Protein–RNA interactions for Protein: P84244

H3f3a, Histone H3.3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 136 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H3f3aP84244 Pla2g4b-201ENSMUST00000126150 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
H3f3aP84244 Fut2-201ENSMUST00000069800 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
H3f3aP84244 Ces5a-203ENSMUST00000212009 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
H3f3aP84244 Pou2f1-202ENSMUST00000069609 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
H3f3aP84244 Cdc42ep4-201ENSMUST00000053536 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
H3f3aP84244 Robo4-201ENSMUST00000102895 3226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
H3f3aP84244 Zfp866-202ENSMUST00000137573 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
H3f3aP84244 Atp4a-204ENSMUST00000170371 3447 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
H3f3aP84244 Gm2000-201ENSMUST00000102782 445 ntAPPRIS P1 BASIC10.01□□□□□ -0.81
H3f3aP84244 Snord17-201ENSMUST00000104526 238 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
H3f3aP84244 Rplp2-202ENSMUST00000106003 449 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
H3f3aP84244 Akr1b10-202ENSMUST00000115051 1022 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
H3f3aP84244 Tsc22d1-206ENSMUST00000134109 801 ntTSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
H3f3aP84244 Gm11789-203ENSMUST00000140645 737 ntTSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
H3f3aP84244 Zfp133-ps-204ENSMUST00000149523 424 ntTSL 3 BASIC10.01□□□□□ -0.81
H3f3aP84244 Gm22902-201ENSMUST00000158488 302 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
H3f3aP84244 1700021P04Rik-201ENSMUST00000178667 659 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
H3f3aP84244 Gm5523-201ENSMUST00000180415 997 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
H3f3aP84244 Mir7051-201ENSMUST00000184167 73 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
H3f3aP84244 Gm29261-201ENSMUST00000188535 678 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
H3f3aP84244 Gm29560-201ENSMUST00000191526 881 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
H3f3aP84244 Nt5dc1-206ENSMUST00000213269 802 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
H3f3aP84244 AC027700.1-201ENSMUST00000213965 370 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
H3f3aP84244 Timm9-201ENSMUST00000021486 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
H3f3aP84244 Fam228a-203ENSMUST00000220978 861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
H3f3aP84244 Fpr-rs3-201ENSMUST00000071189 1032 ntAPPRIS P1 BASIC10.01□□□□□ -0.81
H3f3aP84244 Krtap5-1-201ENSMUST00000084413 588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
H3f3aP84244 Lst1-201ENSMUST00000097336 415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
H3f3aP84244 Cipc-208ENSMUST00000189246 1454 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
H3f3aP84244 Gm44999-201ENSMUST00000207456 1493 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
H3f3aP84244 Nras-201ENSMUST00000029445 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
H3f3aP84244 Lpar1-203ENSMUST00000107571 3543 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
H3f3aP84244 Actr1a-201ENSMUST00000040270 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
H3f3aP84244 Cct3-208ENSMUST00000168062 1943 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
H3f3aP84244 Gm10750-201ENSMUST00000099266 1506 ntAPPRIS P1 BASIC10.01□□□□□ -0.81
H3f3aP84244 Gm7538-201ENSMUST00000200918 1348 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
H3f3aP84244 Eid3-201ENSMUST00000211623 1305 ntAPPRIS P1 BASIC10.01□□□□□ -0.81
H3f3aP84244 Dpysl4-201ENSMUST00000026551 3552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
H3f3aP84244 Sertad2-201ENSMUST00000093292 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
H3f3aP84244 Syne3-202ENSMUST00000095439 3357 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
H3f3aP84244 Abcg2-202ENSMUST00000114294 2178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
H3f3aP84244 Arhgef4-204ENSMUST00000159747 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
H3f3aP84244 Usp5-201ENSMUST00000047510 3213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
H3f3aP84244 Etfbkmt-209ENSMUST00000179873 1576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.01□□□□□ -0.81
H3f3aP84244 Ctnnal1-201ENSMUST00000045142 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
H3f3aP84244 Dcaf12l1-202ENSMUST00000115056 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
H3f3aP84244 Abi1-203ENSMUST00000093171 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
H3f3aP84244 Dna2-203ENSMUST00000131422 4122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
