Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJD6

Usp19, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 19, mousemouse

Predictions only

Length 1,360 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp19Q3UJD6 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Usp19Q3UJD6 Rpl23-201ENSMUST00000103146 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Usp19Q3UJD6 Foxj3-202ENSMUST00000106310 4660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Usp19Q3UJD6 Gm6322-201ENSMUST00000118789 1004 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Usp19Q3UJD6 AC034099.1-202ENSMUST00000133843 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Usp19Q3UJD6 Gm15952-202ENSMUST00000144542 556 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Usp19Q3UJD6 Gm12406-201ENSMUST00000155382 697 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Usp19Q3UJD6 Gm16081-201ENSMUST00000155992 684 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Usp19Q3UJD6 Gm24074-201ENSMUST00000158178 260 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Usp19Q3UJD6 Snord55-201ENSMUST00000174939 79 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Usp19Q3UJD6 Gm44696-201ENSMUST00000181943 1229 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Usp19Q3UJD6 Gm26918-201ENSMUST00000182496 728 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Usp19Q3UJD6 Ighv1-2-201ENSMUST00000195325 378 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Usp19Q3UJD6 Gm43001-201ENSMUST00000198925 603 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Usp19Q3UJD6 Olfr335-ps-201ENSMUST00000223545 939 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Usp19Q3UJD6 AC154461.3-201ENSMUST00000224831 573 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Usp19Q3UJD6 AC129308.3-201ENSMUST00000225652 524 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Usp19Q3UJD6 CT025618.1-203ENSMUST00000227008 589 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Usp19Q3UJD6 Sept4-202ENSMUST00000063156 1245 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Usp19Q3UJD6 n-R5s185-201ENSMUST00000083953 119 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Usp19Q3UJD6 Tmem151a-201ENSMUST00000077066 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Usp19Q3UJD6 Tsc22d3-201ENSMUST00000055738 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Usp19Q3UJD6 Top3a-204ENSMUST00000120417 2318 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Usp19Q3UJD6 Gm38292-201ENSMUST00000192646 3045 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Usp19Q3UJD6 Gm6268-201ENSMUST00000115253 1453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Usp19Q3UJD6 AC090962.2-201ENSMUST00000225064 1801 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Usp19Q3UJD6 Scamp5-201ENSMUST00000046587 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Usp19Q3UJD6 Vps4b-201ENSMUST00000094646 4633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Usp19Q3UJD6 Pax5-205ENSMUST00000107827 1315 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Usp19Q3UJD6 Mnt-201ENSMUST00000000291 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Usp19Q3UJD6 Padi2-201ENSMUST00000030765 4774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Usp19Q3UJD6 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Usp19Q3UJD6 Abca3-201ENSMUST00000039013 6476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Usp19Q3UJD6 Slc37a4-202ENSMUST00000213268 1353 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Usp19Q3UJD6 Myh3-201ENSMUST00000007301 5992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Usp19Q3UJD6 AI661453-202ENSMUST00000150819 4866 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Usp19Q3UJD6 Usp3-205ENSMUST00000127569 5607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Usp19Q3UJD6 4933409D19Rik-201ENSMUST00000193674 1557 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Usp19Q3UJD6 Prrc2b-201ENSMUST00000036691 8612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Usp19Q3UJD6 Prok1-202ENSMUST00000197758 3063 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Usp19Q3UJD6 Gm5766-201ENSMUST00000160520 1977 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Usp19Q3UJD6 2410002F23Rik-204ENSMUST00000107948 2908 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Usp19Q3UJD6 Lcorl-205ENSMUST00000121573 2378 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Usp19Q3UJD6 Fam3a-201ENSMUST00000015427 1427 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Usp19Q3UJD6 Katnal2-208ENSMUST00000137498 1824 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Usp19Q3UJD6 Cct3-204ENSMUST00000164166 1804 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Usp19Q3UJD6 Trav11-201ENSMUST00000103585 343 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Usp19Q3UJD6 Trav11d-201ENSMUST00000103648 342 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Usp19Q3UJD6 Gm12986-201ENSMUST00000119037 967 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Usp19Q3UJD6 