Protein–RNA interactions for Protein: Q68FH0

Pkp4, Plakophilin-4, mousemouse

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Length 1,190 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp4Q68FH0 Magt1-204ENSMUST00000151689 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Pkp4Q68FH0 Gm31816-202ENSMUST00000209591 1332 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Pkp4Q68FH0 Asb15-201ENSMUST00000031696 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Pkp4Q68FH0 Sdccag8-201ENSMUST00000027785 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Pkp4Q68FH0 Gm28042-203ENSMUST00000156805 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Pkp4Q68FH0 Art3-202ENSMUST00000117108 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Pkp4Q68FH0 Art3-203ENSMUST00000118106 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Pkp4Q68FH0 Slc14a2-202ENSMUST00000163367 1428 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Pkp4Q68FH0 Eya1-209ENSMUST00000190337 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Pkp4Q68FH0 Flad1-202ENSMUST00000107426 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Pkp4Q68FH0 Faim2-201ENSMUST00000023750 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Pkp4Q68FH0 U2af1l4-237ENSMUST00000167042 3007 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Pkp4Q68FH0 Pdlim2-201ENSMUST00000022681 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Pkp4Q68FH0 Srsf5-201ENSMUST00000094693 1527 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Pkp4Q68FH0 Etfbkmt-209ENSMUST00000179873 1576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Pkp4Q68FH0 Gm44153-201ENSMUST00000204162 1580 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Pkp4Q68FH0 Hdc-201ENSMUST00000028838 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Pkp4Q68FH0 Gm15674-201ENSMUST00000143266 2438 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Pkp4Q68FH0 AC174797.1-201ENSMUST00000224339 1649 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Pkp4Q68FH0 Gm6793-201ENSMUST00000071732 1604 ntAPPRIS P1 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Pkp4Q68FH0 Rxfp2-206ENSMUST00000201612 2470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Pkp4Q68FH0 Mab21l1-201ENSMUST00000075422 2492 ntAPPRIS P1 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Pkp4Q68FH0 Dtx3l-202ENSMUST00000114885 2648 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Pkp4Q68FH0 Pml-207ENSMUST00000135310 4413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Pkp4Q68FH0 Eef1a1-201ENSMUST00000042235 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Pkp4Q68FH0 Sgk2-201ENSMUST00000018012 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Pkp4Q68FH0 Acvrl1-201ENSMUST00000000542 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Pkp4Q68FH0 Gm10848-201ENSMUST00000192361 1811 ntTSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Pkp4Q68FH0 Pou6f1-204ENSMUST00000176271 4575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Pkp4Q68FH0 Mirg-201ENSMUST00000181496 1906 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Pkp4Q68FH0 Eps8l1-204ENSMUST00000163893 3868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Pkp4Q68FH0 Fam109b-203ENSMUST00000161178 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Pkp4Q68FH0 Gm13264-201ENSMUST00000138416 2011 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Pkp4Q68FH0 Fer1l4-201ENSMUST00000109611 6106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Pkp4Q68FH0 Tex13c1-201ENSMUST00000105113 2074 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Pkp4Q68FH0 Mettl14-204ENSMUST00000174323 4202 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Pkp4Q68FH0 Clvs2-204ENSMUST00000161692 4283 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Pkp4Q68FH0 Pik3cd-202ENSMUST00000105688 4335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Pkp4Q68FH0 Zmym3-209ENSMUST00000121520 5564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Pkp4Q68FH0 Ramp1-201ENSMUST00000097648 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Pkp4Q68FH0 Pip5k1b-202ENSMUST00000112673 2387 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Pkp4Q68FH0 Exoc4-203ENSMUST00000115080 2369 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Pkp4Q68FH0 Fip1l1-204ENSMUST00000113536 4769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Pkp4Q68FH0 Trav13-1-201ENSMUST00000103651 331 ntAPPRIS P1 BASIC10.72□□□□□ -0.69
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Pkp4Q68FH0 Gm3409-201ENSMUST00000110597 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Pkp4Q68FH0 Gm8876-201ENSMUST00000120768 1122 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Pkp4Q68FH0 Gm15869-201ENSMUST00000126427 734 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Pkp4Q68FH0 Gm11791-201ENSMUST00000139327 336 ntTSL 3 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Pkp4Q68FH0 Mcpt8-201ENSMUST00000015594 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
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Pkp4Q68FH0 Ppy-201ENSMUST00000017460 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
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Pkp4Q68FH0 H2al1f-201ENSMUST00000179004 318 ntAPPRIS P1 BASIC10.72□□□□□ -0.69
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Pkp4Q68FH0 Gm28516-201ENSMUST00000190257 663 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Pkp4Q68FH0 Gm28694-201ENSMUST00000190681 722 ntTSL 3 BASIC10.72□□□□□ -0.69
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Pkp4Q68FH0 4930479H17Rik-201ENSMUST00000208824 292 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Pkp4Q68FH0 Ngdn-201ENSMUST00000022815 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Pkp4Q68FH0 Olfr311-201ENSMUST00000071625 927 ntAPPRIS P1 BASIC10.72□□□□□ -0.69
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Pkp4Q68FH0 Pcdh12-203ENSMUST00000194012 2702 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Pkp4Q68FH0 Gm9915-201ENSMUST00000066196 1383 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Pkp4Q68FH0 Exoc3l4-201ENSMUST00000072646 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Pkp4Q68FH0 Gtf2i-216ENSMUST00000173888 2820 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Pkp4Q68FH0 Arih1-202ENSMUST00000165322 1431 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Pkp4Q68FH0 4732491K20Rik-201ENSMUST00000181774 3142 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Pkp4Q68FH0 Camk2b-207ENSMUST00000101586 1590 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Pkp4Q68FH0 Rad51c-201ENSMUST00000007790 1632 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Pkp4Q68FH0 Spata5-202ENSMUST00000108112 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Pkp4Q68FH0 Ubxn10-202ENSMUST00000105810 3304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Pkp4Q68FH0 Gm14005-209ENSMUST00000224993 1832 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Pkp4Q68FH0 Slc38a5-202ENSMUST00000115590 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Pkp4Q68FH0 Furin-201ENSMUST00000107362 4166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Pkp4Q68FH0 Gm42641-202ENSMUST00000160217 4248 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Pkp4Q68FH0 Trmt12-201ENSMUST00000036937 4454 ntAPPRIS P1 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Pkp4Q68FH0 Ces4a-201ENSMUST00000161289 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Pkp4Q68FH0 Ehbp1-202ENSMUST00000109563 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Pkp4Q68FH0 Htr1f-201ENSMUST00000063076 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Pkp4Q68FH0 Synj2-203ENSMUST00000115784 2634 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Pkp4Q68FH0 Slc36a1-203ENSMUST00000108872 5264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Pkp4Q68FH0 Zfp941-201ENSMUST00000080651 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Pkp4Q68FH0 Fam83a-202ENSMUST00000160942 2876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Pkp4Q68FH0 Akap3-202ENSMUST00000202574 2879 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Pkp4Q68FH0 Tmem231-201ENSMUST00000034429 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Pkp4Q68FH0 Lnx1-203ENSMUST00000113531 3098 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Pkp4Q68FH0 Ptgfr-201ENSMUST00000029670 6624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Pkp4Q68FH0 Tspan18-202ENSMUST00000111265 3751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
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