Protein–RNA interactions for Protein: Q3LRV9

Treml4, Trem-like transcript 4 protein, mousemouse

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Length 263 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Treml4Q3LRV9 F11-201ENSMUST00000034064 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Treml4Q3LRV9 Gal3st4-201ENSMUST00000100530 3162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Treml4Q3LRV9 Ambra1-204ENSMUST00000111316 5063 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Treml4Q3LRV9 Gpc6-202ENSMUST00000088483 3488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Treml4Q3LRV9 Oxsm-202ENSMUST00000112624 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Treml4Q3LRV9 Pcdhgb2-202ENSMUST00000195112 4661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Treml4Q3LRV9 Carmil1-201ENSMUST00000072889 4988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Treml4Q3LRV9 Gm14243-201ENSMUST00000131401 2172 ntTSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Treml4Q3LRV9 Fbf1-201ENSMUST00000103031 5252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Treml4Q3LRV9 Rxfp3-201ENSMUST00000058007 4275 ntAPPRIS P1 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Treml4Q3LRV9 AC130823.1-201ENSMUST00000228929 1549 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Treml4Q3LRV9 Tnfrsf9-205ENSMUST00000116257 2115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Treml4Q3LRV9 Gm40617-201ENSMUST00000218840 2420 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Treml4Q3LRV9 Nudt8-201ENSMUST00000155405 3904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Treml4Q3LRV9 Myo18a-220ENSMUST00000164334 5381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Treml4Q3LRV9 Etaa1-201ENSMUST00000076661 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Treml4Q3LRV9 Slc39a6-201ENSMUST00000070726 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Treml4Q3LRV9 Myo18a-211ENSMUST00000130627 6202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Treml4Q3LRV9 Tnfrsf9-201ENSMUST00000030808 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Treml4Q3LRV9 4930488L21Rik-201ENSMUST00000181864 3244 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Treml4Q3LRV9 Taf6-202ENSMUST00000110936 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Treml4Q3LRV9 Spats2l-211ENSMUST00000169772 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Treml4Q3LRV9 Ncmap-201ENSMUST00000064481 1448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Treml4Q3LRV9 Esr2-202ENSMUST00000101291 3362 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Treml4Q3LRV9 Meltf-201ENSMUST00000023464 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Treml4Q3LRV9 Lta-201ENSMUST00000025266 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Treml4Q3LRV9 Ctsd-201ENSMUST00000066401 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Treml4Q3LRV9 Armc5-201ENSMUST00000044660 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Treml4Q3LRV9 Cc2d1a-202ENSMUST00000117424 3262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Treml4Q3LRV9 Cish-204ENSMUST00000168260 2742 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Treml4Q3LRV9 Borcs7-201ENSMUST00000074912 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Treml4Q3LRV9 Trappc11-201ENSMUST00000039061 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Treml4Q3LRV9 Nwd2-201ENSMUST00000159584 8534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Treml4Q3LRV9 Gm44415-201ENSMUST00000204151 2112 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Treml4Q3LRV9 Zscan10-205ENSMUST00000120967 2609 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Treml4Q3LRV9 Hps1-209ENSMUST00000162061 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Treml4Q3LRV9 Syt15-202ENSMUST00000119693 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Treml4Q3LRV9 Tmem266-202ENSMUST00000085754 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Treml4Q3LRV9 Srp54a-207ENSMUST00000110708 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Treml4Q3LRV9 Plekhg4-203ENSMUST00000160191 3339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Treml4Q3LRV9 Spg20-202ENSMUST00000107971 3567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Treml4Q3LRV9 Crygc-202ENSMUST00000114064 612 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Treml4Q3LRV9 Xlr4c-204ENSMUST00000114531 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Treml4Q3LRV9 Gm15003-201ENSMUST00000118884 446 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Treml4Q3LRV9 Gm11354-201ENSMUST00000121974 422 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Treml4Q3LRV9 Gm25554-201ENSMUST00000158075 113 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Treml4Q3LRV9 Kdm4dl-201ENSMUST00000184843 1187 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Treml4Q3LRV9 Gm42779-201ENSMUST00000198807 406 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Treml4Q3LRV9 Gm43380-201ENSMUST00000200421 220 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Treml4Q3LRV9 