Protein–RNA interactions for Protein: Q68FE2

Atg9a, Autophagy-related protein 9A, mousemouse

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Length 551 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg9aQ68FE2 Kcnt1-201ENSMUST00000037580 5881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Atg9aQ68FE2 Clec16a-201ENSMUST00000038145 3730 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Atg9aQ68FE2 Kng2-203ENSMUST00000115349 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Atg9aQ68FE2 Katnal2-208ENSMUST00000137498 1824 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Atg9aQ68FE2 Ush1c-201ENSMUST00000009667 3072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Atg9aQ68FE2 Mmd2-201ENSMUST00000037048 3317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Atg9aQ68FE2 Tmcc1-208ENSMUST00000173140 1910 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Atg9aQ68FE2 Dclk1-215ENSMUST00000200352 1662 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Atg9aQ68FE2 Zfp1-202ENSMUST00000211926 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Atg9aQ68FE2 Ces2f-203ENSMUST00000212926 1430 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Atg9aQ68FE2 Pabpc4-202ENSMUST00000080178 3019 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Atg9aQ68FE2 Cyth4-201ENSMUST00000043069 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Atg9aQ68FE2 Gm26510-201ENSMUST00000180468 1796 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Atg9aQ68FE2 Opn1mw-202ENSMUST00000101457 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Atg9aQ68FE2 Smim11-202ENSMUST00000118064 782 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Atg9aQ68FE2 Gm8876-201ENSMUST00000120768 1122 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Atg9aQ68FE2 Gm28096-201ENSMUST00000191391 824 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Atg9aQ68FE2 4930405N21Rik-201ENSMUST00000199950 1200 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Atg9aQ68FE2 AC168279.1-201ENSMUST00000214611 382 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Atg9aQ68FE2 Myl6-203ENSMUST00000217776 562 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Atg9aQ68FE2 AC134793.1-202ENSMUST00000227444 803 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Atg9aQ68FE2 E330021D16Rik-201ENSMUST00000058713 1116 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Atg9aQ68FE2 Prg4-201ENSMUST00000006171 1869 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Atg9aQ68FE2 Bbs2-201ENSMUST00000034206 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Atg9aQ68FE2 Apol7e-201ENSMUST00000096358 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Atg9aQ68FE2 Rfesd-201ENSMUST00000050997 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Atg9aQ68FE2 Rprd1b-203ENSMUST00000109518 4399 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Atg9aQ68FE2 Bptf-203ENSMUST00000106763 12036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Atg9aQ68FE2 Smap1-202ENSMUST00000129254 1365 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Atg9aQ68FE2 Sox9-201ENSMUST00000000579 4135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Atg9aQ68FE2 Pdzrn4-202ENSMUST00000169942 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Atg9aQ68FE2 Kcnma1-207ENSMUST00000172099 3354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Atg9aQ68FE2 Gm3755-201ENSMUST00000169555 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Atg9aQ68FE2 Gm10728-201ENSMUST00000194292 1829 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Atg9aQ68FE2 Tubb2b-201ENSMUST00000075774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Atg9aQ68FE2 Zfp420-202ENSMUST00000074876 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Atg9aQ68FE2 Zscan10-205ENSMUST00000120967 2609 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Atg9aQ68FE2 4930563D23Rik-201ENSMUST00000062638 2646 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Atg9aQ68FE2 Snap23-203ENSMUST00000116437 2730 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Atg9aQ68FE2 Zfyve26-203ENSMUST00000218377 2726 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Atg9aQ68FE2 Xpnpep1-211ENSMUST00000183274 2120 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Atg9aQ68FE2 Ercc2-202ENSMUST00000108460 3485 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Atg9aQ68FE2 Lrp2bp-201ENSMUST00000066451 1525 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Atg9aQ68FE2 Syde2-203ENSMUST00000200546 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Atg9aQ68FE2 Shc1-201ENSMUST00000039110 3250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Atg9aQ68FE2 Gm13600-201ENSMUST00000117949 744 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Atg9aQ68FE2 Gm12816-201ENSMUST00000118069 1212 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Atg9aQ68FE2 Gm11340-201ENSMUST00000119226 412 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Atg9aQ68FE2 Gm14234-201ENSMUST00000119539 845 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Atg9aQ68FE2 