ENSMUST00000031045 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
NipblQ6KCD5 Crygd-201ENSMUST00000045028 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
NipblQ6KCD5 Adamts16-202ENSMUST00000109694 3378 ntTSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
NipblQ6KCD5 Nr4a2-202ENSMUST00000112627 2400 ntTSL 5 BASIC8.55□□□□□ -1.04
NipblQ6KCD5 Mgll-207ENSMUST00000163271 3991 ntTSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
NipblQ6KCD5 Cdkl2-201ENSMUST00000069937 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
NipblQ6KCD5 Sipa1l2-204ENSMUST00000212987 6690 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.55□□□□□ -1.04
NipblQ6KCD5 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
NipblQ6KCD5 Hemk1-201ENSMUST00000035196 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
NipblQ6KCD5 Wnt9b-201ENSMUST00000018630 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
NipblQ6KCD5 Hdac5-201ENSMUST00000008999 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
NipblQ6KCD5 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
NipblQ6KCD5 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
NipblQ6KCD5 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
NipblQ6KCD5 Pin1-201ENSMUST00000034689 3843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
NipblQ6KCD5 Lrrc61-201ENSMUST00000101436 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
NipblQ6KCD5 Gnb1l-204ENSMUST00000115601 3507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
NipblQ6KCD5 Gnb1l-202ENSMUST00000090086 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
NipblQ6KCD5 Entpd5-203ENSMUST00000110272 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
NipblQ6KCD5 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
NipblQ6KCD5 Sbno2-209ENSMUST00000219260 4850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.55□□□□□ -1.04
NipblQ6KCD5 Gm17836-201ENSMUST00000191976 1302 ntBASIC8.55□□□□□ -1.04
NipblQ6KCD5 Trav13-2-201ENSMUST00000103658 390 ntAPPRIS P1 BASIC8.55□□□□□ -1.04
NipblQ6KCD5 Tnnt3-203ENSMUST00000105941 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
NipblQ6KCD5 Tnnt3-204ENSMUST00000105942 720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
NipblQ6KCD5 Tnnt3-205ENSMUST00000105943 720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
NipblQ6KCD5 Tnnt3-207ENSMUST00000105945 747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
NipblQ6KCD5 Tnnt3-208ENSMUST00000105946 765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
NipblQ6KCD5 Gm12240-201ENSMUST00000120178 229 ntBASIC8.55□□□□□ -1.04
NipblQ6KCD5 Ndufb5-202ENSMUST00000121778 574 ntTSL 3 BASIC8.55□□□□□ -1.04
NipblQ6KCD5 Cfap100-204ENSMUST00000134224 849 ntTSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
NipblQ6KCD5 Gm23899-201ENSMUST00000158112 90 ntBASIC8.55□□□□□ -1.04
NipblQ6KCD5 Gm22662-201ENSMUST00000175290 256 ntBASIC8.55□□□□□ -1.04
NipblQ6KCD5 Gm24300-201ENSMUST00000177809 109 ntBASIC8.55□□□□□ -1.04
NipblQ6KCD5 Gm24017-201ENSMUST00000178726 109 ntBASIC8.55□□□□□ -1.04
NipblQ6KCD5 Bhmt-ps1-201ENSMUST00000178743 1224 ntBASIC8.55□□□□□ -1.04
NipblQ6KCD5 Gm23952-201ENSMUST00000179380 109 ntBASIC8.55□□□□□ -1.04
NipblQ6KCD5 Gm27316-201ENSMUST00000184884 277 ntBASIC8.55□□□□□ -1.04
NipblQ6KCD5 Gm20781-201ENSMUST00000193154 693 ntBASIC8.55□□□□□ -1.04
NipblQ6KCD5 Gm21736-201ENSMUST00000195399 693 ntBASIC8.55□□□□□ -1.04