H3f3aP84244 Fcho1-201ENSMUST00000093444 3073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
H3f3aP84244 Brd3-201ENSMUST00000028282 5419 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
H3f3aP84244 1700061G19Rik-201ENSMUST00000025048 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
H3f3aP84244 1700036A12Rik-202ENSMUST00000190053 1828 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
H3f3aP84244 Tcim-201ENSMUST00000052622 1805 ntAPPRIS P1 BASIC10□□□□□ -0.81
H3f3aP84244 Tbl2-204ENSMUST00000153183 7488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
H3f3aP84244 Mgl2-205ENSMUST00000165951 1635 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
H3f3aP84244 Polm-201ENSMUST00000020767 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
H3f3aP84244 Ttll1-201ENSMUST00000016897 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
H3f3aP84244 Pax5-203ENSMUST00000107825 1445 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
H3f3aP84244 Dis3l-201ENSMUST00000068367 3605 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
H3f3aP84244 Epb41l3-202ENSMUST00000112680 4073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
H3f3aP84244 Tmod2-202ENSMUST00000098552 9871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
H3f3aP84244 Gm6831-202ENSMUST00000213025 1673 ntBASIC10□□□□□ -0.81
H3f3aP84244 AC153380.1-201ENSMUST00000214959 2364 ntBASIC10□□□□□ -0.81
H3f3aP84244 Ttc17-203ENSMUST00000111237 4409 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
H3f3aP84244 Plscr1-202ENSMUST00000186364 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
H3f3aP84244 Pabpc4-203ENSMUST00000106241 3050 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
H3f3aP84244 Dlk1-201ENSMUST00000056110 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
H3f3aP84244 Coq8a-201ENSMUST00000027766 4026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
H3f3aP84244 A230006K03Rik-201ENSMUST00000107533 977 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
H3f3aP84244 Gngt2-205ENSMUST00000107711 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
H3f3aP84244 Nudt6-203ENSMUST00000108117 879 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
H3f3aP84244 Gm13422-201ENSMUST00000118834 504 ntBASIC10□□□□□ -0.81
H3f3aP84244 Gm15131-201ENSMUST00000119124 595 ntBASIC10□□□□□ -0.81
H3f3aP84244 Gm8197-202ENSMUST00000193422 934 ntBASIC10□□□□□ -0.81
H3f3aP84244 Gm30946-201ENSMUST00000198288 724 ntBASIC10□□□□□ -0.81
H3f3aP84244 Fam168a-204ENSMUST00000207564 1083 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
H3f3aP84244 Proz-203ENSMUST00000211363 984 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
H3f3aP84244 AC155712.2-201ENSMUST00000220398 643 ntTSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
H3f3aP84244 Taar9-201ENSMUST00000041180 1047 ntAPPRIS P1 BASIC10□□□□□ -0.81
H3f3aP84244 BC030499-201ENSMUST00000046361 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
H3f3aP84244 Nceh1-202ENSMUST00000091284 830 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
H3f3aP84244 Gm6509-201ENSMUST00000098286 1218 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
H3f3aP84244 Slc30a8-201ENSMUST00000037240 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
H3f3aP84244 Ttc25-201ENSMUST00000006976 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
H3f3aP84244 Bcl2l14-201ENSMUST00000032321 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
H3f3aP84244 Cars-202ENSMUST00000105909 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
H3f3aP84244 Gm6655-201ENSMUST00000201932 1309 ntBASIC10□□□□□ -0.81
H3f3aP84244 Rabl2-202ENSMUST00000094056 1322 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
H3f3aP84244 Gm15941-205ENSMUST00000140044 1825 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
H3f3aP84244 Nono-201ENSMUST00000033673 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
H3f3aP84244 Flot2-202ENSMUST00000073660 2568 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
H3f3aP84244 Sptan1-204ENSMUST00000113717 7958 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
H3f3aP84244 Kirrel3-209ENSMUST00000190549 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
H3f3aP84244 Hars2-206ENSMUST00000152954 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
H3f3aP84244 Vmn1r45-201ENSMUST00000054202 3341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
H3f3aP84244 Bod1l-201ENSMUST00000050556 10540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
H3f3aP84244 Ndst1-201ENSMUST00000169273 6070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
H3f3aP84244 Myo18a-222ENSMUST00000168348 6582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
H3f3aP84244 Acad8-202ENSMUST00000120367 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
H3f3aP84244 Rad51b-202ENSMUST00000171210 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
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