Dydc1-202ENSMUST00000161837 829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Usp19Q3UJD6 Gm20441-201ENSMUST00000173512 756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Usp19Q3UJD6 Gm19587-201ENSMUST00000191395 545 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Usp19Q3UJD6 Trav11n-201ENSMUST00000200113 343 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Usp19Q3UJD6 Gm5340-201ENSMUST00000203733 880 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Usp19Q3UJD6 Catsperz-201ENSMUST00000057716 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Usp19Q3UJD6 Rab10os-203ENSMUST00000178074 4006 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Usp19Q3UJD6 Tbc1d16-201ENSMUST00000036113 6986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Usp19Q3UJD6 Ccnb1-201ENSMUST00000072119 2489 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Usp19Q3UJD6 Gm45041-201ENSMUST00000207366 3108 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Usp19Q3UJD6 Htr1f-201ENSMUST00000063076 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Usp19Q3UJD6 Gm18798-201ENSMUST00000187264 1700 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Usp19Q3UJD6 Uba1y-ps1-201ENSMUST00000188314 1708 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Usp19Q3UJD6 Nr2c2-201ENSMUST00000113460 7647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Usp19Q3UJD6 Rac1-201ENSMUST00000080537 4159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Usp19Q3UJD6 Nek4-201ENSMUST00000050171 2793 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Usp19Q3UJD6 Ikzf2-204ENSMUST00000188110 1365 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Usp19Q3UJD6 Ikzf2-208ENSMUST00000190855 1359 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Usp19Q3UJD6 Atg9b-201ENSMUST00000059401 3902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Usp19Q3UJD6 Clec16a-201ENSMUST00000038145 3730 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Usp19Q3UJD6 A230009B12Rik-202ENSMUST00000159602 1810 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Usp19Q3UJD6 E330011O21Rik-202ENSMUST00000209498 1403 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Usp19Q3UJD6 Acvrl1-201ENSMUST00000000542 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Usp19Q3UJD6 Fyn-207ENSMUST00000146287 2135 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Usp19Q3UJD6 A330033J07Rik-201ENSMUST00000180921 2816 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Usp19Q3UJD6 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Usp19Q3UJD6 Synpo2l-202ENSMUST00000117386 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Usp19Q3UJD6 Atxn7l1-204ENSMUST00000125192 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Usp19Q3UJD6 4833420G17Rik-204ENSMUST00000225186 2627 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Usp19Q3UJD6 Hemk1-201ENSMUST00000035196 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Usp19Q3UJD6 Slc10a1-202ENSMUST00000218162 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Usp19Q3UJD6 Kifap3-202ENSMUST00000077642 4012 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Usp19Q3UJD6 Ltc4s-201ENSMUST00000101265 480 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Usp19Q3UJD6 Gm24791-201ENSMUST00000104284 131 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Usp19Q3UJD6 Fam3a-204ENSMUST00000114141 1243 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Usp19Q3UJD6 Gm12136-201ENSMUST00000120460 1209 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Usp19Q3UJD6 Dusp3-207ENSMUST00000176261 496 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Usp19Q3UJD6 1700109G14Rik-202ENSMUST00000188538 754 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Usp19Q3UJD6 Mpv17-206ENSMUST00000201353 846 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Usp19Q3UJD6 Gm18460-201ENSMUST00000208088 464 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Usp19Q3UJD6 Gm13539-202ENSMUST00000211245 552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Usp19Q3UJD6 Gm7525-201ENSMUST00000219425 454 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Usp19Q3UJD6 Akap10-202ENSMUST00000102650 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Usp19Q3UJD6 Rps6kb1-207ENSMUST00000154617 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Usp19Q3UJD6 Grik4-201ENSMUST00000034515 3413 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Usp19Q3UJD6 Lmo3-206ENSMUST00000163024 1331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Usp19Q3UJD6 4932431P20Rik-201ENSMUST00000098602 1340 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Usp19Q3UJD6 Nxpe5-204ENSMUST00000161047 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Usp19Q3UJD6 Gm5122-202ENSMUST00000216854 1637 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Usp19Q3UJD6 Setd1a-202ENSMUST00000047157 5927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Usp19Q3UJD6 9530082P21Rik-203ENSMUST00000181605 3162 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.3 ms