Protein–RNA interactions for Protein: Q01098

Grin2c, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2C, mousemouse

Predictions only

Length 1,239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grin2cQ01098 Lta4h-201ENSMUST00000016033 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Grin2cQ01098 Serinc2-202ENSMUST00000120126 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Grin2cQ01098 Kctd18-210ENSMUST00000164963 2114 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Grin2cQ01098 Tmem138-201ENSMUST00000025568 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Grin2cQ01098 Agpat3-205ENSMUST00000105390 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Grin2cQ01098 Txlna-202ENSMUST00000084264 4847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Grin2cQ01098 Fam206a-201ENSMUST00000045368 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Grin2cQ01098 Arrb1-201ENSMUST00000032995 3715 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Grin2cQ01098 Gtf2ird1-224ENSMUST00000202280 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Grin2cQ01098 Gm43174-201ENSMUST00000195914 2445 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Grin2cQ01098 Tbcd-201ENSMUST00000103013 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Grin2cQ01098 Prrt3-204ENSMUST00000205075 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Grin2cQ01098 Slc44a1-204ENSMUST00000107647 2176 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Grin2cQ01098 Agxt2-204ENSMUST00000110542 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Grin2cQ01098 Msantd2-204ENSMUST00000211060 2165 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Grin2cQ01098 Psg23-201ENSMUST00000057810 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Grin2cQ01098 Fyb2-201ENSMUST00000106803 3136 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Grin2cQ01098 Dolpp1-203ENSMUST00000123202 2294 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Grin2cQ01098 Dolpp1-201ENSMUST00000028209 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Grin2cQ01098 Flnc-202ENSMUST00000101617 8939 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Grin2cQ01098 Carmil1-201ENSMUST00000072889 4988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Grin2cQ01098 Steap3-202ENSMUST00000112640 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Grin2cQ01098 Terb1-201ENSMUST00000064576 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Grin2cQ01098 Zfp467-204ENSMUST00000114559 3163 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Grin2cQ01098 Camkk1-201ENSMUST00000092937 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Grin2cQ01098 Gm16459-201ENSMUST00000121443 686 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Grin2cQ01098 Gm15171-201ENSMUST00000122191 334 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Grin2cQ01098 Polr3c-205ENSMUST00000141377 808 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Grin2cQ01098 Gm16030-201ENSMUST00000159098 603 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Grin2cQ01098 Gm10320-201ENSMUST00000170205 527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Grin2cQ01098 Psme1-208ENSMUST00000174259 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Grin2cQ01098 Gm4791-201ENSMUST00000178065 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Grin2cQ01098 Gm9034-201ENSMUST00000182071 1005 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Grin2cQ01098 Gm8756-201ENSMUST00000183250 929 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Grin2cQ01098 Mrpl20-206ENSMUST00000185148 494 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Grin2cQ01098 Gm34379-201ENSMUST00000195036 290 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Grin2cQ01098 Gm45094-201ENSMUST00000207013 617 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Grin2cQ01098 AC098716.1-201ENSMUST00000213527 703 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Grin2cQ01098 Gm31557-202ENSMUST00000213995 722 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Grin2cQ01098 AC140409.3-201ENSMUST00000215601 358 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Grin2cQ01098 CT009527.1-201ENSMUST00000224205 339 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Grin2cQ01098 Gm26670-202ENSMUST00000226862 340 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Grin2cQ01098 Olfr1039-201ENSMUST00000099910 960 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Grin2cQ01098 Cog3-203ENSMUST00000227473 4197 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Grin2cQ01098 AF529169-201ENSMUST00000044491 7202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Grin2cQ01098 Grm1-201ENSMUST00000044306 6930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Grin2cQ01098 Kcnab2-201ENSMUST00000030768 3533 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Grin2cQ01098 AC156031.2-201ENSMUST00000213107 3310 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Grin2cQ01098 4833422C13Rik-202ENSMUST00000160385 2828 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Grin2cQ01098 