Protein–RNA interactions for Protein: Q0HA38

Ttc21b, Tetratricopeptide repeat protein 21B, mousemouse

Predictions only

Length 1,315 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc21bQ0HA38 Tstd2-201ENSMUST00000107770 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ttc21bQ0HA38 Phactr3-205ENSMUST00000108917 4858 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ttc21bQ0HA38 Gabre-201ENSMUST00000064780 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ttc21bQ0HA38 Ap5s1-203ENSMUST00000110208 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ttc21bQ0HA38 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ttc21bQ0HA38 Ces2h-201ENSMUST00000172032 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ttc21bQ0HA38 AC166361.2-201ENSMUST00000219269 1415 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Ttc21bQ0HA38 3110062M04Rik-201ENSMUST00000055097 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ttc21bQ0HA38 9130019O22Rik-202ENSMUST00000164345 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ttc21bQ0HA38 Dis3l-208ENSMUST00000168844 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ttc21bQ0HA38 Kcne3-202ENSMUST00000170954 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ttc21bQ0HA38 Gm12224-201ENSMUST00000124047 567 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ttc21bQ0HA38 Hoxd3os1-203ENSMUST00000145799 511 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ttc21bQ0HA38 Gm24294-201ENSMUST00000158295 277 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Ttc21bQ0HA38 Gm8756-201ENSMUST00000183250 929 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Ttc21bQ0HA38 Gm28032-201ENSMUST00000184104 96 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Ttc21bQ0HA38 1500015A07Rik-202ENSMUST00000184530 423 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ttc21bQ0HA38 Myo1h-207ENSMUST00000196676 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ttc21bQ0HA38 Gm9619-201ENSMUST00000211587 762 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Ttc21bQ0HA38 AC155300.1-201ENSMUST00000219134 480 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Ttc21bQ0HA38 AC159282.1-204ENSMUST00000219472 780 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ttc21bQ0HA38 CT030035.1-201ENSMUST00000223964 935 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Ttc21bQ0HA38 AC101205.2-201ENSMUST00000226206 715 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Ttc21bQ0HA38 Gimap7-201ENSMUST00000052503 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ttc21bQ0HA38 Ttc24-202ENSMUST00000064550 671 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ttc21bQ0HA38 Nutf2-ps1-201ENSMUST00000095978 864 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ttc21bQ0HA38 Mrgpra1-201ENSMUST00000098438 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ttc21bQ0HA38 3000002C10Rik-201ENSMUST00000125451 1614 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ttc21bQ0HA38 Igtp-201ENSMUST00000035266 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ttc21bQ0HA38 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ttc21bQ0HA38 4930555A03Rik-201ENSMUST00000196052 1556 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ttc21bQ0HA38 Slc10a3-203ENSMUST00000114146 1902 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ttc21bQ0HA38 Frg2f1-201ENSMUST00000079611 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ttc21bQ0HA38 Arhgef2-203ENSMUST00000170653 4238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ttc21bQ0HA38 Rsl24d1-201ENSMUST00000034738 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ttc21bQ0HA38 Phka1-203ENSMUST00000113611 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ttc21bQ0HA38 Phka1-205ENSMUST00000120270 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ttc21bQ0HA38 Pip4k2c-201ENSMUST00000013970 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ttc21bQ0HA38 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ttc21bQ0HA38 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ttc21bQ0HA38 Larp4-202ENSMUST00000100206 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ttc21bQ0HA38 Eif2c5-201ENSMUST00000125609 1416 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ttc21bQ0HA38 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ttc21bQ0HA38 AC156631.1-201ENSMUST00000215213 1358 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ttc21bQ0HA38 Nop14-201ENSMUST00000041364 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ttc21bQ0HA38 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ttc21bQ0HA38 Gm5472-201ENSMUST00000178604 1678 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Ttc21bQ0HA38 Kif1a-202ENSMUST00000112958 5931 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ttc21bQ0HA38 Prrc2b-201ENSMUST00000036691 8612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ttc21bQ0HA38 