Protein–RNA interactions for Protein: Q07409

Cntn3, Contactin-3, mousemouse

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Length 1,028 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntn3Q07409 Olfr1267-ps1-201ENSMUST00000118957 930 ntAPPRIS P1 BASIC11.8□□□□□ -0.52
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Cntn3Q07409 Gm17709-201ENSMUST00000174536 1096 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Cntn3Q07409 Gm19015-201ENSMUST00000184002 1189 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Cntn3Q07409 Gm29410-201ENSMUST00000188383 694 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Cntn3Q07409 Gm37592-201ENSMUST00000192741 373 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Cntn3Q07409 Gm42816-201ENSMUST00000198433 325 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Cntn3Q07409 Gm43966-201ENSMUST00000203301 612 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Cntn3Q07409 Gm3017-201ENSMUST00000203603 1126 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
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Cntn3Q07409 Fam228a-203ENSMUST00000220978 861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
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Cntn3Q07409 Gm2174-201ENSMUST00000079663 402 ntAPPRIS P1 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Cntn3Q07409 Olfr1047-201ENSMUST00000099901 960 ntAPPRIS P1 BASIC11.8□□□□□ -0.52
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Cntn3Q07409 Gm33831-201ENSMUST00000211696 1542 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Cntn3Q07409 Slc26a11-201ENSMUST00000050880 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Cntn3Q07409 Sirt2-208ENSMUST00000155327 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
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Cntn3Q07409 Fam149a-201ENSMUST00000093526 5469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
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Cntn3Q07409 4931428F04Rik-202ENSMUST00000171788 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
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Cntn3Q07409 AU019823-205ENSMUST00000171462 3339 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Cntn3Q07409 Gm39168-201ENSMUST00000210181 1423 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
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Cntn3Q07409 Cdc7-204ENSMUST00000118261 3129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Cntn3Q07409 Serpinf2-201ENSMUST00000043696 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Cntn3Q07409 Ablim1-213ENSMUST00000111559 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Cntn3Q07409 Gm807-201ENSMUST00000181742 1723 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Cntn3Q07409 Cdc14a-201ENSMUST00000090464 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Cntn3Q07409 Kndc1-201ENSMUST00000053445 7299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Cntn3Q07409 Rnf17-201ENSMUST00000095793 5264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Cntn3Q07409 Zfp41-204ENSMUST00000161785 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Cntn3Q07409 Hist1h2be-201ENSMUST00000051091 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Cntn3Q07409 Lin52-201ENSMUST00000137170 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Cntn3Q07409 Ostm1-202ENSMUST00000105497 770 ntTSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Cntn3Q07409 Ralyl-202ENSMUST00000108373 267 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Cntn3Q07409 Colca2-201ENSMUST00000114427 1263 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Cntn3Q07409 Gm14740-201ENSMUST00000118538 1150 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Cntn3Q07409 Gm8302-201ENSMUST00000119217 852 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Cntn3Q07409 Gm13668-201ENSMUST00000119237 1001 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Cntn3Q07409 Gm13117-201ENSMUST00000120894 691 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Cntn3Q07409 Gm15412-201ENSMUST00000137193 1096 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Cntn3Q07409 Gm38389-201ENSMUST00000147871 653 ntTSL 3 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.4 ms