Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPR8

D13Ertd608e, D13Ertd608e protein, mousemouse

Predictions only

Length 151 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D13Ertd608eQ3UPR8 Arhgap36-202ENSMUST00000114904 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
D13Ertd608eQ3UPR8 Egr2-201ENSMUST00000048289 2965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
D13Ertd608eQ3UPR8 Sparcl1-201ENSMUST00000031249 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
D13Ertd608eQ3UPR8 Eif2s2-201ENSMUST00000099173 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
D13Ertd608eQ3UPR8 Olfr1413-202ENSMUST00000214239 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
D13Ertd608eQ3UPR8 Otog-201ENSMUST00000164538 10043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
D13Ertd608eQ3UPR8 2010111I01Rik-201ENSMUST00000021911 2979 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
D13Ertd608eQ3UPR8 Mkl1-204ENSMUST00000134469 4392 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
D13Ertd608eQ3UPR8 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
D13Ertd608eQ3UPR8 Hmgb2-201ENSMUST00000067925 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
D13Ertd608eQ3UPR8 Slc9a3-204ENSMUST00000225423 2589 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
D13Ertd608eQ3UPR8 Ighv1-58-201ENSMUST00000103529 351 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm11509-201ENSMUST00000117358 325 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm11930-201ENSMUST00000117788 190 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm14109-201ENSMUST00000118814 309 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm13829-201ENSMUST00000119600 138 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
D13Ertd608eQ3UPR8 4930483J18Rik-202ENSMUST00000138715 1093 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
D13Ertd608eQ3UPR8 Fez1-208ENSMUST00000163816 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
D13Ertd608eQ3UPR8 Ly6g5b-202ENSMUST00000172854 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm2991-201ENSMUST00000173338 480 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
D13Ertd608eQ3UPR8 2610016A17Rik-202ENSMUST00000186768 689 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm6621-201ENSMUST00000193251 772 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm42629-201ENSMUST00000199063 1102 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm43050-201ENSMUST00000201062 338 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm45113-201ENSMUST00000207518 165 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm18935-201ENSMUST00000212692 664 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
D13Ertd608eQ3UPR8 Fxyd2-211ENSMUST00000216289 668 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
D13Ertd608eQ3UPR8 Net1-207ENSMUST00000223258 597 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
D13Ertd608eQ3UPR8 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
D13Ertd608eQ3UPR8 CT025533.2-201ENSMUST00000228715 1248 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
D13Ertd608eQ3UPR8 Tmem54-202ENSMUST00000030577 988 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
D13Ertd608eQ3UPR8 Psmb2-201ENSMUST00000030642 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
D13Ertd608eQ3UPR8 Pxt1-201ENSMUST00000051526 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
D13Ertd608eQ3UPR8 Isoc2b-201ENSMUST00000064547 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
D13Ertd608eQ3UPR8 Cnga4-201ENSMUST00000033187 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
D13Ertd608eQ3UPR8 Agpat3-204ENSMUST00000105389 3678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
D13Ertd608eQ3UPR8 Tenm2-201ENSMUST00000057207 8298 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
D13Ertd608eQ3UPR8 Dcaf12l1-201ENSMUST00000060481 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
D13Ertd608eQ3UPR8 Gmps-201ENSMUST00000029405 8105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
D13Ertd608eQ3UPR8 Apol7a-203ENSMUST00000175919 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
D13Ertd608eQ3UPR8 Spata13-201ENSMUST00000022566 7517 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
D13Ertd608eQ3UPR8 Tro-201ENSMUST00000087253 3224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
D13Ertd608eQ3UPR8 Ctcfl-201ENSMUST00000094287 3217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
D13Ertd608eQ3UPR8 Clock-201ENSMUST00000075159 7478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
D13Ertd608eQ3UPR8 Sox13-203ENSMUST00000144386 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
D13Ertd608eQ3UPR8 Wipf1-203ENSMUST00000102680 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm32856-201ENSMUST00000212145 3767 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
D13Ertd608eQ3UPR8 Btbd7-206ENSMUST00000223554 8157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
D13Ertd608eQ3UPR8 Bora-201ENSMUST00000022656 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
