Protein–RNA interactions for Protein: Q01097

Grin2b, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2B, mousemouse

Predictions only

Length 1,482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grin2bQ01097 Gm18182-201ENSMUST00000191380 1251 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Grin2bQ01097 A830092H15Rik-202ENSMUST00000195446 649 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Grin2bQ01097 Camsap3-209ENSMUST00000207970 3817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Grin2bQ01097 CAAA01125382.3-201ENSMUST00000215277 643 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Grin2bQ01097 Gm19090-201ENSMUST00000218187 774 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Grin2bQ01097 Nqo2-203ENSMUST00000220844 957 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Grin2bQ01097 AC127583.1-201ENSMUST00000224351 540 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Grin2bQ01097 Acsm1-201ENSMUST00000047929 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Grin2bQ01097 Hnrnph2-203ENSMUST00000074950 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Grin2bQ01097 Gm15411-201ENSMUST00000133243 3488 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Grin2bQ01097 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Grin2bQ01097 Hacd2-201ENSMUST00000061156 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Grin2bQ01097 Rep15-201ENSMUST00000036194 1662 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Grin2bQ01097 Gabrr1-201ENSMUST00000029947 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Grin2bQ01097 Rap1gds1-202ENSMUST00000098574 3669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Grin2bQ01097 Rnf225-201ENSMUST00000045870 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Grin2bQ01097 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Grin2bQ01097 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Grin2bQ01097 Plac9b-201ENSMUST00000100809 388 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Grin2bQ01097 Lypla1-202ENSMUST00000115529 930 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Grin2bQ01097 Mxd1-201ENSMUST00000001184 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Grin2bQ01097 Gm16283-201ENSMUST00000149935 522 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Grin2bQ01097 Gm5501-201ENSMUST00000165917 832 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Grin2bQ01097 Mir6934-201ENSMUST00000183965 62 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Grin2bQ01097 Gm18552-201ENSMUST00000187425 538 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Grin2bQ01097 Pik3r4-206ENSMUST00000188784 1295 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Grin2bQ01097 Gm19798-201ENSMUST00000201502 457 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Grin2bQ01097 2010008C14Rik-201ENSMUST00000203956 593 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Grin2bQ01097 Gm44196-203ENSMUST00000204359 1190 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Grin2bQ01097 Gm6426-201ENSMUST00000209048 854 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Grin2bQ01097 Gm18391-201ENSMUST00000217189 658 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Grin2bQ01097 AC122824.1-201ENSMUST00000221705 828 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Grin2bQ01097 H2-T3-201ENSMUST00000025312 2114 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Grin2bQ01097 Gm9790-201ENSMUST00000054148 288 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Grin2bQ01097 Gm6304-201ENSMUST00000096579 447 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Grin2bQ01097 Mcu-201ENSMUST00000009791 1079 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Grin2bQ01097 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Grin2bQ01097 Fcrl1-206ENSMUST00000194786 1540 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Grin2bQ01097 Syvn1-207ENSMUST00000156550 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Grin2bQ01097 Nsun7-204ENSMUST00000202994 3632 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Grin2bQ01097 Ank3-201ENSMUST00000047061 2517 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Grin2bQ01097 Rad54l-202ENSMUST00000102705 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Grin2bQ01097 Gnai3-201ENSMUST00000000001 3262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Grin2bQ01097 Dytn-201ENSMUST00000090313 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Grin2bQ01097 St6galnac4-204ENSMUST00000179989 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Grin2bQ01097 Olfr582-203ENSMUST00000211036 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Grin2bQ01097 Igsf11-202ENSMUST00000114706 1578 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Grin2bQ01097 Hsd17b13-202ENSMUST00000112803 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Grin2bQ01097 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Grin2bQ01097 Smim1-208ENSMUST00000143047 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Grin2bQ01097 Rffl-201ENSMUST00000021036 1719 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Grin2bQ01097 St14-201ENSMUST00000034478 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Grin2bQ01097 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Grin2bQ01097 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Grin2bQ01097 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Grin2bQ01097 Tfe3-202ENSMUST00000079542 3163 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Grin2bQ01097 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Grin2bQ01097 Fgfr1op-201ENSMUST00000024636 3077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Grin2bQ01097 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Grin2bQ01097 Gm38048-201ENSMUST00000193778 2174 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Grin2bQ01097 Zfp93-201ENSMUST00000032696 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Grin2bQ01097 Gm24470-201ENSMUST00000104486 132 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Grin2bQ01097 Gm15793-201ENSMUST00000121857 495 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Grin2bQ01097 C130080G10Rik-204ENSMUST00000155185 954 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Grin2bQ01097 D330041H03Rik-202ENSMUST00000180390 411 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Grin2bQ01097 Gm28391-201ENSMUST00000185202 379 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Grin2bQ01097 Gm29528-201ENSMUST00000186699 379 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Grin2bQ01097 Gm29526-201ENSMUST00000187217 379 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Grin2bQ01097 Gm43777-201ENSMUST00000197269 376 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Grin2bQ01097 Gm42493-201ENSMUST00000197559 1121 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Grin2bQ01097 Ckb-ps2-201ENSMUST00000198886 1001 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Grin2bQ01097 Smim23-201ENSMUST00000020508 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Grin2bQ01097 Tmem238l-203ENSMUST00000211300 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Grin2bQ01097 4933407I05Rik-202ENSMUST00000213467 420 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Grin2bQ01097 Tpd52l1-204ENSMUST00000214644 1103 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Grin2bQ01097 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Grin2bQ01097 Tfe3-204ENSMUST00000115677 2943 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Grin2bQ01097 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Grin2bQ01097 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Grin2bQ01097 Trappc12-201ENSMUST00000020954 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Grin2bQ01097 Kcnab2-201ENSMUST00000030768 3533 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Grin2bQ01097 C530043K16Rik-201ENSMUST00000201865 3109 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Grin2bQ01097 Phrf1-201ENSMUST00000106027 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Grin2bQ01097 Gm42521-201ENSMUST00000199190 2040 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Grin2bQ01097 6030458C11Rik-204ENSMUST00000228177 3156 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Grin2bQ01097 Gpc5-203ENSMUST00000176912 2837 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Grin2bQ01097 Asap1-218ENSMUST00000177374 4582 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Grin2bQ01097 Platr6-201ENSMUST00000180731 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Grin2bQ01097 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Grin2bQ01097 Dab2-203ENSMUST00000110663 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Grin2bQ01097 Sgcg-202ENSMUST00000121148 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Grin2bQ01097 Defa-ps17-201ENSMUST00000121849 171 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Grin2bQ01097 Tsku-202ENSMUST00000164726 2620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Grin2bQ01097 C430039J16Rik-201ENSMUST00000181148 658 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Grin2bQ01097 Scgb2b27-203ENSMUST00000185399 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Grin2bQ01097 Gm29669-201ENSMUST00000188605 881 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Grin2bQ01097 0610033M10Rik-202ENSMUST00000205236 1102 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Grin2bQ01097 Gm42375-201ENSMUST00000206226 745 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Grin2bQ01097 Sfxn1-201ENSMUST00000021930 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Grin2bQ01097 Supt4a-201ENSMUST00000093955 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.2 ms