Protein–RNA interactions for Protein: P56389

Cda, Cytidine deaminase, mousemouse

Predictions only

Length 146 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CdaP56389 Arid3b-204ENSMUST00000164010 1259 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
CdaP56389 Fkbp2-202ENSMUST00000177752 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
CdaP56389 Gm7741-201ENSMUST00000181445 989 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
CdaP56389 Gm17087-201ENSMUST00000184183 471 ntAPPRIS P1 BASIC10.03□□□□□ -0.8
CdaP56389 Gm43349-201ENSMUST00000200047 503 ntTSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
CdaP56389 Gm42867-201ENSMUST00000202995 469 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
CdaP56389 Gm45441-202ENSMUST00000209301 1235 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
CdaP56389 Mpzl2-205ENSMUST00000217097 1175 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
CdaP56389 5830428M24Rik-201ENSMUST00000221805 825 ntTSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
CdaP56389 CT573034.1-201ENSMUST00000222983 313 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
CdaP56389 AC156501.1-201ENSMUST00000228219 270 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
CdaP56389 AC135114.1-201ENSMUST00000228682 270 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
CdaP56389 Dnajc17-201ENSMUST00000038439 1008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
CdaP56389 Ipo4-201ENSMUST00000047131 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
CdaP56389 Abhd14a-201ENSMUST00000048685 1256 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
CdaP56389 Agrp-201ENSMUST00000005849 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
CdaP56389 Cdkl2-201ENSMUST00000069937 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
CdaP56389 Olfr311-201ENSMUST00000071625 927 ntAPPRIS P1 BASIC10.03□□□□□ -0.8
CdaP56389 Zfp932-201ENSMUST00000099484 451 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
CdaP56389 Atg9a-205ENSMUST00000188347 4041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
CdaP56389 Nxpe5-203ENSMUST00000159964 3585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
CdaP56389 Lsamp-201ENSMUST00000078873 2951 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
CdaP56389 Ehd2-201ENSMUST00000098799 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
CdaP56389 Slc37a4-201ENSMUST00000165839 2086 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
CdaP56389 Dnmbp-206ENSMUST00000212592 3901 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
CdaP56389 Gm5833-202ENSMUST00000190707 1932 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
CdaP56389 Gm10681-202ENSMUST00000178221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
CdaP56389 Sdc1-201ENSMUST00000020911 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
CdaP56389 Pdp2-201ENSMUST00000059588 5692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
CdaP56389 Vwa7-202ENSMUST00000172499 3970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
CdaP56389 Lrba-202ENSMUST00000192145 8843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
CdaP56389 Piezo2-202ENSMUST00000047480 10724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
CdaP56389 C030037D09Rik-203ENSMUST00000138007 3220 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
CdaP56389 Rasal1-201ENSMUST00000031606 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
CdaP56389 Ncor2-202ENSMUST00000086083 8575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
CdaP56389 Myh1-203ENSMUST00000124516 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
CdaP56389 Gm13561-201ENSMUST00000136879 1826 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
CdaP56389 Dph7-201ENSMUST00000028351 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
CdaP56389 Clrn1-203ENSMUST00000072551 1662 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
CdaP56389 Mobp-202ENSMUST00000093773 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
CdaP56389 Gm43937-201ENSMUST00000204640 3122 ntBASIC10.02□□□□□ -0.8
CdaP56389 Tsc2-201ENSMUST00000097373 6018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
CdaP56389 Ppp1r16b-203ENSMUST00000103116 6370 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.8
CdaP56389 Git1-202ENSMUST00000100812 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.8
CdaP56389 Gm6580-201ENSMUST00000117504 1357 ntBASIC10.02□□□□□ -0.8
CdaP56389 Gm6903-201ENSMUST00000160509 1366 ntBASIC10.02□□□□□ -0.8
CdaP56389 Zfp30-202ENSMUST00000122387 3342 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
CdaP56389 Zfp410-215ENSMUST00000222832 1859 ntTSL 2 BASIC10.02□□□□□ -0.8
CdaP56389 CT009489.1-201ENSMUST00000227740 1893 ntBASIC10.02□□□□□ -0.8