Gm12783-201ENSMUST00000121425 397 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Atg9aQ68FE2 Ighv1-76-201ENSMUST00000169155 294 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Atg9aQ68FE2 Ighv1-62-1-202ENSMUST00000171270 90 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Atg9aQ68FE2 Gm13278-201ENSMUST00000177771 549 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Atg9aQ68FE2 Gm13275-201ENSMUST00000178347 549 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Atg9aQ68FE2 Gm13277-201ENSMUST00000178480 549 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Atg9aQ68FE2 Gm13279-201ENSMUST00000178602 549 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Atg9aQ68FE2 Gm13289-201ENSMUST00000179158 549 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Atg9aQ68FE2 Gm13276-201ENSMUST00000179372 549 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Atg9aQ68FE2 Gm13287-201ENSMUST00000179490 549 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Atg9aQ68FE2 Nmbr-207ENSMUST00000190751 921 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Atg9aQ68FE2 Gm34379-201ENSMUST00000195036 290 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Atg9aQ68FE2 Shisa5-205ENSMUST00000197099 742 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Atg9aQ68FE2 4930447C11Rik-201ENSMUST00000204503 928 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Atg9aQ68FE2 Rpl15-ps5-201ENSMUST00000205636 605 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Atg9aQ68FE2 Gm44753-202ENSMUST00000208297 562 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Atg9aQ68FE2 Gm18706-201ENSMUST00000210053 1066 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Atg9aQ68FE2 Sssca1-201ENSMUST00000025885 693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Atg9aQ68FE2 Nnmt-201ENSMUST00000034808 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Atg9aQ68FE2 Crygd-201ENSMUST00000045028 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Atg9aQ68FE2 Asna1-201ENSMUST00000064314 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Atg9aQ68FE2 Ip6k1-201ENSMUST00000035214 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Atg9aQ68FE2 Mthfd1l-202ENSMUST00000117291 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Atg9aQ68FE2 Rnf13-210ENSMUST00000200497 2573 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Atg9aQ68FE2 Gm13583-202ENSMUST00000151931 1476 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Atg9aQ68FE2 Rgs3-202ENSMUST00000084521 3888 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Atg9aQ68FE2 Hgs-203ENSMUST00000106205 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Atg9aQ68FE2 Pcdhga11-201ENSMUST00000061279 4756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Atg9aQ68FE2 Kcnk10-201ENSMUST00000110113 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Atg9aQ68FE2 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Atg9aQ68FE2 Ncf1-202ENSMUST00000111275 2721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Atg9aQ68FE2 Slc6a1-201ENSMUST00000032454 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Atg9aQ68FE2 Ahsa2-202ENSMUST00000109539 3583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Atg9aQ68FE2 Pygo2-202ENSMUST00000107413 2911 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Atg9aQ68FE2 2410002F23Rik-204ENSMUST00000107948 2908 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.27
Atg9aQ68FE2 Gm31816-202ENSMUST00000209591 1332 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Atg9aQ68FE2 Prune1-201ENSMUST00000015855 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Atg9aQ68FE2 Becn1-205ENSMUST00000130916 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Atg9aQ68FE2 Gm2128-201ENSMUST00000108009 2560 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Atg9aQ68FE2 Far2-201ENSMUST00000032443 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Atg9aQ68FE2 Zfp354c-202ENSMUST00000109135 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Atg9aQ68FE2 Gm11801-201ENSMUST00000117807 746 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Atg9aQ68FE2 Myl3-202ENSMUST00000124267 575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Atg9aQ68FE2 Smim6-201ENSMUST00000132961 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Atg9aQ68FE2 Gm24074-201ENSMUST00000158178 260 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Atg9aQ68FE2 Gm20822-201ENSMUST00000165756 687 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Atg9aQ68FE2 Gm20828-201ENSMUST00000170889 687 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Atg9aQ68FE2 Ighv2-1-201ENSMUST00000170946 353 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Atg9aQ68FE2 Mipep-ps-201ENSMUST00000177439 291 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Atg9aQ68FE2 Olfr1432-201ENSMUST00000180978 930 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Atg9aQ68FE2 Gm38324-201ENSMUST00000194390 411 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
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