Gm43671-201ENSMUST00000200422 433 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Treml4Q3LRV9 Gm7082-201ENSMUST00000209880 969 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Treml4Q3LRV9 Mt1-202ENSMUST00000211807 1085 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Treml4Q3LRV9 AC122463.1-201ENSMUST00000214559 597 ntTSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Treml4Q3LRV9 Gm30671-201ENSMUST00000214898 318 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Treml4Q3LRV9 Hils1-201ENSMUST00000038928 864 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Treml4Q3LRV9 n-R5s185-201ENSMUST00000083953 119 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Treml4Q3LRV9 Gm6509-201ENSMUST00000098286 1218 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Treml4Q3LRV9 Bcl11a-204ENSMUST00000118955 1505 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Treml4Q3LRV9 Lrrc18-204ENSMUST00000120951 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Treml4Q3LRV9 Zfp335-201ENSMUST00000041361 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Treml4Q3LRV9 Slitrk5-201ENSMUST00000042767 4831 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Treml4Q3LRV9 Gm37348-201ENSMUST00000193104 1789 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Treml4Q3LRV9 Olfr463-202ENSMUST00000215150 2031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Treml4Q3LRV9 Mtus2-203ENSMUST00000085558 7543 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Treml4Q3LRV9 Arhgap24-206ENSMUST00000112854 2991 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Treml4Q3LRV9 Nap1l2-201ENSMUST00000121720 2465 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Treml4Q3LRV9 Mid1-214ENSMUST00000163810 3689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Treml4Q3LRV9 Eif2s1-201ENSMUST00000071230 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Treml4Q3LRV9 Bahcc1-202ENSMUST00000118987 10712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Treml4Q3LRV9 Gm15774-201ENSMUST00000141810 2176 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Treml4Q3LRV9 C1qtnf9-201ENSMUST00000025940 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Treml4Q3LRV9 Ces3b-201ENSMUST00000074403 1907 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Treml4Q3LRV9 BC027072-201ENSMUST00000057405 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Treml4Q3LRV9 Tmem25-202ENSMUST00000114705 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Treml4Q3LRV9 Ttc29-202ENSMUST00000109902 1416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Treml4Q3LRV9 Metap2-208ENSMUST00000181091 1876 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Treml4Q3LRV9 Cfap100-207ENSMUST00000165673 2072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Treml4Q3LRV9 Armcx2-202ENSMUST00000113193 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Treml4Q3LRV9 Gm26631-201ENSMUST00000181462 2505 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Treml4Q3LRV9 Sox13-203ENSMUST00000144386 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Treml4Q3LRV9 Spata2-201ENSMUST00000057627 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Treml4Q3LRV9 Ppp1r18-201ENSMUST00000113814 3131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Treml4Q3LRV9 Il27ra-201ENSMUST00000005601 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Treml4Q3LRV9 Bpi-202ENSMUST00000109499 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Treml4Q3LRV9 Gm8320-201ENSMUST00000177584 1762 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Treml4Q3LRV9 Gm8303-201ENSMUST00000178371 1762 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Treml4Q3LRV9 Gm8331-201ENSMUST00000178433 1762 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Treml4Q3LRV9 Atg2b-201ENSMUST00000041055 7546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Treml4Q3LRV9 Psmd12-202ENSMUST00000106750 1311 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Treml4Q3LRV9 Foxh1-201ENSMUST00000037824 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Treml4Q3LRV9 Uba6-202ENSMUST00000113373 3504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Treml4Q3LRV9 Tbrg1-201ENSMUST00000117654 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Treml4Q3LRV9 Ror2-202ENSMUST00000130235 3730 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Treml4Q3LRV9 Chrdl1-204ENSMUST00000166406 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Treml4Q3LRV9 Gtf2i-216ENSMUST00000173888 2820 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Treml4Q3LRV9 Araf-201ENSMUST00000001155 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Treml4Q3LRV9 Camkk1-201ENSMUST00000092937 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Treml4Q3LRV9 Fyttd1-211ENSMUST00000171325 4295 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Treml4Q3LRV9 Gm4294-201ENSMUST00000105169 614 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Treml4Q3LRV9 Art5-202ENSMUST00000106934 843 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
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