Gm14034-201ENSMUST00000120147 551 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Ttc21bQ0HA38 Myl1-203ENSMUST00000120415 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ttc21bQ0HA38 Gm13688-201ENSMUST00000121557 608 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Ttc21bQ0HA38 Gm4943-201ENSMUST00000132879 424 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Ttc21bQ0HA38 Gm13031-201ENSMUST00000140501 924 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ttc21bQ0HA38 Gm15258-201ENSMUST00000153801 741 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Ttc21bQ0HA38 Gm37988-201ENSMUST00000155020 825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ttc21bQ0HA38 Gm6644-201ENSMUST00000186507 951 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Ttc21bQ0HA38 1700019D03Rik-207ENSMUST00000191441 638 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ttc21bQ0HA38 Gm38349-201ENSMUST00000195732 462 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Ttc21bQ0HA38 AC116797.2-202ENSMUST00000223587 1017 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Ttc21bQ0HA38 AC154806.7-201ENSMUST00000227998 202 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Ttc21bQ0HA38 Klk1b24-201ENSMUST00000073713 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ttc21bQ0HA38 Klk1b21-201ENSMUST00000085455 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ttc21bQ0HA38 Gm10238-201ENSMUST00000089689 408 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Ttc21bQ0HA38 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ttc21bQ0HA38 Hmox1-201ENSMUST00000005548 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ttc21bQ0HA38 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ttc21bQ0HA38 Rcor3-201ENSMUST00000073279 3748 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ttc21bQ0HA38 Apbb2-215ENSMUST00000162349 3362 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ttc21bQ0HA38 Apbb2-201ENSMUST00000087256 3362 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ttc21bQ0HA38 Pole-202ENSMUST00000112481 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ttc21bQ0HA38 Serpine1-201ENSMUST00000041388 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ttc21bQ0HA38 Nfx1-202ENSMUST00000091614 3617 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ttc21bQ0HA38 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ttc21bQ0HA38 Cep70-207ENSMUST00000190715 1768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ttc21bQ0HA38 Nr5a2-205ENSMUST00000192929 1756 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ttc21bQ0HA38 Nin-204ENSMUST00000169074 6636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ttc21bQ0HA38 9330199G10Rik-202ENSMUST00000221607 1728 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ttc21bQ0HA38 Lgi4-201ENSMUST00000039775 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ttc21bQ0HA38 Plut-202ENSMUST00000174285 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ttc21bQ0HA38 Gm45897-201ENSMUST00000212679 1998 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ttc21bQ0HA38 Prim2-201ENSMUST00000027312 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ttc21bQ0HA38 Heg1-201ENSMUST00000126532 6714 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ttc21bQ0HA38 Oprm1-211ENSMUST00000105602 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ttc21bQ0HA38 St14-201ENSMUST00000034478 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ttc21bQ0HA38 Phf24-201ENSMUST00000069184 6392 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ttc21bQ0HA38 Gfra2-203ENSMUST00000227697 1323 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Ttc21bQ0HA38 Gm9008-201ENSMUST00000097218 2353 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ttc21bQ0HA38 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ttc21bQ0HA38 Gm16907-201ENSMUST00000180734 2317 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ttc21bQ0HA38 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ttc21bQ0HA38 Upp1-202ENSMUST00000101525 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ttc21bQ0HA38 Lyrm1-202ENSMUST00000106516 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ttc21bQ0HA38 Focad-202ENSMUST00000107147 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ttc21bQ0HA38 Gm5510-201ENSMUST00000117826 486 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Ttc21bQ0HA38 Gm12463-201ENSMUST00000118271 849 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Ttc21bQ0HA38 Gm15746-201ENSMUST00000120684 1027 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Ttc21bQ0HA38 Gm15031-201ENSMUST00000121341 210 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Ttc21bQ0HA38 Rplp0-ps1-201ENSMUST00000122125 933 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Ttc21bQ0HA38 St8sia3os-204ENSMUST00000140903 383 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 93.7 ms