Arhgap29-201ENSMUST00000037958 5787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Grin2cQ01098 Mocs2-216ENSMUST00000184672 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Grin2cQ01098 Gm44742-201ENSMUST00000207190 1412 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Grin2cQ01098 Gm39526-201ENSMUST00000208925 1413 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Grin2cQ01098 Gm8899-201ENSMUST00000214635 1332 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Grin2cQ01098 4931406C07Rik-203ENSMUST00000180339 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Grin2cQ01098 Hbs1l-201ENSMUST00000020153 2793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Grin2cQ01098 Ncoa3-202ENSMUST00000109252 5757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Grin2cQ01098 Il21r-201ENSMUST00000033000 2499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Grin2cQ01098 Lysmd1-201ENSMUST00000066386 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Grin2cQ01098 Gm37513-201ENSMUST00000194830 2268 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Grin2cQ01098 Gm38378-201ENSMUST00000195153 2268 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Grin2cQ01098 Abca7-203ENSMUST00000171637 6638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Grin2cQ01098 Adamts1-201ENSMUST00000023610 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Grin2cQ01098 Ncoa6-203ENSMUST00000109670 7101 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Grin2cQ01098 Hdac5-204ENSMUST00000107152 3788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Grin2cQ01098 Camk2b-207ENSMUST00000101586 1590 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Grin2cQ01098 Gm2721-201ENSMUST00000222380 1571 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Grin2cQ01098 Ehd3-201ENSMUST00000024860 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Grin2cQ01098 Hspa2-202ENSMUST00000219555 2526 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Grin2cQ01098 Frmd8-201ENSMUST00000025728 4504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Grin2cQ01098 Wdr33-201ENSMUST00000025264 6206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Grin2cQ01098 Rnf180-205ENSMUST00000226044 3279 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Grin2cQ01098 Gm14255-201ENSMUST00000128846 248 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Grin2cQ01098 Gm15787-203ENSMUST00000130892 1250 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Grin2cQ01098 Cideb-201ENSMUST00000001497 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Grin2cQ01098 Btf3-205ENSMUST00000152704 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Grin2cQ01098 Gm4462-201ENSMUST00000166453 492 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Grin2cQ01098 H2-T24-202ENSMUST00000174063 884 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Grin2cQ01098 Gm13272-201ENSMUST00000179425 811 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Grin2cQ01098 Mir6953-201ENSMUST00000184745 68 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Grin2cQ01098 Gm37365-201ENSMUST00000193109 409 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Grin2cQ01098 Nme6-214ENSMUST00000200468 865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Grin2cQ01098 Gm45701-201ENSMUST00000212049 235 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Grin2cQ01098 AC153899.1-201ENSMUST00000214092 1117 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Grin2cQ01098 AC154436.1-201ENSMUST00000227272 782 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Grin2cQ01098 Crygb-201ENSMUST00000027090 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Grin2cQ01098 Gm8181-201ENSMUST00000062242 669 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Grin2cQ01098 Sod2-201ENSMUST00000007012 3824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Grin2cQ01098 P2rx7-202ENSMUST00000086247 712 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Grin2cQ01098 Olfr1275-201ENSMUST00000099620 1020 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Grin2cQ01098 AI314180-202ENSMUST00000102889 7045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Grin2cQ01098 Gm8038-201ENSMUST00000164674 2044 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Grin2cQ01098 Jarid2-201ENSMUST00000044608 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Grin2cQ01098 Pla2g6-206ENSMUST00000173163 3018 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Grin2cQ01098 Fmo2-202ENSMUST00000111510 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Grin2cQ01098 Grpel2-201ENSMUST00000062991 4030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Grin2cQ01098 Nacc2-202ENSMUST00000114159 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Grin2cQ01098 Cyp8b1-201ENSMUST00000062474 1950 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Grin2cQ01098 Atl3-202ENSMUST00000170373 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Grin2cQ01098 Acacb-201ENSMUST00000031583 8482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.8 ms