Protein–RNA interactions for Protein: P59240

Nphp4, Nephrocystin-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nphp4P59240 Adh6-ps1-202ENSMUST00000196293 754 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Nphp4P59240 Gm7902-201ENSMUST00000198842 947 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Nphp4P59240 Lsm8-204ENSMUST00000201141 503 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Nphp4P59240 Gm30731-201ENSMUST00000203909 825 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nphp4P59240 Fabp6-201ENSMUST00000020672 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nphp4P59240 Gm45135-201ENSMUST00000206787 1184 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Nphp4P59240 AC164556.1-201ENSMUST00000221318 751 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Nphp4P59240 CT009713.2-201ENSMUST00000225532 1149 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Nphp4P59240 Fam83a-201ENSMUST00000050374 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nphp4P59240 P2rx7-202ENSMUST00000086247 712 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nphp4P59240 Pou2f1-209ENSMUST00000160908 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nphp4P59240 Btg2-201ENSMUST00000020692 2743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nphp4P59240 Fam198a-203ENSMUST00000214536 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nphp4P59240 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nphp4P59240 Serpinb6a-203ENSMUST00000076532 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Nphp4P59240 Tbp-203ENSMUST00000118001 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nphp4P59240 Spata16-202ENSMUST00000108305 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nphp4P59240 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nphp4P59240 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nphp4P59240 Dcaf11-203ENSMUST00000117701 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Nphp4P59240 Asap1-201ENSMUST00000023008 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Nphp4P59240 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nphp4P59240 Hsd3b3-204ENSMUST00000107019 1533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Nphp4P59240 Stx17-203ENSMUST00000107721 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nphp4P59240 Gem-202ENSMUST00000108304 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nphp4P59240 Tef-202ENSMUST00000109553 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nphp4P59240 Kif1a-202ENSMUST00000112958 5931 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nphp4P59240 Kng2-203ENSMUST00000115349 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nphp4P59240 Gm11919-201ENSMUST00000117609 721 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Nphp4P59240 Slc12a8-203ENSMUST00000119173 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nphp4P59240 Gm15498-201ENSMUST00000126693 723 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nphp4P59240 Eef1b2-204ENSMUST00000129339 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nphp4P59240 Patz1-207ENSMUST00000134089 1904 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nphp4P59240 Gm13412-201ENSMUST00000150621 677 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Nphp4P59240 Tex29-204ENSMUST00000166638 561 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Nphp4P59240 Platr17-201ENSMUST00000172817 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nphp4P59240 Cdhr4-211ENSMUST00000177173 2480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Nphp4P59240 Clec10a-209ENSMUST00000178945 2332 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nphp4P59240 Gm16894-201ENSMUST00000181756 842 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nphp4P59240 Uba52-ps-201ENSMUST00000183770 379 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Nphp4P59240 Plet1os-202ENSMUST00000190941 1119 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nphp4P59240 Gm38313-201ENSMUST00000191953 1266 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Nphp4P59240 Gm1000-202ENSMUST00000222329 757 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Nphp4P59240 Extl3-203ENSMUST00000225633 6013 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Nphp4P59240 Maats1-201ENSMUST00000023501 2750 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nphp4P59240 Gfm2-202ENSMUST00000042084 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nphp4P59240 Olfr1313-201ENSMUST00000099599 938 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Nphp4P59240 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nphp4P59240 Tcirg1-204ENSMUST00000126070 3041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Nphp4P59240 Zw10-201ENSMUST00000034803 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Nphp4P59240 Cdh7-202ENSMUST00000112701 4945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Nphp4P59240 Tspan2-201ENSMUST00000029451 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Nphp4P59240 Cfi-201ENSMUST00000077918 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Nphp4P59240 Gab3-202ENSMUST00000114104 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Nphp4P59240 Prkar1a-201ENSMUST00000049527 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Nphp4P59240 Tunar-201ENSMUST00000180458 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Nphp4P59240 Olfr658-202ENSMUST00000210641 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nphp4P59240 Olfr658-201ENSMUST00000089296 2912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nphp4P59240 Pnpla6-211ENSMUST00000207941 4263 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nphp4P59240 Gm12461-201ENSMUST00000120231 1239 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Nphp4P59240 Marcksl1-ps4-201ENSMUST00000132531 291 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Nphp4P59240 Gm11981-201ENSMUST00000139769 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nphp4P59240 Platr20-202ENSMUST00000143209 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nphp4P59240 Gm25872-201ENSMUST00000177784 100 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Nphp4P59240 9530085P06Rik-201ENSMUST00000182121 827 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Nphp4P59240 Gm3289-201ENSMUST00000200819 756 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nphp4P59240 Gm45542-201ENSMUST00000210456 438 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Nphp4P59240 Gm18001-201ENSMUST00000212023 688 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Nphp4P59240 Gm19640-201ENSMUST00000214849 464 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Nphp4P59240 AC154806.7-201ENSMUST00000227998 202 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Nphp4P59240 Rnasek-201ENSMUST00000040428 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nphp4P59240 Mgat1-203ENSMUST00000109194 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nphp4P59240 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nphp4P59240 Ncoa7-201ENSMUST00000068567 5105 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Nphp4P59240 Evl-204ENSMUST00000172409 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nphp4P59240 Gm36995-201ENSMUST00000126170 5727 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Nphp4P59240 Cd247-205ENSMUST00000161559 1816 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nphp4P59240 Il4ra-201ENSMUST00000033004 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nphp4P59240 Vangl1-208ENSMUST00000168312 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nphp4P59240 Dab2ip-209ENSMUST00000135741 4128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nphp4P59240 Krt34-201ENSMUST00000056362 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nphp4P59240 6030443J06Rik-201ENSMUST00000181209 2380 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nphp4P59240 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nphp4P59240 Fcgr2b-204ENSMUST00000159969 1578 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nphp4P59240 Ttc7-202ENSMUST00000125875 3917 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Nphp4P59240 Runx1t1-204ENSMUST00000105566 6090 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Nphp4P59240 A930006I01Rik-201ENSMUST00000139065 2229 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nphp4P59240 Triml2-201ENSMUST00000163869 1467 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Nphp4P59240 Sh3gl2-201ENSMUST00000030212 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nphp4P59240 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Nphp4P59240 Vmn1r45-201ENSMUST00000054202 3341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nphp4P59240 Tmtc3-201ENSMUST00000058154 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nphp4P59240 Gm7538-201ENSMUST00000200918 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nphp4P59240 Pdzk1ip1-202ENSMUST00000106548 887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nphp4P59240 Gm8659-201ENSMUST00000120024 1084 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Nphp4P59240 Gm15287-201ENSMUST00000132564 751 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Nphp4P59240 Mir432-201ENSMUST00000157230 75 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Nphp4P59240 Fcgr2b-203ENSMUST00000159688 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nphp4P59240 Gm17019-201ENSMUST00000167908 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nphp4P59240 Gm27211-201ENSMUST00000183507 631 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.2 ms