Protein–RNA interactions for Protein: Q640L5

Ccdc18, Coiled-coil domain-containing protein 18, mousemouse

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Length 1,455 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc18Q640L5 Gm36862-204ENSMUST00000223365 642 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc18Q640L5 AC164883.7-201ENSMUST00000228534 851 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
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Ccdc18Q640L5 Ttll1-201ENSMUST00000016897 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc18Q640L5 Gm7642-201ENSMUST00000216345 1809 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc18Q640L5 Extl3-203ENSMUST00000225633 6013 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc18Q640L5 4930534D22Rik-201ENSMUST00000181438 2715 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
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Ccdc18Q640L5 Acin1-221ENSMUST00000150371 2494 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc18Q640L5 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc18Q640L5 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc18Q640L5 Reps1-210ENSMUST00000164556 2537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc18Q640L5 Ank3-201ENSMUST00000047061 2517 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc18Q640L5 Ufd1-201ENSMUST00000005394 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc18Q640L5 Phactr1-206ENSMUST00000131942 2056 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc18Q640L5 Epb41-203ENSMUST00000084253 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc18Q640L5 Plce1-204ENSMUST00000182481 8357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc18Q640L5 1700001L05Rik-201ENSMUST00000100370 2270 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc18Q640L5 Zbtb7b-203ENSMUST00000107433 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc18Q640L5 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc18Q640L5 Pmp22-201ENSMUST00000018361 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc18Q640L5 Slc25a25-202ENSMUST00000052119 3529 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
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Ccdc18Q640L5 Gm14817-201ENSMUST00000148522 643 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
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Ccdc18Q640L5 Gm30504-201ENSMUST00000209316 1688 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc18Q640L5 Pla2g7-201ENSMUST00000024706 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc18Q640L5 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
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Ccdc18Q640L5 Syncrip-210ENSMUST00000174391 6257 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc18Q640L5 Srr-201ENSMUST00000065211 3699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc18Q640L5 Ermard-202ENSMUST00000061688 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
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Ccdc18Q640L5 Ptpn2-203ENSMUST00000122412 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
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Ccdc18Q640L5 Heatr3-202ENSMUST00000121949 3086 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
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Ccdc18Q640L5 AC161172.1-201ENSMUST00000227801 486 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc18Q640L5 Rpl37-201ENSMUST00000045356 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc18Q640L5 Slc7a4-207ENSMUST00000172164 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
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Ccdc18Q640L5 AC131081.1-201ENSMUST00000219535 1736 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc18Q640L5 Ppara-201ENSMUST00000057979 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc18Q640L5 2700068H02Rik-201ENSMUST00000137882 1872 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc18Q640L5 Adgb-201ENSMUST00000045328 1893 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc18Q640L5 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc18Q640L5 Spef2-203ENSMUST00000159368 1422 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc18Q640L5 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc18Q640L5 Gm37844-201ENSMUST00000192473 4097 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc18Q640L5 Gfra2-203ENSMUST00000227697 1323 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc18Q640L5 Arl13b-201ENSMUST00000089289 3528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc18Q640L5 6030443J06Rik-201ENSMUST00000181209 2380 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc18Q640L5 Lgals9-203ENSMUST00000108269 1586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc18Q640L5 Cd247-205ENSMUST00000161559 1816 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc18Q640L5 Adgrv1-214ENSMUST00000224088 1492 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc18Q640L5 1110051M20Rik-202ENSMUST00000094835 1498 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc18Q640L5 Cyth4-201ENSMUST00000043069 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc18Q640L5 Armcx2-201ENSMUST00000035559 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc18Q640L5 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc18Q640L5 Ttc27-201ENSMUST00000024882 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
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