Protein–RNA interactions for Protein: P98083

Shc1, SHC-transforming protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 579 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shc1P98083 Gm15856-201ENSMUST00000124853 1162 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Shc1P98083 Gm13830-203ENSMUST00000148916 247 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Shc1P98083 Gm13449-201ENSMUST00000153559 1231 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Shc1P98083 Gm6408-201ENSMUST00000179032 1171 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Shc1P98083 Gm3508-201ENSMUST00000186012 792 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Shc1P98083 Gm7271-202ENSMUST00000191515 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Shc1P98083 Gm37284-201ENSMUST00000193607 539 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Shc1P98083 4930447N08Rik-203ENSMUST00000198879 1157 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Shc1P98083 Fam228a-203ENSMUST00000220978 861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Shc1P98083 Cd7-201ENSMUST00000026159 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Shc1P98083 Pgpep1l-201ENSMUST00000032770 953 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Shc1P98083 Gm21411-201ENSMUST00000049821 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Shc1P98083 Tas2r125-201ENSMUST00000076119 937 ntAPPRIS P1 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Shc1P98083 Gm8110-202ENSMUST00000211297 1782 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Shc1P98083 Zfp37-206ENSMUST00000222050 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Shc1P98083 AC153380.1-201ENSMUST00000214959 2364 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Shc1P98083 Nos3-201ENSMUST00000030834 4132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Shc1P98083 Tmem140-201ENSMUST00000074949 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Shc1P98083 Nfx1-202ENSMUST00000091614 3617 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Shc1P98083 Nfic-203ENSMUST00000105321 6237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Shc1P98083 Egr2-201ENSMUST00000048289 2965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Shc1P98083 Dip2c-201ENSMUST00000166299 4822 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Shc1P98083 Gm4419-201ENSMUST00000180671 1729 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Shc1P98083 Tyk2-203ENSMUST00000214454 4770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Shc1P98083 Foxp1-221ENSMUST00000176632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Shc1P98083 Foxp1-222ENSMUST00000176850 2339 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Shc1P98083 Sfrp4-203ENSMUST00000222464 4049 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Shc1P98083 1700036A12Rik-202ENSMUST00000190053 1828 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Shc1P98083 Slc5a8-201ENSMUST00000020255 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Shc1P98083 Gm6655-201ENSMUST00000201932 1309 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Shc1P98083 Aldh3a2-201ENSMUST00000066277 2892 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Shc1P98083 Metap2-201ENSMUST00000047910 4424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Shc1P98083 Pip5k1b-202ENSMUST00000112673 2387 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Shc1P98083 Map4-203ENSMUST00000163979 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Shc1P98083 Slc45a3-201ENSMUST00000027695 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Shc1P98083 Dph6-203ENSMUST00000102542 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Shc1P98083 Eef1a1-201ENSMUST00000042235 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Shc1P98083 Gpatch2l-204ENSMUST00000221368 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Shc1P98083 Ppp4r1-201ENSMUST00000073104 3850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Shc1P98083 Sun1-203ENSMUST00000100517 1522 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Shc1P98083 Trim6-206ENSMUST00000214578 1506 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Shc1P98083 Zfp410-215ENSMUST00000222832 1859 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Shc1P98083 Preb-201ENSMUST00000074840 6300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Shc1P98083 Ccl22-201ENSMUST00000034231 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Shc1P98083 Rab14-202ENSMUST00000113025 4346 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Shc1P98083 Rnf220-201ENSMUST00000030439 3029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Shc1P98083 Ssc4d-202ENSMUST00000111150 459 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Shc1P98083 Eef1d-207ENSMUST00000116440 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Shc1P98083 Rps2-ps4-201ENSMUST00000121977 633 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Shc1P98083 Cfap100-204ENSMUST00000134224 849 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Shc1P98083 Gm15412-201ENSMUST00000137193 1096 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Shc1P98083 Gm11815-201ENSMUST00000139423 708 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Shc1P98083 Gm11457-203ENSMUST00000146846 676 ntTSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Shc1P98083 Gm24514-201ENSMUST00000174961 285 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Shc1P98083 Gm7137-201ENSMUST00000180161 711 ntAPPRIS P1 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Shc1P98083 Gm37406-201ENSMUST00000192478 500 ntTSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Shc1P98083 Gm42657-201ENSMUST00000201746 211 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Shc1P98083 AC118476.3-201ENSMUST00000216419 1219 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Shc1P98083 Gm18556-201ENSMUST00000219748 1031 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Shc1P98083 Gm19046-201ENSMUST00000221263 1298 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Shc1P98083 Gm29676-202ENSMUST00000222409 364 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Shc1P98083 AC154257.1-202ENSMUST00000224729 843 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Shc1P98083 Pf4-201ENSMUST00000031320 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Shc1P98083 Olfr462-201ENSMUST00000049743 936 ntAPPRIS P1 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Shc1P98083 Olfr354-201ENSMUST00000068475 1084 ntAPPRIS P1 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Shc1P98083 Tanc1-201ENSMUST00000037526 7873 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Shc1P98083 E330034L11Rik-201ENSMUST00000200640 1742 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Shc1P98083 Gm17213-201ENSMUST00000165161 1360 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Shc1P98083 Wif1-203ENSMUST00000175867 2183 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Shc1P98083 Gm10848-201ENSMUST00000192361 1811 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Shc1P98083 Tfr2-207ENSMUST00000198866 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Shc1P98083 Hbs1l-209ENSMUST00000219915 2733 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Shc1P98083 Actr1a-201ENSMUST00000040270 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Shc1P98083 Lgals8-201ENSMUST00000099820 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Shc1P98083 Spdye4a-203ENSMUST00000195900 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Shc1P98083 Ndst3-202ENSMUST00000124803 1917 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Shc1P98083 Cacna1c-205ENSMUST00000112825 7577 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Shc1P98083 Kyat1-206ENSMUST00000113663 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Shc1P98083 Ces2d-ps-201ENSMUST00000043209 1656 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Shc1P98083 Gm29358-202ENSMUST00000187941 3227 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Shc1P98083 Trip4-202ENSMUST00000119245 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Shc1P98083 Slc35b3-202ENSMUST00000167513 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Shc1P98083 Gpr173-201ENSMUST00000070316 4855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Shc1P98083 Spats2l-211ENSMUST00000169772 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Shc1P98083 Fam83a-202ENSMUST00000160942 2876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Shc1P98083 Akap3-202ENSMUST00000202574 2879 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Shc1P98083 Tmbim1-202ENSMUST00000113796 11011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Shc1P98083 Nphs1-201ENSMUST00000006825 4608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Shc1P98083 Zfp518b-203ENSMUST00000179555 6816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Shc1P98083 Prf1-201ENSMUST00000035419 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Shc1P98083 Wdr36-201ENSMUST00000053663 3281 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Shc1P98083 Tcp11l2-201ENSMUST00000020223 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Shc1P98083 Pdik1l-203ENSMUST00000105877 4674 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Shc1P98083 Nudt13-203ENSMUST00000223663 1633 ntAPPRIS P1 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Shc1P98083 Rab3c-202ENSMUST00000223922 2398 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Shc1P98083 Rbms1-201ENSMUST00000028347 4436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Shc1P98083 Ces5a-203ENSMUST00000212009 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Shc1P98083 Acad8-202ENSMUST00000120367 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Shc1P98083 Taf6l-202ENSMUST00000010249 848 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Shc1P98083 Nudt6-203ENSMUST00000108117 879 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
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