NipblQ6KCD5 Gm38314-201ENSMUST00000195709 625 ntBASIC8.55□□□□□ -1.04
NipblQ6KCD5 Gm43103-201ENSMUST00000199021 802 ntBASIC8.55□□□□□ -1.04
NipblQ6KCD5 AC134607.1-201ENSMUST00000214707 485 ntBASIC8.55□□□□□ -1.04
NipblQ6KCD5 Gm34973-201ENSMUST00000217087 572 ntTSL 3 BASIC8.55□□□□□ -1.04
NipblQ6KCD5 AC155293.1-201ENSMUST00000219793 1026 ntBASIC8.55□□□□□ -1.04
NipblQ6KCD5 AC125223.1-201ENSMUST00000224004 749 ntBASIC8.55□□□□□ -1.04
NipblQ6KCD5 AC159196.1-201ENSMUST00000225524 377 ntBASIC8.55□□□□□ -1.04
NipblQ6KCD5 AC122356.2-201ENSMUST00000226962 820 ntBASIC8.55□□□□□ -1.04
NipblQ6KCD5 Cst13-201ENSMUST00000046589 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
NipblQ6KCD5 Cenpu-202ENSMUST00000093518 783 ntTSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
NipblQ6KCD5 Thrap3-201ENSMUST00000080919 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
NipblQ6KCD5 Gm29684-201ENSMUST00000220248 1982 ntTSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
NipblQ6KCD5 Zdhhc6-205ENSMUST00000224291 2603 ntBASIC8.55□□□□□ -1.04
NipblQ6KCD5 Xkr6-202ENSMUST00000120820 1702 ntTSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
NipblQ6KCD5 Ush1c-201ENSMUST00000009667 3072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
NipblQ6KCD5 Arhgap19-204ENSMUST00000177495 1652 ntTSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
NipblQ6KCD5 Mak-203ENSMUST00000165087 3562 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
NipblQ6KCD5 4930517J16Rik-201ENSMUST00000193095 1568 ntBASIC8.54□□□□□ -1.04
NipblQ6KCD5 Cxcr5-204ENSMUST00000215293 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
NipblQ6KCD5 Nyap1-202ENSMUST00000118326 4565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
NipblQ6KCD5 AC122860.2-201ENSMUST00000217967 2671 ntBASIC8.54□□□□□ -1.04
NipblQ6KCD5 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
NipblQ6KCD5 Kyat1-206ENSMUST00000113663 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
NipblQ6KCD5 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
NipblQ6KCD5 Kansl3-201ENSMUST00000010597 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
NipblQ6KCD5 Dpep2-202ENSMUST00000117555 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
NipblQ6KCD5 Alox5-207ENSMUST00000170186 1929 ntTSL 5 BASIC8.54□□□□□ -1.04
NipblQ6KCD5 AC166359.1-201ENSMUST00000220243 1871 ntBASIC8.54□□□□□ -1.04
NipblQ6KCD5 Eid3-201ENSMUST00000211623 1305 ntAPPRIS P1 BASIC8.54□□□□□ -1.04
NipblQ6KCD5 Cwc25-202ENSMUST00000107579 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
NipblQ6KCD5 Gm12397-201ENSMUST00000117674 615 ntBASIC8.54□□□□□ -1.04
NipblQ6KCD5 Nhp2-202ENSMUST00000127405 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
NipblQ6KCD5 Pabpn1-203ENSMUST00000139985 903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.54□□□□□ -1.04
NipblQ6KCD5 Pax4-202ENSMUST00000164519 1229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
NipblQ6KCD5 Pax4-203ENSMUST00000171089 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
NipblQ6KCD5 Gm20629-201ENSMUST00000176157 513 ntTSL 3 BASIC8.54□□□□□ -1.04
NipblQ6KCD5 Gm25591-201ENSMUST00000177317 94 ntBASIC8.54□□□□□ -1.04
NipblQ6KCD5 Gm42660-201ENSMUST00000197733 947 ntBASIC8.54□□□□□ -1.04
NipblQ6KCD5 9530034A14Rik-201ENSMUST00000197919 1083 ntTSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
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