Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0C5

Usp48, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 48, mousemouse

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Length 1,052 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp48Q3V0C5 Olfr223-202ENSMUST00000215626 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
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Usp48Q3V0C5 Rgs11-201ENSMUST00000025020 2006 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Usp48Q3V0C5 Gm26615-201ENSMUST00000181522 3201 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Usp48Q3V0C5 Zfp639-201ENSMUST00000029203 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Usp48Q3V0C5 Coro6-204ENSMUST00000102493 2804 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Usp48Q3V0C5 Pacsin1-201ENSMUST00000045896 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Usp48Q3V0C5 Gm16275-201ENSMUST00000147774 712 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
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Usp48Q3V0C5 Gpx1-204ENSMUST00000193987 653 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Usp48Q3V0C5 Gm44216-201ENSMUST00000203942 157 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Usp48Q3V0C5 3110009M11Rik-201ENSMUST00000208647 892 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
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Usp48Q3V0C5 Epb41l2-204ENSMUST00000217929 3621 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Usp48Q3V0C5 Slc22a4-201ENSMUST00000020586 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Usp48Q3V0C5 5430405H02Rik-201ENSMUST00000153616 1431 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Usp48Q3V0C5 Abi1-209ENSMUST00000140164 3403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Usp48Q3V0C5 Cep128-210ENSMUST00000141429 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
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Usp48Q3V0C5 Sult1a1-202ENSMUST00000106372 1369 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
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Usp48Q3V0C5 4933438K21Rik-201ENSMUST00000175787 1693 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Usp48Q3V0C5 Emilin1-201ENSMUST00000031055 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Usp48Q3V0C5 Clic4-201ENSMUST00000037099 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Usp48Q3V0C5 Coro6-202ENSMUST00000052515 1476 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
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Usp48Q3V0C5 Abcb8-201ENSMUST00000073076 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Usp48Q3V0C5 Ubap1-201ENSMUST00000072866 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
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Usp48Q3V0C5 Cyp4b1-201ENSMUST00000102707 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
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Usp48Q3V0C5 Fam60a-201ENSMUST00000054080 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Usp48Q3V0C5 Wdr82-201ENSMUST00000020490 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Usp48Q3V0C5 Arfgap1-202ENSMUST00000108859 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Usp48Q3V0C5 Rangap1-202ENSMUST00000170134 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Usp48Q3V0C5 Gm23255-201ENSMUST00000102244 110 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
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Usp48Q3V0C5 Kdm6bos-201ENSMUST00000129924 840 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Usp48Q3V0C5 Gm14275-201ENSMUST00000152112 430 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
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Usp48Q3V0C5 Gm9162-201ENSMUST00000182081 991 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Usp48Q3V0C5 Gm9866-204ENSMUST00000183238 351 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Usp48Q3V0C5 Gm37592-201ENSMUST00000192741 373 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Usp48Q3V0C5 Gm37365-201ENSMUST00000193109 409 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Usp48Q3V0C5 Bcl2l12-205ENSMUST00000207755 605 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Usp48Q3V0C5 Gm45481-201ENSMUST00000209717 877 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
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