CdaP56389 Tat-201ENSMUST00000001720 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
CdaP56389 Ptp4a3-203ENSMUST00000165541 3539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.8
CdaP56389 Pcsk9-201ENSMUST00000049507 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
CdaP56389 Pigb-206ENSMUST00000184035 3221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
CdaP56389 Scn10a-204ENSMUST00000214408 5877 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
CdaP56389 Notch2-201ENSMUST00000079812 10500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
CdaP56389 Mknk1-202ENSMUST00000106513 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
CdaP56389 Tiam1-203ENSMUST00000114122 4596 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
CdaP56389 Ncstn-201ENSMUST00000003550 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
CdaP56389 Tyro3-202ENSMUST00000110783 4460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
CdaP56389 Atxn7l1-204ENSMUST00000125192 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
CdaP56389 Prkcd-201ENSMUST00000022521 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
CdaP56389 Tmem88b-201ENSMUST00000097742 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
CdaP56389 Gm5795-201ENSMUST00000100920 984 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
CdaP56389 Snord17-201ENSMUST00000104526 238 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
CdaP56389 Gm14193-201ENSMUST00000105067 153 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
CdaP56389 Gm11568-201ENSMUST00000107434 1145 ntAPPRIS P1 BASIC10.02□□□□□ -0.81
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CdaP56389 Timm22-202ENSMUST00000120699 746 ntTSL 3 BASIC10.02□□□□□ -0.81
CdaP56389 C8g-201ENSMUST00000015227 822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
CdaP56389 Gzmc-201ENSMUST00000015585 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
CdaP56389 Gm3685-201ENSMUST00000169215 984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
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CdaP56389 Uba52-ps-201ENSMUST00000183770 379 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
CdaP56389 Gm29187-201ENSMUST00000186681 689 ntTSL 3 BASIC10.02□□□□□ -0.81
CdaP56389 Gm44506-201ENSMUST00000206278 965 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
CdaP56389 Pgam2-201ENSMUST00000020768 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
CdaP56389 Gm40983-201ENSMUST00000222524 502 ntTSL 3 BASIC10.02□□□□□ -0.81
CdaP56389 CT009713.8-201ENSMUST00000225448 560 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
CdaP56389 Immp1l-201ENSMUST00000037499 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
CdaP56389 Prorsd1-201ENSMUST00000039900 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
CdaP56389 Cryba2-201ENSMUST00000006721 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
CdaP56389 Fxyd1-202ENSMUST00000071697 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.02□□□□□ -0.81
CdaP56389 Gm10338-201ENSMUST00000096148 984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.02□□□□□ -0.81
CdaP56389 Rnf20-201ENSMUST00000029989 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
CdaP56389 Jaml-201ENSMUST00000050020 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
CdaP56389 Tnxb-201ENSMUST00000087399 12209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
CdaP56389 Timm22-201ENSMUST00000021203 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
CdaP56389 Atp1a2-202ENSMUST00000097464 3186 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
CdaP56389 Bco1-203ENSMUST00000176860 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
CdaP56389 Gp2-201ENSMUST00000033255 1993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
CdaP56389 Oxct1-201ENSMUST00000110690 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
CdaP56389 Arvcf-203ENSMUST00000115612 4218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
CdaP56389 Ttll13-201ENSMUST00000058266 3010 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
CdaP56389 Phc1-204ENSMUST00000159252 3744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
CdaP56389 Lrrn4-201ENSMUST00000049787 3715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
CdaP56389 Cct3-204ENSMUST00000164166 1804 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
CdaP56389 Gm10848-201ENSMUST00000192361 1811 ntTSL 2 BASIC10.02□□□□□ -0.81
CdaP56389 Vgll4-201ENSMUST00000032459 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
CdaP56389 Hpgd-201ENSMUST00000034026 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
CdaP56389 Rabl2-202ENSMUST00000094056 1322 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
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