D13Ertd608eQ3UPR8 AC124732.3-201ENSMUST00000221835 1765 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
D13Ertd608eQ3UPR8 Nckap5-212ENSMUST00000162877 2630 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
D13Ertd608eQ3UPR8 D030055H07Rik-202ENSMUST00000150953 4325 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm45495-201ENSMUST00000200940 1700 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
D13Ertd608eQ3UPR8 Pard3-201ENSMUST00000026921 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm43064-201ENSMUST00000199710 3144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
D13Ertd608eQ3UPR8 Top1-201ENSMUST00000109468 3856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm10417-201ENSMUST00000194341 3522 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
D13Ertd608eQ3UPR8 Pcdh20-202ENSMUST00000192557 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
D13Ertd608eQ3UPR8 Gne-201ENSMUST00000030201 5384 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
D13Ertd608eQ3UPR8 Dcaf11-206ENSMUST00000128490 2660 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
D13Ertd608eQ3UPR8 Ccdc148-204ENSMUST00000226455 4612 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm46430-201ENSMUST00000220478 1989 ntTSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
D13Ertd608eQ3UPR8 Capn15-204ENSMUST00000212149 4555 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
D13Ertd608eQ3UPR8 Pik3cb-201ENSMUST00000035037 6478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
D13Ertd608eQ3UPR8 Sdk1-201ENSMUST00000074546 7063 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
D13Ertd608eQ3UPR8 Camta2-201ENSMUST00000036299 4495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
D13Ertd608eQ3UPR8 Trav4d-3-201ENSMUST00000103592 331 ntAPPRIS P1 BASIC10.18□□□□□ -0.78
D13Ertd608eQ3UPR8 Trav4d-4-201ENSMUST00000103600 354 ntAPPRIS P1 BASIC10.18□□□□□ -0.78
D13Ertd608eQ3UPR8 Trav4n-3-201ENSMUST00000103618 331 ntAPPRIS P1 BASIC10.18□□□□□ -0.78
D13Ertd608eQ3UPR8 Trav4n-4-201ENSMUST00000103627 354 ntAPPRIS P1 BASIC10.18□□□□□ -0.78
D13Ertd608eQ3UPR8 Trav4-3-201ENSMUST00000103655 411 ntAPPRIS P1 BASIC10.18□□□□□ -0.78
D13Ertd608eQ3UPR8 Trav4-4-dv10-201ENSMUST00000103663 361 ntAPPRIS P1 BASIC10.18□□□□□ -0.78
D13Ertd608eQ3UPR8 Ufc1-202ENSMUST00000111302 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
D13Ertd608eQ3UPR8 1700080O16Rik-202ENSMUST00000114866 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
D13Ertd608eQ3UPR8 Ppil2-202ENSMUST00000115719 838 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm7150-201ENSMUST00000122032 981 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
D13Ertd608eQ3UPR8 4930471C06Rik-202ENSMUST00000143070 579 ntTSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
D13Ertd608eQ3UPR8 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
D13Ertd608eQ3UPR8 Snora78-201ENSMUST00000158630 128 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm28379-201ENSMUST00000186450 554 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm29054-201ENSMUST00000187589 1185 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
D13Ertd608eQ3UPR8 Ube2a-202ENSMUST00000200835 911 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
D13Ertd608eQ3UPR8 Ube2a-209ENSMUST00000202991 715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm18054-201ENSMUST00000207539 555 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm26953-204ENSMUST00000212526 553 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
D13Ertd608eQ3UPR8 Calml4-207ENSMUST00000215968 526 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
D13Ertd608eQ3UPR8 AC113082.1-201ENSMUST00000217324 327 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm6653-201ENSMUST00000218063 1288 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm6722-201ENSMUST00000221586 390 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
D13Ertd608eQ3UPR8 Sit1-201ENSMUST00000030180 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
D13Ertd608eQ3UPR8 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
D13Ertd608eQ3UPR8 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
D13Ertd608eQ3UPR8 Klk1b27-201ENSMUST00000079859 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm43482-201ENSMUST00000202797 1861 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
D13Ertd608eQ3UPR8 Nrf1-208ENSMUST00000115208 2492 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
D13Ertd608eQ3UPR8 Abhd4-201ENSMUST00000041197 2401 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
D13Ertd608eQ3UPR8 Unc45a-202ENSMUST00000107368 3635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
D13Ertd608eQ3UPR8 Osbpl7-206ENSMUST00000168565 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
D13Ertd608eQ3UPR8 Pnpla3-201ENSMUST00000045289 4640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
D13Ertd608eQ3UPR8 Rsph10b-203ENSMUST00000166847 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.3 ms