Protein–RNA interactions for Protein: Q01320

Top2a, DNA topoisomerase 2-alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,528 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top2aQ01320 Dpep1-201ENSMUST00000019422 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Top2aQ01320 AC126257.2-201ENSMUST00000215507 2300 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Top2aQ01320 L3mbtl2-208ENSMUST00000174229 2578 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Top2aQ01320 Ciz1-204ENSMUST00000113334 2871 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Top2aQ01320 Filip1l-202ENSMUST00000159414 3253 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Top2aQ01320 Rspo2-201ENSMUST00000063492 3338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Top2aQ01320 Nfx1-202ENSMUST00000091614 3617 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Top2aQ01320 Tnnt3-213ENSMUST00000105952 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Top2aQ01320 Tnnt3-215ENSMUST00000105954 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Top2aQ01320 Tnnt3-216ENSMUST00000105955 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Top2aQ01320 Tnnt3-218ENSMUST00000105958 1050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Top2aQ01320 Paip2-202ENSMUST00000115734 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Top2aQ01320 Gm12345-201ENSMUST00000119288 898 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Top2aQ01320 Gm14148-201ENSMUST00000122433 1008 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Top2aQ01320 3110039M20Rik-201ENSMUST00000127041 868 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Top2aQ01320 Gm6425-201ENSMUST00000136332 790 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Top2aQ01320 Lats2-207ENSMUST00000173990 3834 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Top2aQ01320 Gm21958-201ENSMUST00000178832 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Top2aQ01320 Tnnt3-225ENSMUST00000179658 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Top2aQ01320 Gm28746-201ENSMUST00000187453 380 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Top2aQ01320 Gm37590-201ENSMUST00000193294 603 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Top2aQ01320 Olfr225-201ENSMUST00000055276 1260 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Top2aQ01320 Rpl9-201ENSMUST00000057885 738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Top2aQ01320 Tnnt3-202ENSMUST00000078497 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Top2aQ01320 Fthl17e-201ENSMUST00000096509 841 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Top2aQ01320 Tmigd1-202ENSMUST00000102495 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Top2aQ01320 Gpr19-213ENSMUST00000215088 1484 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Top2aQ01320 Ap5s1-203ENSMUST00000110208 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Top2aQ01320 Met-202ENSMUST00000115442 4663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Top2aQ01320 Atxn7l1-203ENSMUST00000110824 1675 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Top2aQ01320 Umod-201ENSMUST00000033263 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Top2aQ01320 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Top2aQ01320 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Top2aQ01320 Slc4a2-202ENSMUST00000115047 4264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Top2aQ01320 Dnm1-202ENSMUST00000091089 3764 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Top2aQ01320 Kctd18-210ENSMUST00000164963 2114 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Top2aQ01320 Ccm2-203ENSMUST00000109722 1760 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Top2aQ01320 Slc35d1-203ENSMUST00000150285 4242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Top2aQ01320 Gm20831-201ENSMUST00000177639 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Top2aQ01320 Ssty1-202ENSMUST00000186035 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Top2aQ01320 Gm20737-202ENSMUST00000187245 1338 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Top2aQ01320 Gm20777-202ENSMUST00000187434 1341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Top2aQ01320 Gm20873-202ENSMUST00000187857 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Top2aQ01320 Gm20772-201ENSMUST00000188928 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Top2aQ01320 Gm21310-202ENSMUST00000189630 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Top2aQ01320 Gm20795-202ENSMUST00000190909 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Top2aQ01320 Gm21454-202ENSMUST00000192204 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Top2aQ01320 Gm21440-201ENSMUST00000192749 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Top2aQ01320 Gm20831-202ENSMUST00000194411 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Top2aQ01320 Gm20807-201ENSMUST00000194687 1336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Top2aQ01320 Gm21425-202ENSMUST00000195626 1345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Top2aQ01320 Eapp-202ENSMUST00000110713 886 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Top2aQ01320 Il15ra-203ENSMUST00000114831 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Top2aQ01320 Ppt1-204ENSMUST00000121870 986 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Top2aQ01320 Gm15258-201ENSMUST00000153801 741 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Top2aQ01320 1500015A07Rik-202ENSMUST00000184530 423 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Top2aQ01320 Gm43777-201ENSMUST00000197269 376 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Top2aQ01320 Gm46328-201ENSMUST00000217924 976 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Top2aQ01320 Stpg4-201ENSMUST00000040609 847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Top2aQ01320 Ptma-201ENSMUST00000045897 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Top2aQ01320 Pbp2-201ENSMUST00000050471 1279 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Top2aQ01320 Sectm1b-202ENSMUST00000081499 1222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Top2aQ01320 Capn3-205ENSMUST00000110719 2778 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Top2aQ01320 Sqle-202ENSMUST00000100640 2636 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Top2aQ01320 Sectm1b-201ENSMUST00000039309 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Top2aQ01320 Gm16677-201ENSMUST00000181229 2174 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Top2aQ01320 Gm27174-201ENSMUST00000184493 2174 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Top2aQ01320 Olfr1495-202ENSMUST00000215930 2025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Top2aQ01320 Slc17a8-202ENSMUST00000105295 1863 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Top2aQ01320 4930512J16Rik-201ENSMUST00000203704 1859 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Top2aQ01320 Npr2-201ENSMUST00000030191 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Top2aQ01320 3110062M04Rik-201ENSMUST00000055097 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Top2aQ01320 Zfp830-201ENSMUST00000056677 1591 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Top2aQ01320 Gm21136-201ENSMUST00000186812 2575 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Top2aQ01320 Gm6605-201ENSMUST00000031488 2574 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Top2aQ01320 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Top2aQ01320 Phrf1-201ENSMUST00000106027 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Top2aQ01320 Slc12a8-203ENSMUST00000119173 2382 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Top2aQ01320 Gm8968-201ENSMUST00000199133 1303 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Top2aQ01320 Lypla1-202ENSMUST00000115529 930 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Top2aQ01320 Junos-202ENSMUST00000125438 559 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Top2aQ01320 2410152P15Rik-201ENSMUST00000137405 871 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Top2aQ01320 C130080G10Rik-204ENSMUST00000155185 954 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Top2aQ01320 Gm26957-201ENSMUST00000182645 977 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Top2aQ01320 Gm27444-201ENSMUST00000184157 137 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Top2aQ01320 2810049E08Rik-201ENSMUST00000185600 1102 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Top2aQ01320 1700019D03Rik-207ENSMUST00000191441 638 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Top2aQ01320 Gm45783-201ENSMUST00000210877 656 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Top2aQ01320 Gm8796-201ENSMUST00000219122 936 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Top2aQ01320 AC116797.2-202ENSMUST00000223587 1017 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Top2aQ01320 Atp6v1e2-201ENSMUST00000065758 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Top2aQ01320 Zfp426-202ENSMUST00000115562 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Top2aQ01320 Samd4b-201ENSMUST00000040531 4349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Top2aQ01320 Lmnb2-204ENSMUST00000179022 3370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Top2aQ01320 Grk4-202ENSMUST00000074651 3234 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Top2aQ01320 Rasgrp1-204ENSMUST00000173252 1750 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Top2aQ01320 Vrtn-201ENSMUST00000095551 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Top2aQ01320 Pex26-201ENSMUST00000088561 4093 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Top2aQ01320 Sv2a-201ENSMUST00000035371 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Top2aQ01320 H2-M10.1-201ENSMUST00000025322 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.8 ms